
一、论文基本信息
论文标题:Development of a novel combined nomogram model integrating deep learning-pathomics, radiomics and immunoscore to predict postoperative outcome of colorectal cancer lung metastasis patients
发表期刊:Journal of Hematology & Oncology(JCR Q1,血液肿瘤领域权威期刊)
发表时间:2022年
DOI:10.1186/s13045-022-01225-3
研究类型:单中心回顾性研究,整合深度学习病理组学、影像组学、免疫评分与临床因素的多组学预后研究
核心目的:构建整合机器学习病理组学、影像组学特征、免疫评分(Immunoscore)及临床因素的列线图模型,预测结直肠癌(CRC)肺转移患者术后总生存期(OS)和无病生存期(DFS),为患者风险分层及个体化治疗方案制定提供依据。
研究数据:共纳入103例仅发生肺转移且接受根治性肺切除术的CRC患者;所有患者均有H&E染色病理全切片、影像学检查资料及完整临床随访数据(随访至患者死亡或研究截止);采用弱监督方式进行切片层面卷积神经网络训练,结合CD3+、CD8+细胞密度计算免疫评分。
核心结论:成功构建病理组学和影像组学签名,两者均与免疫评分呈负相关,且三者均为OS和DFS预测的独立预后因素;整合四者的联合列线图模型效能最优,预测OS的AUC=0.860,预测DFS的AUC=0.875,校准曲线和决策曲线分析证实其具有良好的临床实用性,显著优于单一预测指标。
二、OnekeyAI免代码影像组学在本研究中的应用介绍
本研究核心在于整合病理组学、影像组学、免疫评分与临床因素构建预后预测模型,全流程从病理/影像预处理、特征提取、筛选、建模到效能验证,均依托OnekeyAI免代码影像组学平台自动化完成,无需编写代码、无需手动调试算法,完美适配多组学整合研究需求,以下为功能对应介绍与论文配图说明。
一、研究整体流程(对应论文 Figure 1a、Figure 2)
OnekeyAI实现零代码全流程复现:病理全切片/影像学影像导入→标准化预处理→病理组学/影像组学特征提取→SMOTE样本平衡→特征筛选→免疫评分计算→多模型构建→列线图融合→ROC/校准曲线/DCA多维度效能验证。

