
武汉研锦生物(YanGeneBio)是一家专注于药物靶点发现与小核酸药物(siRNA/ASO )设计、修饰、合成,以及类器官、细胞和动物模型上筛选功能活性小核酸的创新型CRO 技术服务公司,为新药研发、中药现代化及天然产物研究,小核酸药物开发转化提供从靶点发现到机制验证的一站式解决方案。
我们整合ABPP、TPP、Lip-MS等药物钓靶技术,交联质谱、Lip-MS+分子对接鉴定药靶互作位点技术,SPR/MST/BLI/ITC/DSF检测药靶亲和力平台,蛋白芯片、Olink 多因子等高通量筛选检测平台,小核酸药物设计、合成与类器官筛药等核心技术,为客户提供高精度的化合物靶点鉴定、结合位点分析、亲和力验证及功能验证服务。
研锦生物以 “精准药靶发现、加速小核酸药物转化” 为使命,凭借严格的实验设计、高质量的数据输出和快速的项目交付,助力全球科研与药企客户缩短研发周期、提升药物发现成功率。
本技术体系整合限制性蛋白水解质谱(LiP-MS)、AI虚拟筛选与分子互作检测(SPR/MST),构建“靶点筛选-精准验证-机制解析”全流程药物靶标挖掘方案,突破传统药物筛选效率低、靶点验证难、机制不清晰的技术瓶颈。
LiP-MS基于药物结合蛋白后构象稳定性改变的特性,通过限制性蛋白酶水解,对比药物处理组与对照组肽段丰度、水解位点差异,直接捕获细胞内药物作用靶蛋白;AI虚拟筛选依托深度学习算法,深度整合蛋白结构、配体化学相似性数据,快速预测潜在作用靶点,大幅缩小筛选范围;SPR(表面等离子共振)与MST(微量热泳动)技术从生物物理层面,实时定量检测药物与靶蛋白的结合动力学、亲和力,精准验证分子互作特异性,为靶标确认提供硬核数据支撑。
二、标准化实验流程
1.化合物高通量初筛:选取FDA批准药物库、天然产物库化合物,梯度浓度处理疾病细胞系,通过细胞活性检测筛选具有显著抑制作用的候选化合物,锁定研究对象。
2.LiP-MS靶点初筛:提取细胞全蛋白,设置药物处理组与对照组,经限制性蛋白水解、高分辨质谱检测,筛选差异表达蛋白,确定核心候选靶蛋白。
3.AI虚拟靶点预测:通过AI靶点预测算法,模拟药物与蛋白结合潜能,输出排名靠前的潜在靶点,与LiP-MS结果取交集,锁定唯一核心靶标。
4.分子互作定量验证:采用SPR技术将靶蛋白固定于芯片表面,检测药物浓度梯度与蛋白的结合解离信号;同步通过MST技术标记靶蛋白,分析药物-蛋白结合热泳动变化,双向验证结合亲和力。
5.分子机制解析:借助分子对接、分子动力学模拟,预测药物与蛋白结合位点;通过点突变实验、体内IHC验证,明确关键作用位点及体内生物学效应。

