上面这个段代码要在这里说明一下第2行,不用变 第3行,anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR590/SRR5907429/SRR5907429.sra标黄的部分需要根据sra文件名字更改,前六位很重要,想必大家看标注应该可以注意到了。第4行,是下载的目标文件夹,“./”的意思是下载到当前文件夹。 2、下载提示链接不正确怎么办?NCBI最近更改了公共下载的用户名和链接,就是anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov这个地方现在这个命令是可以下载的,这是在ncbi官网说明文件中获得的,以后有更新站长会及时发布。3、下载速度不够100M/s怎么吧?站长,一直使用的国内的网。云服务器和本地服务都使用过。云服务器选择按宽带计费1M或者2M,速度可以达到30-50M/s,增加带宽也无法上调,不过这个速度也是可以接受的。本地服务器是家用的电信100M宽带,单连速度80-90M/s。本地使用这里需要注意的是:1)路由器。路由器站长选的是小米路由器pro(不带硬盘的),高速下载查看路由器cpu一直都是100%,并且路由器是过热状态。这样会导致,路由器自我保护重启。所以高速下载的时候一直开着空调降温,还能好一些。2)公网IP。一般家庭宽带接的是住宅楼总路由,不是公网IP。之前没有获得外网IP的时候速度会打折。联系电信更改公网IP以后才达到的80-90M/s的速度。 3)下载之前一定要计算好储存空间。一般下载都是去批量下载,下载完解压以后的文件是很大的,一般是3-4倍。如果空间不足程序会自动停止。不过ascp支持断点续传,在同一文件夹下载会接着上次的继续下载。 关于自己购买和配置服务器大家可以参考站长之前写的一个攻略;20k搞定生信服务器购买、安装与配置攻略~ One More Thing…… 1、站长翻看之前写过的教程,有很多需要更新的。以后会出一些一年以来的使用心得和Q&A,也算是帮助自己和大家总结一下。2、小站工具TCGA模块打算开放十个肿瘤。想与大家做个互动。扫描下面二维码选择自己感兴趣的十个肿瘤,站长会根据结果统计开放前十位的肿瘤类别。