夜雨聆风
Cytoscape软件下载、安装、插件学习[基础教程]
「一边学习，一边总结，一边分享！」由于微信改版，一直有同学存在长时间接收不到公众号的推文。那么请跟随以下步骤，将「小杜的生信筆記」设置为「星标」，不错过每一条推文教程。
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写在前面
今天分享的内容是自己遇到问题后，咨询社群里面的同学，帮忙解决的总结。
关于Cytoscape，对于做组学或生物信息学的同学基本是陌生的，可能有的同学用这个软件作图是非常溜的，做出来的网络图也是十分的好看，“可玩性”很高，就像前面分享的aPEAR包一样aPEAR包绘制功能富集网络图。自己在前面写论文的时候也是一直在使用，以前使用的版本是3.3.0的版本。但是，时间一长，很多操作都忘记。今天，在自己的台式机上使用Cytoscape软件，想要安装插件，但是发现3.3.0这个版本安装不了。随后，在社群咨询，各位同学也给出目前各自正常使用的版本。我们也就此机会，记录一下，分享一下。
「注意：考虑到Cytoscape安装包下载，需要开
梯子，我们这里已经下载好了对应的包，大家可以回复关键词获得链接。」
「后台回复关键词：」
20231129或Cytoscape即可获得下载链接
一、Cytoscape下载网址
https://cytoscape.org/
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下载最新版本 
由于最新版本，有同学反应无法下载插件，我们在这里就不安装最新的版本。 -
下载 Old Version 
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下载对应的版本 
我们在这里一共下载了3.8.0-3.9.1的版本.
4.下载对应的版本
「注意：考虑到Cytoscape安装包下载，需要开梯子，我们这里已经下载好了对应的包，大家可以回复关键词获得链接。」
二、安装软件
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点击安装包 
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下载JAVA（若你没下载Java，可点击直接下载。PS：自己开了VPN后，下载速度还是很快的） 
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依次点击 Netx进行安装
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安装位置，任何软件不建议安装在 C盘
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安装成功 
三、安装插件
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打开Cytoscape软件 
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点击 Apps–App manager
目前，Cytoscape中总的有252个插件 -
搜索自己需要安装的插件名称 
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点击安装 
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安装结束后，可以在 Apps进行管理和查看
PS：若你开了梯子下载速度会更快些，不开也不影响，只是速度相对慢一点而已。
插件操作学习
对于初学者，我们这里借用SCIPainter(基迪奥)中莫北老师的教程进行操作，对于初学者很是的友好.网络图分析工具Cytoscape快速上手
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导入数据 
2. 调整
3， 导出数据
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