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2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)

2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)

这次给大家准备了一份超详细的AutoDock下载安装教程!不管你是刚入门的生物信息学新手,还是已经做过不少项目的研究人员,这份教程都能帮你轻松走完AutoDock安装的全过程。从下载到配置,我会一步步带你把这个强大的分子对接工具搞定!

autodock安装前的准备工作

动手安装之前,记得先把电脑上正在运行的杀毒软件和安全卫士全部关掉,免得它们中途干扰安装。这一步很关键,不然很可能装不上,或者装好了软件也跑不起来。
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)

下载AutoDock安装包

安装包直接放在下面这个链接里,需要的可以保存一下:

https://pan.quark.cn/s/a978f1badf21

AutoDock完整安装流程

下面进入正式的安装环节,需要按顺序把Python、AutoDock主程序以及MGLtools这三部分都装好。

第1步、安装Python环境

AutoDock得靠Python环境才能运行,先把Python装起来:

第1步、右击安装包里的"python-2.7.11.amd64"文件,开始安装
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第2步、选择"Install for all users",接着点"Next"继续
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
第3步、这里千万不要改动默认的安装位置!直接点"Next"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第4步、把"Add python.exe to Path"勾上(这步很重要!),然后点"Next"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第5步、耐心等安装跑完
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第6步、装完之后点击"Finish"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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接下来要配置Python的环境变量:

第7步、右键点击"此电脑",选择"属性"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第8步、点击"高级系统设置"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第9步、在弹出的窗口里依次点击"高级"-"环境变量"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第10步、在系统变量区域找到"Path",点击"编辑"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第11步、点"新建",把这两个路径加进去:"C:\Python27"和"C:\Python27\Scripts"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第12步、按Win+R把运行窗口打开,输入"cmd"再点"确定"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第13步、输入命令"python --version",只要能显示出版本号,就说明Python安装成功了!
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第2步、安装AutoDock主程序

Python搞定之后,接着安装AutoDock主程序:

第1步、右击安装包里的"autodocksuite-4.2.6.i86Windows",选择"以管理员身份运行"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第2步、修改安装路径(注意路径里不能出现中文!),然后点击"Install"
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第3步、装完之后点击"Close"把窗口关掉
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第3步、安装MGLtools

接下来装的是MGLtools,它负责配合AutoDock一起使用:

第1步、右击安装包里的"mgltools_win32_1.5.7_Setup",选择"以管理员身份运行"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第2步、点击"Next"继续往下
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第3步、勾上同意协议,点击"Yes"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第4步、这里同样千万不要改动默认的安装路径!直接点"Next"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第5步、耐心等安装跑完
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第6步、遇到弹窗直接点"OK"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第7步、把第一项取消勾选,第二、三项勾上,然后点击"Finish"完成
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第8步、这时桌面上会多出四个快捷方式,分别是:

  • • PMV:分子可视化和分析工具
  • • AutoDockTools (ADT):分子对接准备与分析工具
  • • Raccoon:做高通量虚拟筛选用的工具
  • • Vision:用来创建和管理计算工作流的工具
    图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第4步、AutoDock配置设置

收尾要做的就是配置AutoDock,确保它能正常工作:

第1步、在D盘新建一个文件夹,命名为"Autodock-setting"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第2步、找到AutoDock的安装路径,把两个主程序复制到刚才新建的文件夹里
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第3步、找到MGLTools的安装路径,把"adt"文件夹复制到D盘的Autodock-setting文件夹
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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第4步、打开桌面上的AutoDockTools,依次点击"File-preferences-set",把D盘新建的Autodock-setting文件夹路径填到startup directory里,最后点击"make default"
图:2026最新!AutoDock下载安装教程(附AutoDock安装包)
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到这里,AutoDock的完整安装配置过程就全部结束了!现在你就可以用这个强大的分子对接工具开展研究工作了。要是这份教程对你有帮助,别忘了点个赞哦!

AutoDock 4.2.6 对接文件准备的操作技巧

日常使用中最费时间的往往不是跑对接,而是前期的文件准备。用 AutoDock 4.2.6 处理蛋白时,建议先用 AutoDockTools 删掉结晶水和无关配体,再加氢并计算电荷,这样生成的 pdbqt 才干净,后续打分也更可信。

小分子这边同样有讲究。AutoDock 4.2.6 要求配体带上正确的原子类型,如果从绘图软件导出后直接转格式,很容易因为氢原子缺失而导致对接失败。稳妥的做法是先在 AutoDockTools 里补氢、指定可旋转键,再保存成 pdbqt。

准备阶段多花几分钟把文件检查一遍,往往能省下后面反复重跑的时间。把 AutoDock 4.2.6 的文件准备工作做扎实,对接结果的可重复性会明显提升。

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