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术前乳腺癌淋巴结转移预测状态的“万能模板”只要你会分割ROI

术前乳腺癌淋巴结转移预测状态的“万能模板”只要你会分割ROI

数据准备整理

OnekeyAI现成的技术方案工具,直接套自己的数据使用,从提特征到论文Methods,Results一键生成,实现SCI量产。

一、乳腺癌淋巴结转移预测(除了影像和标签其他的数据有啥用啥,数据100起步,越多越好,无上限)

主要影像手段: MRI(多序列,多参数)

1. 影像学资料(DICOM格式)

术前MRI序列有啥用啥)

T1加权平扫序列

T2加权脂肪抑制序列

DWI弥散加权成像

DCE-MRI动态对比增强MRI

新辅助治疗后MRI(如适用):同术前序列,重点评估治疗反应及残余淋巴结状态

影像学评估指标:淋巴结短径、Node-RADS评分、淋巴结形态学特征(边缘、信号均匀性、有无坏死)、强化模式(均匀/不均匀/环形)

2. 临床资料

年龄(岁)、性别(女性)

身高(cm)、体重(kg)、体质指数(BMI)

月经状态(绝经前/围绝经期/绝经后)及初潮年龄

生育史、哺乳史、口服避孕药使用史

既往乳腺良性疾病史、乳腺癌家族史

肿瘤部位(左/右乳腺,象限)

新辅助治疗/辅助治疗史(化疗、放疗、内分泌治疗、靶向治疗)

手术方式(保乳术/全乳切除术/腋窝淋巴结清扫术/前哨淋巴结活检)

3. 实验室/病理学指标

血常规:白细胞计数、血小板计数、中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)、血小板与淋巴细胞比值(PLR)

肿瘤标志物CA15-3、CA125、CEA(根据临床常规可选)

分子病理指标ER、PR、HER2表达状态、Ki-67增殖指数

组织病理学指标:组织学类型(浸润性导管癌/浸润性小叶癌等)、组织学分级、淋巴血管侵犯(LVI)、周围神经侵犯

穿刺/病理资料:术前穿刺细胞学/组织学结果,术后病理淋巴结状态

4. 生存资料生存任务更容易发高分)

短期3个月、6个月(无病生存DFS、局部复发LR、远处转移DM)

中期12个月、24个月、36个月(常用终点)

长期60个月(5年)、120个月(10年)无病生存(DFS)、总生存(OS)

5. 标签文件(研究的结局,execl表通过另存为.csv格式)

转移:1

未转移:0

二、必然可行的研究方案

一、单序列影像的研究方案

方案1:组学 + 2D深度学习 + 额外两个深度学习模型对比

技术路径

提取影像组学特征(PyRadiomics)

训练2D深度学习模型(如ResNet、DenseNet)

额外再训练两个不同的2D CNN模型(如VGG、EfficientNet)进行对比

融合方式:前融合(特征拼接)+ 后融合(结果加权)

可解释性SHAP、Grad-CAM

创新点:多模型对比+融合,提升泛化能力

方案2:组学 + 2.5D深度学习

技术路径

提取最大ROI截面的2.5D多通道数据(如三个相邻切片)

训练2.5D CNN模型

与组学特征进行前融合或后融合

优势:兼顾空间信息与切片连续性

方案3:组学 + 3D深度学习

技术路径

裁剪3D VOI区域(使用okt crop max roi --axis 3D

训练3D CNN模型(如3D ResNet)

提取3D深度学习特征 + 组学特征融合

优势:保留肿瘤三维结构信息

方案4:2.5D深度学习 + Transformer

技术路径

构建2.5D多通道图像序列

使用Vision Transformer(ViT)进行建模

可与组学特征进行融合

注意事项ViT模型需要较多epoch(建议600以上),无预训练参数

二、多序列影像(如T1、T2、DWI等多序列)的研究方案

方案5:组学 + 2D深度学习 + 序列对比

技术路径

对每个序列单独提取组学特征 + 2D深度学习特征

对比不同序列的建模效果

选择最优序列或进行序列融合

创新点:系统评估各序列贡献,指导临床选择最优序列

方案6:双通道2D深度学习 + 2.5D深度学习

技术路径

构建双通道2D输入(如原始图像 + mask)

同时构建2.5D多通道输入(连续三切片)

分别训练两个模型,结果融合

优势:兼顾图像结构信息与切片连续性

、参考文献