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iMeta刊文力荐:AI赋能多组学分析,微科盟生科云再升级,44个云流程+126个云全新迭代

iMeta刊文力荐:AI赋能多组学分析,微科盟生科云再升级,44个云流程+126个云全新迭代

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生科云网址:https://www.bioincloud.tech

过去十年,高通量测序、质谱学、单细胞技术飞速发展,多组学数据呈现爆发式增长。微生物组、转录组、蛋白组等多组学的整合分析,已成为解析复杂性状、疾病机制和生态系统功能的常规手段。

然而,数据获取越来越容易,数据分析却愈发棘手。分析过程涉及多个顺序步骤,各环节工具各异、格式不统一、参数设置繁杂,用户被迫在多个系统或软件间手动切换,自行搭建流程、反复调试数据,不仅技术门槛高,更直接影响结果的可重复性。面对高复杂度、高异质性的多组学数据,如何有效可视化与合理解读,对科研人员而言尤为困难。当前,虽有Galaxy、mixOmics、MetaboAnalyst等平台在不同领域各有建树,但多数仍聚焦于单一组学或特定分析阶段,贯穿全流程的端到端整合依然有限;AI的应用也多停留在浅层辅助,缺乏对自适应推理、交互式解读和全程科研支持的深度融合。

为填补这一空白,微科盟生科云2026应运而生,向全球学术用户免费开放https://www.bioincloud.tech微科盟生科云2026是对以前微科盟生科云版本的全新升级,并于2026年7月8日再次获iMeta期刊(IF=44.4)刊文力荐。如需下载原文,请点击文末“阅读原文”。

2024年2月13日首次获iMeta期刊推荐,DOI10.1002/imt2.175

2026年7月8日再次获iMeta期刊推荐,DOI10.1002/imt2.70149

微科盟生科云2026在首次发布的基础上进行了系统性地全面升级,目前已形成三大核心功能协同驱动的完整架构:

  • 多组学云流程:提供44个标准化分析云流程,覆盖九大分析领域

  • 可视化云工具提供126种免费交互式可视化工具,支持从基础统计到高级对接分析的广泛需求;

  • AI智能体模块内置多组学知识库和大语言模型,覆盖参数推荐、图表解读、文献综述、文献搜索、假设生成、实验设计、智能问答和期刊推荐等。

三大功能在微科盟生科云网页环境中无缝衔接,分析逻辑一致,数据流转顺畅,用户无需在不同系统间反复切换。

多组学云流程:从22个到44个,新增22个关键分析云流程

组学云流程从原有的22个扩展至 44个,分为九大分析类别:扩增子、宏基因组、宏转录组、宏蛋白组、宏病毒组、代谢组、基因组、理化数据及新增的关联分析模块

22个新增工作流精准补充了此前相对薄弱的领域,比如:

  • 宏基因组分箱:新增宏基因组分箱、宏基因组多覆盖度分箱、宏基因组混合分箱等多个云流程,帮助研究人员从复杂的微生物群落中高效提取单个微生物基因组。这些流程针对不同测序深度和样本复杂度场景做了专项优化,并提供可视化报告,让研究人员一目了然地判断哪些基因组值得深入分析。

  • 宏转录组新增lncRNA转录组、真核转录组2.0、全转录组三条流程,将分析视野从蛋白编码基因拓展至非编码RNA;

  • 宏蛋白组新增TMT蛋白组、Astral DIA蛋白组、无参Astral DIA及磷酸化蛋白组流程,全面支持DIA采集和翻译后修饰分析;

  • 基因组新增细菌完整基因组、动植物重测序及人外显子测序工作流,覆盖从个体到群体的变异检测需求。

第九大领域——关联分析,是本次升级的核心亮点之一。八个跨组学配对工作流(扩增子 – 代谢组、宏基因组 – 转录组、转录组 – 蛋白质组等)让多源数据整合不再需要用户手动协调数据格式,即可完成系统化的跨组学关联研究。每个云流程均配有示例数据集、分步教程和结果解读指引,让用户真正做到“拿到数据就能上手,跑出结果就能理解”。

微科盟生科云2026 中组学云流程概览。 新增的云流程以红色星号标记。

可视化云工具:从65个升级到126个,新增61种绘图能力

可视化工具从65个跃升至 126个。新增工具中,分子动力学模拟与对接分析是一大亮点——DiffDock对接、蛋白–小分子对接、蛋白–蛋白对接、核酸–小分子对接等工具,使生科云的服务边界从常规组学拓展至结构生物学领域。此外,新增的交互式动态图表(物种丰度桑基图、圆形热图、堆叠柱状图、核密度估计边际图等)进一步丰富了数据展示层次。

使用数据是最好的证明。截至2026年7月,LEfSe图累计使用 97847,聚类热图80087次,关联网络分析 71024次。高频使用本身就是用户对平台工具实用性的直接认可。

