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【海关公告】海关总署调整交通运输工具进出境卫生检疫证书,4月1日起正式实施!
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重磅解读｜海关总署调整交通运输工具进出境卫生检疫证书，4月1日起正式实施！
为落实党中央、国务院决策部署，进一步优化口岸营商环境，提升跨境贸易便利化水平，海关总署近期发布《海关总署关于调整交通运输工具进出境卫生检疫证书有关事项的公告》（以下简称《公告》），对交通运输工具进出境卫生检疫证书进行优化整合，同步推广电子证书，相关措施自2026年4月1日起正式施行。
此次政策调整聚焦企业办事痛点、简化流程、提升效率，涉及船舶、航空器等各类交通运输工具，与跨境运输运营企业、代理机构密切相关。今天，我们就用通俗语言拆解政策核心要点，帮大家快速读懂、精准适配！
此次政策最关键的变化，是对原有11种交通运输工具进出境卫生检疫证书进行优化整合，大幅减少证书种类，避免企业重复申报、多证办理的麻烦，具体整合情况如下：
（一）整合进出境卫生检疫证书（4种）
将原《船舶入境卫生检疫证》《船舶入境检疫证》《交通工具出境卫生检疫证书》《运输工具检疫证书》《船舶出港卫生检疫证书》《船舶进港检疫证书》《船舶进港卫生检疫证书》《航空器出港卫生检疫证书》《航空器进港检疫证书》《航空器进港卫生检疫证书》10种证书，整合为4种核心证书，覆盖所有交通运输工具进出境场景：
- 《交通运输工具进境卫生检疫证书》：
适用于海关对所有进境交通运输工具实施卫生检疫后签发； - 《交通运输工具出境卫生检疫证书》：
适用于海关对所有出境交通运输工具实施卫生检疫后签发； - 《海峡两岸直航交通运输工具进港卫生检疫证书》：
专门针对进港的海峡两岸直航交通运输工具，实施卫生检疫后签发； - 《海峡两岸直航交通运输工具出港卫生检疫证书》：
专门针对出港的海峡两岸直航交通运输工具，实施卫生检疫后签发。
（二）拆分船舶卫生相关证书（2种）
将原《船舶免予卫生控制措施证书/船舶卫生控制措施证书》1种证书，拆分为2种独立证书，适配不同船舶卫生检查结果，分类更清晰：
- 《船舶免予卫生控制措施证书》：
海关对船舶实施卫生检查后，未发现感染或污染证据，免于实施卫生控制措施时签发； - 《船舶卫生控制措施证书》：
海关对船舶实施卫生检查后，发现感染或污染证据，需实施卫生控制措施时签发。
提示：原11种证书自2026年4月1日起同步废止；《公告》施行前已签发且仍在有效期内的原《船舶免予卫生控制措施证书/船舶卫生控制措施证书》，可继续使用至有效期届满。
此次政策除了整合证书种类，还推出了多项便利化举措，重点优化办理流程、提升办理效率，切实为企业减负：
1.电子证书可自助下载，无需现场跑办
船舶、航空器运营人或其代理人，可通过国际贸易“单一窗口”或海关政务服务平台（online.customs.gov.cn），自助下载交通运输工具进出境卫生检疫证书电子版本；办理船舶卫生证书时，也可通过上述两个渠道申请并自助下载电子证书，无需到海关现场领取，节省时间成本。
2.电子证书与纸质证书同等有效，使用无门槛
《公告》明确，交通运输工具进出境卫生检疫证书、船舶卫生证书的纸质证书和电子证书具有同等法律效力，企业可根据实际需求，选择使用电子证书或纸质证书，无需担心电子证书不被认可的问题，进一步简化通关流程。
3.特殊情况可线下办理，兼顾灵活性
若遇到国际贸易“单一窗口”或海关政务服务平台暂时无法使用的情况，船舶运营人或代理人可通过线下提交纸质申请书，申请办理《船舶免予卫生控制措施证书》或《船舶卫生控制措施证书》，海关完成现场检查后，会现场签发纸质证书，保障业务正常开展。
4.操作手册可自助查询，快速上手
船舶运营/代理企业若不熟悉电子证书办理流程，可点击国际贸易“单一窗口”门户首页的“新用户指引”，在“用户手册”页面搜索“船舶”，自行下载操作手册，对照手册即可完成线上办理，无需额外咨询。
此次调整是海关总署贯彻落实优化口岸营商环境、提升跨境贸易便利化水平的重要举措，核心意义在于“减证、便民、高效”：
一方面，通过整合证书种类，减少企业申报材料和办理环节，降低企业时间成本和人力成本，解决以往证书种类过多、办理流程繁琐的痛点；另一方面，推广电子证书、实现线上自助办理，打破线下办理的时空限制，提升通关效率，助力跨境交通运输行业高质量发展。
同时，政策调整严格遵循《中华人民共和国国境卫生检疫法》等上位法要求，在简化流程的同时，始终坚守国门卫生安全底线，防范传染病跨境传播，统筹保障公共卫生安全与跨境贸易便利。
- 实施时间：《公告》自2026年4月1日起正式施行，原11种证书同步废止；
- 过渡期安排：2026年4月1日前已签发且在有效期内的原《船舶免予卫生控制措施证书/船舶卫生控制措施证书》，仍可正常使用，无需重新办理；
- 办理渠道：优先通过国际贸易“单一窗口”或海关政务服务平台线上办理，特殊情况可线下申请；
- 咨询途径：若在办理过程中遇到疑问，可联系当地海关相关部门，或查阅海关总署官网发布的《公告》原文及政策解读，获取详细指引。
此次交通运输工具进出境卫生检疫证书调整，是海关总署持续优化营商环境、提升服务效能的具体体现，将切实为跨境运输企业减负增效。建议相关企业提前熟悉政策调整内容，做好业务衔接，确保2026年4月1日政策实施后，顺利开展相关业务。
后续我们将持续关注海关相关政策动态，及时为大家解读最新举措，助力企业合规高效通关～
来源：中华人民共和国海关总署
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