Excel/WPS 也能生成“高大上”热图!
Heatmap(热图)是生物信息学中组学数据分析的常用图形,也是多组学研究中最核心、最常用的结果呈现方式之一。其凭借丰富的色彩变化与生动直观的信息呈现能力,被广泛应用于转录组、基因组、微生物组等各类大数据分析场景。但是,通过R、Python等脚本语言绘制热图存在代码调试、参数优化的门槛,那么如何降低门槛,提高效率?


其实,热图也可以利用Excel或WPS这类常用办公软件进行绘制,对于习惯使用表格工具的用户而言更加便捷。今天,小编就和大家分享下如何用这两款软件绘制热图。

以WPS为例
WPS堪称“国产办公软件之光”,其AI转型速度令人瞩目。说不定,我们动动嘴就能让热图一键生成,有兴趣的同鞋也可以试试自然言AI画热图,能不能复现。考虑到大家更常用它,下面就先分享WPS的绘制攻略。
首先,选择云平台的示例数据,按图中123标记的顺序,选择需要上色的部分——>选择条件格式——>选择管理规则或者新建规则。

然后,按abc标记的位置进行选择处理,选择基于各自值设置所有单元格的格式-格式样式里选择三色刻度,点击确定,漂亮热图的配色就有了。如果需要,可以把f位置截图用做图例。


当然用自然语言描述现在也可以实现AI条件格式啦。

接下来,设置去除下单元格里的数字,鼠标右键–设置单元格格式,如图中箭头所示选择自定义— “;;;”(复制引号里面的粘贴下)


点击确定后,数字就神奇的消失了。

接下来,调整下单元格的宽度,可以手动调整,也可以右键–最合适的列宽


是不是就有点热图的样子啦。
如果需要,还可以给每个单元格加上边框,这样区分更明显些。鼠标右键–设置单元格格式—边框。然后把第一列调到合适宽度,右对齐,再设置下所需要的字体。


选择文件-打印就可以获得pdf格式的文件了,然后去演示文稿或Adobe illustrator就可以进一步修改美化了。如果需要差异检验,就用数据检验下,再标记上就可以啦。
Excel的操作基本上也是大同小异的,差异在于比如热图每个格的宽度暂时没办法自动调整。
有了热图,我们就可以组合在其他图上,让图更加高大上啦!比如,和代谢通路图组合,和示意图的组合等等。

凌波微课云平台(http://www.cloud.biomicroclass.com/CloudPlatform/SoftPage/Heatmap)也提供了在线热图绘制工具,0基础入手,支持对行或列进行聚类分析、提供多种数据归一化方法等功能,满足用户多样化的作图需求。
参考文献
Qian, L., Yu, X., Gu, H. et al. Vertically stratified methane, nitrogen and sulphur cycling and coupling mechanisms in mangrove sediment microbiomes. Microbiome 11, 71 (2023). https://doi.org/10.1186/s40168-023-01501-5



凌波微课的讲师们,实战经验丰富,旨在通过在线微课程及线下交流,帮助科研学生及科研工作者们由简入繁,掌握科研思路及生信分析的实际操作。倾心打造的高通量测序数据分析平台——凌波微课·云平台(http://www.cloud.biomicroclass.com/CloudPlatform/home),无需命令行,零基础玩转数据分析。凌波微课,用心服务科研用户,打造专业教育品牌,助力科研提升。

关注我
发现更多精彩
关注凌波微课公众号,回复“入群”,即可加入凌波微课课下交流群,更多干货等你呦!
夜雨聆风
