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mac查看切片扫描文件利器,Qupath

mac查看切片扫描文件利器,Qupath

大多数染色切片扫描查看的软件都是在Win系统上进行运行的,这就让很多Mac用户头疼不已。而Qupath作为一款开源免费的软件,可以在mac电脑上完美运行,今天就带大家了解一下如何在mac上配置Qupath软件
使用Qupath的原因:
1. 免费开源
2. 可以打开市面上大多数格式的扫描文件
3. 对组化等染色结果进行分析(染色强度、阳性细胞比例,染色打分等等),避免人为主观判断的影响。
首先登录Qupath官网下载MacOS对应的版本,进行安装。这些步骤都十分简单,但是在使用过程中会发现,有些格式的文件打开后扫描结果模糊不清,比如以mrxs结尾的文件。所以我们还需要下载另一个支持软件–openslide(https://openslide.org/)
点击上图中的Download后,进入下面这个界面,点击最新版的链接进行下载,然后解压至你想保存这个文件的地方,并记住这个路径。
然后进入Qupath软件,点击Edit中的Preferences,找到openslide选的选项,选择刚才Opendlide的保存路径,直接关闭这个界面即可。然后就可以打开mrxs结尾的文件了!如果还是模糊的,可以尝试退出软件后重新进入。
Qupath除了可以查看扫面文件外,还可以进行众多的图像信息分析,大家可以参考网上很多优秀的教程~
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