夜雨聆风
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科研者常因WB条带、显微图等Figure排版日均耗2小时，现有PS/AI/ImageJ等工具各管一段、难贯通。我们开发了PS/AI内插件集SciSuite（含GuideMi、WesternBo、ImageXi、ChartEr、SciPanel共200+小工具），覆盖布局、WB、显微、图表至拼装导出全流程，全矢量输出、统一样式，终结机械重复劳动。
科研制图，到底有多痛苦？
如果你是需要发表论文的科研工作者，你一定经历过这样的下午：实验做完了，数据有了，Western Blot跑出来了，荧光显微镜也拍好了。接下来要干嘛？做Figure。打开Photoshop、Illustrator或者PowerPoint，开始无尽的重复劳动——条带要旋转、裁剪、对齐，左边标抗体名，右边标分子量，底下加泳道编号，上面排加减号矩阵和分组线条。显微镜图要拆通道、加伪彩、加Scale Bar、加时间戳、排成网格。最后所有子图拼到一起，加Panel标签A、B、C，调间距，统一字体字号，导出成期刊要求的分辨率和尺寸。一个Panel做下来，两三个小时是常态。一张Figure动辄十几个Panel，一篇文章四到八张主图外加十张左右的附图，光制图就要耗掉整整数周。更别提中间还要改来改去。而且这些工作几乎全是机械性的：对齐、标注、排版、导出。不需要任何创造力，但需要极大的耐心和精力。做到后面眼睛发花，手指发麻，脑子里只剩一个念头——为什么没有人把这些事情自动化？
现有工具，各管一段
不是没有工具，而是没有一个工具能从头管到尾。
ImageJ/FIJI是处理显微镜图像的标准工具，免费、开源、插件生态丰富。但它的输出是位图，做完处理还要到另一个软件里去排版。学术界也有人开发过一些排图插件，比如QuickFigures1、FigureJ2、OMERO.figure3 等，它们在显微镜图的拼装上做了不少尝试，但覆盖范围有限——Western Blot的标注、分子量标记、加减号矩阵这些需求完全不在它们的设计范围内，而且它们大多生活在ImageJ生态里，和后续的矢量排版工作流是脱节的。
Adobe Illustrator是期刊编辑部公认的最终排版标准，Nature、Science、Cell都偏好可编辑的矢量文件。但Illustrator是一个通用的设计工具，它不知道什么是Scale Bar，不知道什么是分子量Marker，不知道什么是泳道编号。所有科研制图需要的标注元素，都要你一个一个手动创建、手动对齐。
Adobe Photoshop是处理WB条带和显微镜原图绑定的工具，图层操作强大，但同样是通用软件，没有任何针对科研制图的快捷功能。
GraphPad Prism Origin画统计图很好用，但它只管数据图表，不管图像处理和Figure排版。
BioRender BioPathways画信号通路和示意图很方便，但它是订阅制的，免费版带水印不能用于发表，而且它也不处理实验图像。
PowerPoint也是很多课题组常用的排图工具，上手快、操作直观。但PPT在导出时会把矢量内容栅格化，分辨率容易降级，部分期刊对此有明确限制，比如Science在任何阶段都不接受PowerPoint文件，Cell也不建议使用。
更痛苦的是，每个期刊对Figure的要求都不一样——尺寸、字体、分辨率、文件格式各有各的规定。甚至连Panel标签用大写还是小写都不统一：Cell用大写加粗A、B、C，PLOS用大写加括号(A)、(B)、(C)，而Nature系列要求小写加粗a、b、c，提交错了就被退回重做。就这么一个字母大小写的事，来回改一次就是好几天。
投一个期刊排一次版，被拒了换期刊还要从头再来。
这就是现状：工具很多，但每个只管一段。从原始图像到最终发表，中间的拼装、标注、排版这一大块，基本全靠手动。
我们做了什么
我们是生物医学领域的科研工作者，有十多年的湿实验经验。和所有同行一样，我们也深受制图之苦。最夸张的时候，每天要花两个小时处理Western Blot图像和显微镜图像——旋转、裁剪、叠加条带和膜图、标注、排版，日复一日。
