实用组学小工具——微生物基因组abricate注释

ABRicate是一款用于快速分析微生物基因组数据的软件，可以基于细菌基因组组装结果进行分析，软件集成了多个权威数据库，可以帮助我们更轻松的检测抗生素耐药基因和毒力因子等内容。

ABRicate支持以下数据库：

之前发布的文章《细菌耐药基因及毒力基因分析实战-ABRicate安装及使用指南》以及我们的课程《微生物抗性与毒力基因注释：ABRicate软件全能实战》（https://college.mimazi.net/course/article-66.html），详细讲解了ABRicate的本地安装与实操技巧。为帮助大家摆脱软件安装和环境配置的繁琐，上海唯那生物现已推出生信云平台服务，将ABRicate注释流程全面云化，实现“零代码、点选式”操作。

现在，您只需微信扫码注册，登录平台找到付费小工具“微生物基因组abricate注释”，上传您的组装序列（fasta格式），勾选所需数据库（如CARD、ResFinder、VFDB等）及设置覆盖度、一致性阈值，即可一键输出注释结果，让生信分析简单化。

使用方法与结果示例

输入文件

基因组组装序列（fasta）

输出文件

* _out.txt：根据选择的数据库输出对应的注释结果

ncbi_out.txt

card_out.txt

vfdb_out.txt

plasmidfinder_out.txt

resfinder_out.txt

argannot_out.txt

ecoli_vf_out.txt

ecoh_out.txt

megares_out.txt

软件版本：abricate 1.0.1

https://github.com/tseemann/abricate