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导语:一款叫 Biomni 的开源 AI 智能体,想给生物学家做一个像程序员 IDE 那样的统一工作台。开源不到一年,7000 多个实验室在用,前 20 大药企里 18 家在列。它到底解决了什么旧问题?
2026 年 2 月 3 日,斯坦福两位刚毕业的博士黄柯鑫和屈元昊创立的 Phylo 公司,宣布完成 1350 万美元种子轮融资。
领投方 a16z(全称Andreessen Horowitz)是美国硅谷顶级的私人风险投资公司,由网景公司(Netscape)创始人马克·安德里森(Marc Andreessen)和本·霍罗威茨(Ben Horowitz)于2009年创立。
典型投资案例包括Facebook、Twitter、Skype、Airbnb。领投方还有 Menlo Ventures 旗下、与 Anthropic 合作的 Anthology Fund。撑起这笔钱的,是一款叫 Biomni 的开源生物医学 AI 智能体。
团队的科学顾问名单本身就值得看一眼:2022 年诺贝尔化学奖得主 Carolyn Bertozzi、CRISPR 先驱张锋、计算生物学领军人物 Fabian Theis。黄柯鑫师从图机器学习学者 Jure Leskovec,屈元昊则师从 CRISPR 先驱丛乐——两位导师也是 Phylo 的科学联合创始人。

01
模型很强,却没人用
强模型 demo 惊艳,落到生物学家日常却没人用——缺的是哪一块?
黄柯鑫读博期间发表过一串高影响力工作。TxGNN 是做药物重定向的图神经网络,登上《Nature Medicine》,能在零样本下为缺乏疗法的疾病找候选药;GEARS 则专门预测基因扰动效应。
它们的共同点,是用 AI 理解生物系统里的因果关系,而不只是拟合相关性。
但他始终有个心结:模型在论文上表现漂亮,真到生物学家手里却用不起来。演示时对方总说“这很酷”,可让他们日常用就无从下手。
转折在 2024 年。大语言模型驱动的 AI 智能体兴起,黄柯鑫意识到:智能体能直接接管生物学家每天那些繁琐又不需要创造力的活——跑生信分析、查数据库、查文献、汇总信息。Biomni 由此而来。

02
给生物学家一个“IDE”
工程师有 IDE、设计师有 Figma,生物学家的统一工作台长什么样?
他的类比很直白:软件工程师有 IDE,设计师有 Figma,分析师有 Excel,生物学家却从没有一个真正属于自己的统一工作台。
文献锁在付费墙后的 PDF 里,数据散在 Excel 表里,分析靠 R 和 Python 脚本,数据库藏在各种网页门户后。Biomni 想做的,就是生物学的那个 IDE,技术上分两块。
Biomni-E1 是一个统一的“行动空间”——团队分析了 bioRxiv 上 25 个子领域的 2500 篇论文,提取工具、数据库、软件并经人工核验,搭出一个环境:
150 个专业工具 论文中提取、人工核验
105 个软件包 覆盖主流生信分析
59 个数据库 一处接入,免去多门户切换
Biomni-A1 则是通用智能体架构:接到自然语言指令后,检索相关工具、用 LLM 推理出分步计划,再以可执行代码逐步完成。代码驱动而非传统函数调用,让它能灵活处理循环、并行和条件逻辑。

03
三个真实任务,给出了答案
体温分析、单细胞多组学、分子克隆——它到底能不能真干活?
35分钟 抵人工三周 | 33.6万 细胞核分析 | 7000+ 实验室在用 |
一位研究者把 458 个 Excel 文件、30 名受试者数月的可穿戴数据丢给 Biomni,分析餐后体温变化。它自主生成并执行了 10 步流程,发现进食后平均体温上升 2.19°C。这活儿人工估计要三周,它用了 35 分钟。
更复杂的是单细胞多组学。面对约 33.6 万个细胞核的 snRNA-seq 和 snATAC-seq 数据,它从加载一路做到基因调控网络推断、转录因子活性分析。
它不仅重现了原论文已知的调控关系,还指出 AUTS2、ZFHX3、PBX1 等转录因子在骨骼发育中此前未被充分认识的作用。全程五个多小时,中途还自己处理了变量名不匹配的报错。
最有意思的是一项分子克隆任务:把靶向人类 B2M 基因的 sgRNA 克隆进 lentiCRISPR v2 Blast 载体。Biomni 独立完成了质粒分析、sgRNA 设计、引物设计、Golden Gate 组装条件和菌落筛选策略。
一位科学家严格照它的方案做,第二天就看到菌落,Sanger 测序确认 sgRNA 正确插入。在盲测里,它的表现和 5 年以上经验的资深研究员相当,远超新手。

04
为什么坚持做“通用”智能体
不为每个任务做专用体,黄柯鑫赌的是跨学科那点发现机会。
黄柯鑫没给每个任务都做专门智能体。更深一层,他看重跨学科的发现机会——很多重要突破,恰恰发生在两个子领域的交界处。
CRISPR 来自对细菌免疫的基础研究,免疫检查点疗法来自对 T 细胞信号的探索。通用智能体能桥接不同子学科,专门化的反而桥接不了。
“很多时候我们也不确定那是不是真正的因果关系,本质上可能还是相关性,只不过当相关性足够强的时候,我们才认为它是因果。”
黄柯鑫 谈 LLM 能否胜任强调因果的生物学
代价也很清楚:在那些只有资深专家才掌握的高隐性知识任务上,现在的智能体还够不着。
05
“每台电脑上永远开着的那个标签页”
7000 实验室、18 家顶级药企在用,下一步要去哪?
官方数据显示,Biomni 开源不到一年,已被超过 7000 个实验室采用,全球前 20 大药企里有 18 家在用。商业化走的是开源版之上的企业级产品 Biomni Lab。
领投的 a16z 合伙人 Jorge Conde 在投资备忘录里写道:他们认为 Biomni Lab 会成为每个实验室、每台电脑上那个永远开着的标签页。
黄柯鑫的设想更远:五年、十年后,生物学家早上打开电脑第一件事,就是看智能体昨晚跑完的结果,再用自然语言写几条指令让它继续。
自己则腾出手去做实验、去想更有意思的问题——一个人像 PI 带团队那样,同时指挥十几二十个 AI 智能体并行干活。按他的说法,眼下最大的瓶颈不是模型,而是教育和信任。
/ Question /
如果“调度一群 AI 智能体”成了生物学家的日常,未来真正稀缺的,是会做实验的手艺,还是提出好问题的眼光?
你怎么看?
参考来源:
· 主源:麻省理工科技评论(mittrchina.com),2026-02-05,作者 加洋 / DeepTech深科技
· Phylo 官网 phylo.bio;Biomni 论文 biomni.stanford.edu/paper.pdf
本文由 BioSpark 产线整理,仅作学术科普,版权归原作者。
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