✅ 插入图片:Figure 1a 联合预测模型示意图

✅ 插入图片:Figure 2 模型效能评估相关图表(ROC、校准曲线、DCA曲线)
二、OnekeyAI各项功能在论文中的具体使用
1. 病理全切片与影像学影像标准化预处理
使用模块:OnekeyAI — 数字病理+影像标准化预处理模块
平台同步完成两类影像的标准化处理,贴合论文实验流程:针对H&E染色病理全切片,自动完成分辨率统一、去模糊、去背景、去噪声处理,剔除低质量区域,保障切片清晰度;针对影像学影像,自动进行灰度归一化、伪影去除,统一扫描参数带来的系统误差,为后续特征提取奠定稳定数据基础,全程无需手动调整参数。
2. 病理组学特征提取与签名构建
使用模块:OnekeyAI — 深度学习病理组学模块(WSISA框架)
平台内置论文所用的全切片组织病理学影像生存分析框架(WSISA),采用弱监督方式进行切片层面卷积神经网络训练,自动从H&E染色病理全切片中提取特征,最终筛选出5个全切片特征,构建病理组学预后模型,可自动区分生存结局较差的患者(OS预测HR=8.09,DFS预测HR=2.51),与论文补充材料Figure S1结果完全契合。
✅ 插入图片:Additional file 2: Figure S1 基于病理组学亚型的OS(a)和DFS(b)Kaplan-Meier生存曲线
3. 影像组学特征提取、筛选与签名构建
使用模块:OnekeyAI — 影像组学特征提取与筛选流水线模块
平台按论文流程自动完成影像组学全流程操作:一键提取影像学影像高通量特征,采用合成少数类过采样技术(SMOTE)处理样本不平衡问题,结合支持向量机(SVM)分类器筛选特征,最终确定8个核心特征,分别构建OS和DFS预测的影像组学签名;自动设定50%预测分数为阈值,将患者分为高低风险亚型,两组患者DFS和OS存在显著差异(均P<0.001),与论文补充材料Figure S2、Figure S3完全一致。
✅ 插入图片:Additional file 2: Figure S2 影像组学模型中筛选出的特征箱线图(DFS预测a、OS预测b)
✅ 插入图片:Additional file 2: Figure S3 基于影像组学亚型的DFS(a)和OS(b)Kaplan-Meier生存曲线
4. 免疫评分(Immunoscore)计算与分析
使用模块:OnekeyAI — 免疫细胞密度分析与免疫评分模块
平台支持自动量化分析病理切片中CD3+、CD8+细胞密度,按论文标准计算免疫评分:评估转移瘤侵袭边缘和中心区域的CD3+、CD8+细胞密度,以75百分位为阈值,将患者分为高免疫评分组(20.4%)和低免疫评分组;自动分析免疫评分与患者生存的关联,证实高免疫评分患者具有更优的DFS和OS,同时验证免疫评分与病理组学/影像组学评分的负相关关系,与论文补充材料Figure S4、Figure S5、Figure S6完全对应。
✅ 插入图片:Additional file 2: Figure S4 CRC肺转移患者免疫评分的百分位分布图
✅ 插入图片:Additional file 2: Figure S5 基于免疫评分的OS(a)和DFS(b)Kaplan-Meier生存曲线
✅ 插入图片:Additional file 2: Figure S6 高低免疫评分组病理组学/影像组学评分对比及分布关联图
5. 临床数据统计与多因素分析
使用模块:OnekeyAI — 临床数据统计与多因素Cox分析模块
平台自动导入患者临床资料(性别、肿瘤部位等),自动完成组间差异检验和多因素Cox回归分析:分类变量采用卡方检验,连续变量采用相应的参数/非参数检验;通过多因素分析调整临床病理变量后,证实病理组学签名、影像组学签名、免疫评分均为OS和DFS预测的独立预后因素,自动生成顶刊标准统计表格,与论文补充材料Table S1、Table S3格式、数据完全匹配。
✅ 插入图片:Additional file 3: Table S1 CRC肺转移患者的临床病理特征表
✅ 插入图片:Additional file 3: Table S3 OS和DFS的多因素Cox分析表
6. 多因素联合列线图构建与可视化
使用模块:OnekeyAI — 多组学融合列线图模块
平台基于多因素Cox分析结果,一键构建两类联合列线图模型:OS预测列线图整合性别、免疫评分、病理组学签名、影像组学签名;DFS预测列线图额外纳入肿瘤部位这一独立预后因素;列线图清晰展示各预测因子的权重及评分标准,支持临床医师快速量化评估患者术后OS和DFS风险,图表格式规范可直接用于论文发表,完美复刻论文Figure 1b、Figure 1c样式。
✅ 插入图片:Figure 1b 用于OS预测的联合列线图
✅ 插入图片:Figure 1c 用于DFS预测的联合列线图
7. 模型多维度效能评估与可视化
使用模块:OnekeyAI — 模型效能全面评估模块
平台自动完成模型效能验证,生成全套论文所需可视化图表:绘制各模型(联合列线图、病理组学签名、影像组学签名、免疫评分)的ROC曲线,计算AUC值(OS预测AUC=0.860,DFS预测AUC=0.875),对比各模型效能差异;生成校准曲线,验证列线图预测值与实际值的一致性;开展决策曲线分析(DCA),量化联合列线图的临床净获益,证实其临床实用性优于单一预测指标,与论文Figure 2a-f完全契合。
✅ 插入图片:Figure 2a OS预测各模型ROC曲线
✅ 插入图片:Figure 2b DFS预测各模型ROC曲线
✅ 插入图片:Figure 2c OS预测列线图校准曲线
✅ 插入图片:Figure 2d DFS预测列线图校准曲线
✅ 插入图片:Figure 2e OS预测各模型DCA曲线
✅ 插入图片:Figure 2f DFS预测各模型DCA曲线
三、OnekeyAI功能—论文步骤对应总表
论文核心步骤 | OnekeyAI对应功能模块 |
病理全切片与影像学影像标准化预处理 | 数字病理+影像标准化预处理模块 |
WSISA框架病理组学特征提取与签名构建 | 深度学习病理组学模块(WSISA框架) |
影像组学特征提取、SMOTE平衡与SVM筛选 | 影像组学特征提取与筛选流水线模块 |
CD3+/CD8+细胞密度分析与免疫评分计算 | 免疫细胞密度分析与免疫评分模块 |
临床数据统计与多因素Cox回归分析 | 临床数据统计与多因素Cox分析模块 |
OS/DFS预测联合列线图构建与可视化 | 多组学融合列线图模块 |
ROC/校准曲线/DCA模型效能评估与可视化 | 模型效能全面评估模块 |
四、总结
本研究聚焦结直肠癌肺转移患者术后预后预测这一临床痛点,通过多组学整合构建高效预测模型,而OnekeyAI免代码影像组学平台实现了从影像预处理、特征提取、筛选、免疫评分计算,到多模型构建、列线图融合及全维度效能验证的全流程自动化操作,无需编写代码、无需手动处理高维数据。
平台各项功能与论文研究步骤高度契合,自动生成论文所需的生存曲线、特征箱线图、统计表格、列线图及效能评估图表,所有成果均可直接用于期刊发表,大幅缩短科研周期。最终助力研究构建出效能优异的联合列线图模型,为结直肠癌肺转移患者的风险分层和个体化治疗提供了可靠工具,充分印证了OnekeyAI在多组学整合预后研究中的专业性与实用性,是临床科研人员开展肿瘤预后研究的高效助力。
OnekeyAI相关资源
视频课程、安装包与高分文献合集
百度网盘链接:https://pan.baidu.com/s/5cCMp3behGIUXOVUoJFc2-w

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