微科盟生科云2026 中更新的126个可视化云工具。图中展示了代表性输出结果,说明了主要功能扩展,包括分子动力学模拟、对接分析和交互式动态图表。

AI深度赋能:从参数推荐到结果解读,全程辅助如虎添翼

生科云2026的AI能力并非简单的“问答机器人”,而是系统性嵌入分析全流程的实用辅助工具。

  • AI引导的参数选择根据样本量、数据类型、分组结构等特征,智能推荐预处理方法、统计模型和可视化参数,降低主观判断带来的不确定性。

  • AI辅助的图表解读系统可自动识别结题报告中各类图表的关键信息,快速生成结构化解读文本,帮助用户从海量结果中精准定位核心发现,大幅提升从数据到结论的输出效率。例如,在分组百分比堆积柱状图中,AI可提取优势类群并比较组间差异;在氮循环功能分析中,可识别关键功能基因、比较组间差异、推断生态学意义,辅助用户快速形成科学结论。

  • AI驱动的科研助手内置DeepSeek-R1/V3/V4及Qwen3.6-Plus等多个大语言模型,支持文献综述、文献搜索、假设生成(含多智能体辩论评估)、实验设计、智能问答和期刊推荐等,覆盖从提出问题到成果发表的全流程。

微科盟生科云2026 中全新的 AI 赋能研究平台。 AI 赋能研究平台模块的架构,包含六个功能模块,包括自动化研究综述与文献整合、AI 辅助假设生成、智能科学问题问答、AI 驱动的实验设计与方案规划,以及期刊发现与推荐。

微科盟生科云2026 中的 AI 辅助解读与研究支持功能。 展示平台不同组件中 AI 辅助解读的代表性示例。(A)云流程分析结果的 AI 支持解读,以宏基因组氮循环通路的功能解读为例。(B)可视化输出的 AI 辅助解读,以分组百分比堆积柱状图的自动分析为例说明。(C)AI 驱动研究平台概览,通过文献整合、假设生成、科学问题问答、实验设计和期刊推荐提供智能研究支持。

多组学研究的未来,不在于工具的堆砌,而在于能否将复杂的技术链条转化为清晰的研究路径。微科盟生科云2026所做的,正是这样一件事——通过标准化流程减少重复劳动,通过AI辅助降低技术门槛,通过系统整合打通分析链路,让研究者将精力集中在真正的科学问题上,而非消耗在工具调试和数据格式转换中。

平台永久免费开放,欢迎广大科研人员使用并反馈。访问 https://www.bioincloud.tech,体验更完善、更智能、更易用的多组学分析。

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Gao, Yunyun, Guoxing Zhang, Chengrui Wang, Hao Xu, Zhanhui Yu, Shunyao Jiang, and Yong‐Xin Liu. 2026.“Wekemo Bioincloud 2026: An AI‐Enabled Platform for Standardized Multi‐Omics Data Analyses.” iMeta e70149.https://doi.org/10.1002/imt2.70149

作者简介

高云云(第一作者)

北京林业大学讲师、硕士生导师,iMeta期刊副编辑、国际动物学会青年委员

研究方向为野生动物保护宏基因组学,围绕基因组、宏基因组和单细胞转录组等多组学方法的开发与整合,解析“宿主-微生物”互作的核心规律,近3年在iMetaScience BulletinProtein & CellGigaScience等期刊以一作/通讯(含共同)发表论文6篇,其中2篇文章获ESI 1% TOP高被引论文,授权软件著作权2

张国兴(第一作者)

2018年研究生毕业于中国农业大学此后一直在深圳微科盟科技集团有限公司工作,负责生科云的开发

王呈瑞(第一作者)

硕士毕业于中国海洋大学海洋生命学院,哈尔滨工业大学电子信息专业博士在读。硕士毕业后于微科盟集团工作6年,擅长AI算法模型构建、多组学联合分析。研究方向为肠道菌群参与结直肠肿瘤微环境重塑及转移机制。研究成果发表于iMeta、Cell Reports、IJMS、IJBLS、EES、nutrients、Molecular Nutrition Food Research、Journal of Traditional Chinese Medicine等期刊。

江舜尧(通讯作者)

圳微科盟科技集团有限公司创始人,2011年研究生毕业于深圳大学,先后在华大基因、美吉生物等单位任职,于2017年创立微科盟集团,2019年统筹组织开发生科云,系AI+组学科研的开拓者之一。

刘永鑫

(通讯

作者)

中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员,微生物组与营养健康团队首席,博士生导师。iMeta期刊执行主编,宏基因组公众号创始人,中国微生物学会微生物组专委会委员。

聚焦微生物组方法开发、功能挖掘和科学传播,以第一或通讯(含共同)在Nature Biotechnology/Microbiology、Gut发文40篇,合作在Science、Cell等发文40篇,被引36000次,入选全球前2%科学家榜单/高被引学者。创办宏基因组公众号(19万+),主编微生物组实验手册专著。

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