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【罕见病|文献计量模板128】人工智能赋能罕见病研究:近二十年文献计量学视角分析

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引言

罕见病(Rare Diseases,RDs)通常指患病率低于1/2000的人群疾病。目前全球已发现超过7000种罕见病,影响超过3.5亿人,其中近一半为儿童。虽然单个疾病患者数量有限,但作为整体,罕见病并不罕见,并给患者家庭和社会带来沉重负担。

由于约80%的罕见病与遗传因素相关,且多在儿童时期发病,常导致严重残疾甚至死亡,因此提高诊断效率和治疗水平成为全球医学的重要课题。

近年来,人工智能(AI)快速发展,在疾病诊断、治疗决策和患者管理等方面展现出巨大潜力。越来越多研究开始探索AI在罕见病领域的应用,希望通过数据分析、模式识别和智能决策帮助解决罕见病诊疗难题。

本研究通过文献计量学方法,对过去20年全球AI赋能罕见病研究进行系统分析,以揭示研究热点和未来发展趋势。

  • 该文2024年发表于Orphanet Journal of Rare Diseases (OJRD)

  • IF(Impact Factor)≈ 3.5JCR分区:Q2

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以下分为三个方面进行解读。

一. 检索策略

研究团队检索了Web of Science(WoS)数据库2003年至2023年期间关于“人工智能+罕见病”的相关文献。

经过筛选:

  • 初始文献:1931篇
  • 最终纳入研究:1501篇原创研究论文

二. 主要结果

1. 发文趋势:AI+罕见病进入高速发展期

2003—2023年间,共发表相关论文1501篇,年均75篇。

研究发展可分为三个阶段:

第一阶段:起步期(2003-2010)

  • 每年发文不足30篇
  • 研究刚刚起步

第二阶段:稳定发展期(2011-2018)

  • 发文量稳步增长
  • AI开始进入罕见病研究领域

第三阶段:快速增长期(2019-2023)

  • 发文量快速上升
  • 2021年成为重要转折点
  • 发文量从119篇增长至218篇
  • 增长率达83.19%

整体呈明显指数增长趋势(R²=0.963)。

Figure 2. 2003-2023年AI在罕见病及医学领域发文趋势

2. 全球研究格局

全球共有85个以上国家参与AI罕见病研究。

发文量排名前五国家:

  1. 美国(515篇,35.23%)
  2. 德国(235篇)
  3. 英国(172篇)
  4. 中国(152篇)
  5. 法国(135篇)

美国在该领域处于绝对领先地位。

国际合作网络显示:

  • 美国
  • 加拿大
  • 德国

这些国家承担着连接全球研究资源的重要桥梁作用。

Figure 3. 全球AI罕见病研究格局

A. 全球发文分布图

B. 高产国家合作网络图

3. 研究热点分析

高频关键词反映当前研究重点。

Table 1. AI在罕见病领域高频关键词Top20

排名前三关键词:

排名
关键词
1
Mutation(基因突变)
2
Diagnosis(诊断)
3
Management(管理)

其他高频词包括:

  • Gene(基因)
  • Variant(变异)
  • Classification(分类)
  • Children(儿童)
  • Expression(表达)
  • Therapy(治疗)
  • Database(数据库)

说明:

AI在罕见病领域最核心的应用集中在基因诊断、疾病识别和患者管理。

Figure 4. 关键词共现网络图

4. 研究热点演化

研究将20年发展划分为三个阶段。

第一阶段(2003-2010)

主要关注:

  • 肾上腺皮质肿瘤
  • 先天性中枢性低通气综合征
  • 核受体

这一时期主要探索具体疾病和潜在致病机制。

第二阶段(2011-2018)

开始出现明显AI相关聚类:

  • Diagnostic Algorithm(诊断算法)
  • Specific Database(专病数据库)
  • Deep Neural Network(深度神经网络)

这一阶段标志着AI正式进入罕见病研究。

第三阶段(2019-2023)

研究热点进一步升级:

  • Medical Care(医疗服务)
  • Artificial Intelligence(人工智能)
  • Deep Learning(深度学习)
  • Disease Prediction(疾病预测)

研究重点逐渐转向利用AI提升诊断效率和患者结局。

Figure 5. 不同阶段关键词聚类图

A. 2003-2010

B. 2011-2018

C. 2019-2023

5. 未来研究趋势

通过突现词分析发现持续时间最长的关键词是DNA,持续热度长达11年。突现强度最高的关键词包括:

  • DNA
  • Disorder(疾病)
  • Deep Learning(深度学习)

近年来最新热点集中于:

  • Biomarker(生物标志物)
  • Predictive Model(预测模型)
  • Data Mining(数据挖掘)

这表明AI正在从疾病识别向精准预测和精准医疗发展。

Figure 6. 关键词突现分析图

三. 讨论(简化)

研究发现,过去20年AI在罕见病领域的发展与整个医学AI领域同步增长。推动这一变化的原因包括:

① 基因数据爆发式增长

AI能够快速分析:

  • 基因组数据
  • RNA测序数据
  • 长读长测序数据

帮助发现新的致病基因和疾病机制。

② 大语言模型(LLM)兴起

ChatGPT等大语言模型正在展现潜力:

  • 辅助诊断
  • 风险预测
  • 医疗管理
  • 医学知识整理

未来有望成为罕见病诊疗的重要工具。

③ AI推动精准医疗

AI能够:

  • 识别疾病特征
  • 预测疾病进展
  • 个体化制定治疗方案

帮助实现真正意义上的精准医学。

④ AI加速药物研发

AI已开始应用于:

  • 药物筛选
  • 临床试验设计
  • 数据分析

有望显著缩短孤儿药研发周期。

研究认为:未来AI在罕见病领域的发展将重点聚焦基因组学,发现更多致病基因,和生物标志物。多组学整合基因组,转录组,蛋白组,临床表型,实现更精准诊断。智能预测模型提前预测疾病风险和疾病进展。个体化精准治疗根据患者特征制定专属治疗方案。

【一句话总结】过去20年,AI赋能罕见病研究已经完成从“疾病探索”到“智能诊断”,再到“精准预测与个体化治疗”的跨越。未来,随着基因组学、大数据和大语言模型的发展,AI有望成为破解罕见病诊疗难题的重要力量。

编者按

人工智能正在深刻改变现代医学,而罕见病正成为这一变革的重要应用场景。长期以来,由于患者数量少、疾病种类多、临床表现复杂,罕见病面临诊断困难、误诊率高、治疗选择有限等挑战。随着基因测序、大数据分析、机器学习和大语言模型等技术的发展,人工智能正在帮助医生更快识别疾病、发现致病基因、预测疾病进展,并推动精准治疗和创新药物研发。

本期我们结合《Artificial Intelligence Empowering Rare Diseases: A Bibliometric Perspective over the Last Two Decades》研究成果,从文献计量学视角回顾过去20年全球“人工智能+罕见病”领域的发展历程,梳理主要研究国家、核心热点与未来趋势。透过不断增长的研究数据可以看到,人工智能正逐步从辅助工具成长为推动罕见病诊疗创新的重要力量。未来,随着多组学数据整合、智能预测模型和精准医学的发展,AI有望为更多罕见病患者带来更早诊断、更精准治疗以及更多希望。

原文链接:

            DOI: 10.1186/s13023-024-03352-1
            关键词:#文献计量学#Hanson临床科研#罕见病

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            编译:Shutong Liu,微信号:Healsanz。
            美国Healsan (恒祥医学科技),专长于Healsan医学大数据分析(Healsan™)、及基于大数据的Hanson临床科研服务(HansonCR™)和医学编辑服务(MedEditing™)。主要为医生科学家、生物制药公司和医院科研处等提供文献计量分析和SCI论文润色、编辑、选刊等服务,成为诸多机构的“临床科研外挂”。
            网址:https://healsan.com/

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