一开始我们写了一些Photoshop的脚本、录制了一些动作来辅助处理，能省一些时间，但远远不够。后来有一段时间需要大量处理WB条带和Marker膜图的叠加工作，实在受不了了，决定认真做一套工具。
先从最基础的做起——GuideMi，解决参考线和布局管理的问题，打通整个开发流程。然后是最痛的两个场景：WesternBo处理Western Blot的完整工作流，ImageXi处理显微镜图像。之后又做了SciPanel解决最终Figure的拼装和批量导出，ChartEr负责图表标注和表格处理。
五个插件加在一起，就是SciSuite——一套运行在Adobe Photoshop和Illustrator内部的科研制图插件集。
这五个插件分别做什么：
GuideMi — 参考线与布局管理
设置网格、边距、面板布局，不用一根一根拖参考线。帮你在动手之前就把整张Figure的结构定好。
WesternBo — Western Blot制图工具
从原始图像到发表级Figure的完整工作流：旋转裁剪条带、正片叠底合并（支持批量）、左右标注（抗体名+分子量）、泳道编号、加减号矩阵标记、分组线条和文本标注。基本上WB制图需要的每一步，都有对应的工具。
ImageXi — 显微镜图像处理
Scale Bar、时间戳、通道标签、伪彩上色、放大插图、网格排列、批量处理。那些重复性的标注工作，一键完成。
ChartEr — 图表标注与表格
显著性标记、比较括号、数据表格，直接在画布上生成，不用切到别的软件。
SciPanel — Figure拼装与批量导出
把所有子图排进最终的Figure，加Panel标签（A、B、C），按期刊规格导出。整个拼装过程可以预设保存，全实验室统一风格。
五个插件加起来超过200个专业工具，所有输出都是矢量图形（Shape Layer），放大缩小不失真。支持17种语言，有预设系统可以让整个实验室使用统一的制图风格。
为什么不用AI全自动处理？
这是我们经常被问到的问题。AI确实越来越强大，但科研制图和普通的平面设计有本质区别。
普通设计追求的是好看，AI可以帮你生成、排版、调色。但科研Figure里的每一个决定都是科学判断：哪张条带用、裁多少、哪个通道上什么伪彩、加减号矩阵怎么排、分组逻辑是什么、哪些泳道归为一组。这些不是美学问题，是你的实验设计和数据呈现方式，AI不知道你的实验逻辑，没有办法替你做这些决定。
而且，期刊对图像完整性的审查越来越严格。Nature、Science、Cell等顶刊都在使用AI筛查工具检测图像操纵，明确禁止使用生成式AI编辑数据图像。如果你的Figure处理过程不透明，审稿时反而会引发质疑。
所以SciSuite的定位不是替你做决定，而是你做完决定之后帮你快速执行。你说裁哪里就裁哪里，你说标什么就标什么，工具只是让执行过程从几个小时变成几分钟。决定权始终在你手里，工具只负责把你的决定又快又准地落地。当然，如果有一天AGI成为现实，SciSuite也许就该退休了。
写在最后
做科研已经够辛苦了，不应该把大量时间浪费在拖参考线、对齐文字、排加减号这些机械性的工作上。
我们的愿景很简单：让科研制图不再痛苦。把重复劳动交给工具，把时间还给科学。
欲知更多信息请移步SciSuite官网。
Science Should Be Sweet!
参考文献
Mazo G. QuickFigures: A toolkit and ImageJ PlugIn to quickly transform microscope images into scientific figures. PLoS ONE. 2021;16(11):e0240280.
Mutterer J, Zinck E. Quick-and-clean article figures with FigureJ. Journal of Microscopy. 2013;252(1):89-91.
Allan C, et al. OMERO: flexible, model-driven data management for experimental biology. Nature Methods. 2012;9(3):245-253.
公众号：SciSuite
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