三、实验结果与数据分析
本研究以口腔鳞状细胞癌(OSCC)天然产物药物筛选为模型,依托上述技术体系完成全流程验证,核心数据如下:
1.化合物筛选:从3682种化合物中筛选出336种候选化合物,10µM浓度处理下,血根碱(Sang)是唯一能同时显著抑制CAL27、SCC9两种OSCC细胞系增殖的天然产物,细胞汇合度下降均超35%,优于多柔比星等对照药物。
2.靶点联合筛选:LiP-MS筛选出6个跨浓度组核心差异蛋白,AI虚拟筛选预测前10位靶点,PKM2为唯一交集靶标,实现靶点精准锁定,较单一筛选方法效率提升60%以上。
3.分子互作验证:SPR检测显示Sang与PKM2结合呈剂量依赖性,平衡解离常数KD=7.31×10⁻⁶M;MST检测KD=2.63±0.31µM,两组数据高度吻合,证实两者具备强效、高亲和力直接结合。
4.机制验证:分子动力学模拟锁定PKM2蛋白F26为关键结合残基;F26A点突变后,Sang对PKM2酶活性抑制率下降超80%;体内IHC实验证实,Sang通过靶向PKM2 F26位点抑制肿瘤细胞自噬,显著阻断OSCC进展。
四、技术核心优势
1.筛选精准高效:LiP-MS与AI虚拟筛选双向互补,大幅降低假阳性,快速锁定核心靶标,避免传统方法盲目筛选,缩短靶点挖掘周期50%。
2.验证数据权威:SPR+MST双向分子互作检测,从动力学、亲和力多维度定量验证,数据可重复性强,符合高水平科研论文数据要求。
3.机制解析深入:从蛋白靶点、结合位点、体内外效应全链条解析药物作用机制,实现“药物-靶标-通路-疾病”完整论证。
4.应用场景广泛:适配老药新用、天然产物活性筛选、抗肿瘤/抗炎药物研发等多领域,兼容细胞、动物、临床样本多类型检测。

五、典型应用案例
以本研究为例,依托LiP-MS+AI虚拟筛选+分子互作技术体系,成功从天然产物中挖掘出血根碱抗OSCC的全新靶标PKM2,相关研究成果发表于《Phytomedicine》(一区,IF=8.3),为OSCC靶向治疗提供全新候选药物与作用靶点,同时验证了该技术体系在天然产物药物研发、老药新用领域的实用性。
该技术已成功应用于多种疾病药物研发:在肿瘤靶向药筛选中,快速挖掘出3种已上市药物的全新作用靶点;在天然产物活性研究中,完成10余种天然小分子的靶标鉴定与机制解析,助力多项科研成果发表于高分SCI期刊。
综上,LiP-MS+AI虚拟筛选+分子互作技术体系,凭借高效、精准、严谨的优势,成为药物靶标筛选、老药新用、天然产物机制研究的核心技术方案,为药物研发与基础科研提供强有力的技术支撑。

Yangenebio对于中药及小分子药物研究,建立了一套完整的技术服务体系:
武汉研锦生物科技有限公司(YanGeneBio)提供产品:
1,天然产物、中药、代谢物等化合物靶点发现及SPR亲和力验证解决方案:
1)中药/复方的有效成分高精度鉴定,网络药理学分析及SPR验证互作;
2)化合物钓靶(标记法):ABPP钓靶(特异性强,重复性高,细胞水平钓靶);
3)化合物钓靶(非标记法):Lip-MS/PELSA/CETSA(细胞、组织裂解液水平钓靶);
4)生物素标记法Spider药物钓靶(细胞、组织裂解液水平钓靶)5)SPR/MST/BLI/ITC/DSF等策略检测分子间亲和力;
6)药﹣靶结合位点分析(Lip-MS+分子对接鉴定纯蛋白与化合物互作位点);
7)蛋白-蛋白结合位点分析(交联质谱+分子对接鉴定2个纯蛋白间互作位点);
8)ABPP-WB/CETSA-WB 在细胞水平鉴定药物与靶点蛋白互作分析;
9)提供真核蛋白表达纯化服务、原核蛋白表达纯化服务;
10)提供定制化基因敲除细胞模型验证药物活性;
11)基于分子对接等策略提供化合物高通量虚拟筛选技术服务;
12)提供蛋白芯片筛选服务、抗体芯片筛选服务:磷酸化抗体芯片,炎症因子蛋白芯片等检测服务;
13)提供Olink多因子蛋白组学检测服务。
14)ASO等核酸修饰合成,siRNA核酸合成,类器官筛药服务。
2,提供重组活性细胞因子产品:应用类器官培养、完全培养基添加剂、干细胞培养、细胞治疗等领域。
3,提供分子互作仪、细胞电转仪、蛋白纯化仪、核酸合成仪及纯化仪等设备。

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