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【Ai赋能】基因突变模拟器及使用说明

【Ai赋能】基因突变模拟器及使用说明

说明:

1. 本模拟器在制作过程中,参考了袁红兵老师的作品,在此感谢!

2. 把下面的链接粘贴到电脑或手机浏览器中免费使用:

    https://ciyk5nb5.html2web.com(电脑端)

    https://4qqv3hd5.html2web.com(手机端)

    如需源文件,可点击文末的“阅读原文”获取。

《基因突变模拟器》使用说明

工具简介

本模拟器可通过碱基替换、碱基增添、碱基缺失的操作,帮助快速理解同义突变、错义突变、无义突变、移码突变、整码突变等不同的基因突变类型,适合高中生物基因突变知识点的学习。

附:不同突变类型及结果解读:

1.碱基替换:仅单个碱基位点改变,后续碱基整体位置不变。常见以下几种结果:

(1)同义突变:碱基改变后,密码子编码的氨基酸未发生变化(密码子简并性),无性状影响。

(2)错义突变:单个碱基改变,导致对应位置一个氨基酸被替换。

(3)无义突变:突变后直接生成终止密码子,翻译提前终止,蛋白质大幅缩短、彻底失活。

2.碱基增添或缺失:某位置插入或缺失1~多个碱基,可导致移码突变或整码突变:

(1)整码突变:在两个密码子之间的位置插入或缺失3的倍数个碱基,会导致控制合成的氨基酸的数目增加或减少,其后的氨基酸的种类不会发生改变。

(2)移码突变:其它情况下的碱基插入或缺失,会导致后续密码子全乱,蛋白序列彻底改变,常提前终止。

界面说明

电脑端界面:

手机端界面:

1.突变前(野生型):展示未发生任何改变的原始DNA、mRNA、正常翻译出的氨基酸标准序列。

说明:本序列仅为基因编码区片段;mRNA上虚线白色方框内依次对应起始密码子与终止密码子;翻译从起始密码子启动,到终止密码子结束。

2.突变后(突变型):实时展示修改碱基后,新转录的mRNA、改变后的氨基酸翻译结果。

3.突变类型:点击下拉菜单可切换3大类基因突变。

(1)碱基替换:单个碱基被另一种碱基替换;

(2)碱基插入:在指定位置插入新碱基(可插入1个到多个碱基);

(3)碱基缺失:删除指定位置的原有碱基(可删除1个到多个碱基)。

4.突变位置:输入2~19之间的数字,指定你要进行突变操作的碱基位点。

说明:1号碱基和20号碱基位于起始密码子和终止密码子外,所以超出数值2~19范围的碱基改变导致的突变为“非编码区突变”。

5.输入碱基:填写A/T/C/G四种碱基之一,作为替换、增添或缺失的目标碱基。

6.功能按钮

(1)应用突变:执行突变运算,自动生成突变后全部序列与氨基酸结果。

(2)重置序列:恢复为原始序列,重新开始模拟。

7.突变分类:系统自动显示突变类型:未突变、同义突变、错义突变、无义突变、移码突变、整码突变等。

操作步骤

1.查看原始碱基和氨基酸序列,熟悉正常转录、翻译的对应关系。

2.下拉选择本次想要模拟的【突变类型】:碱基替换、碱基插入、碱基缺失。

3.在【突变位置】输入需要改动的碱基序号:碱基替换和碱基缺失输入2~19之间的数字,碱基插入输入3~19之间的数字。

4.在【输入碱基】栏填写目标碱基:碱基替换只能输入1个碱基,碱基插入或缺失可输入1~多个碱基。(注意:碱基缺失输入的碱基要与DNA模板对应位置的碱基相同,否则会报错。)

5.点击【应用突变】,系统自动更新突变后DNA模板链,重新转录生成新mRNA序列,重新进行密码子翻译,输出全新氨基酸链,并自动判定本次突变的生物学分类。

6.对比突变前后氨基酸序列的差异,理解突变造成的蛋白质改变。

7.如需重新测试其他突变,点击【重置序列】恢复初始状态。

实操案例

案例1:同义突变

1.突变类型:选择碱基替换

2.突变位置:输入7

3.输入碱基:把原本的T,替换为G

4.点击【应用突变】

突变前后对比

● DNA模板链:第7位T→G

● 对应mRNA密码子:CGA → CGC

● 氨基酸:仍然是精氨酸,完全不变

● 突变类型:同义突变

案例2:错义突变

1.突变类型:选择碱基替换

2.突变位置:输入6

3.输入碱基:原本C,替换为G

4.点击【应用突变】

突变前后对比

● DNA模板链:第6位C→G

● 对应mRNA密码子:CGA→CCA

● 氨基酸:精氨酸→脯氨酸,单个氨基酸替换

● 突变类型:错义突变

案例3:无义突变

1.突变类型:选择碱基替换

2.突变位置:输入16

3.输入碱基:原本A,替换为T

4.点击【应用突变】

突变前后对比

● DNA模板链:第16位A→T

● 对应mRNA密码子:UAU→UAA 

● 氨基酸:丝氨酸→终止密码子,翻译直接在此位置提前结束

● 突变类型:无义突变

案例4:碱基插入→整码突变

1.突变类型:选择碱基插入

2.突变位置:输入11

3.输入碱基:ACG

4.点击【应用突变】

突变前后对比

● DNA模板链:突变后第11位增加ACG

● 对应mRNA密码子:突变后从第11位增加1个整密码子UGC 

● 氨基酸:原4号位增加1个半胱氨酸,其4号位及其后的氨基酸后移一位但没有发生改变。

● 突变类型:整码突变

案例5:碱基插入→移码突变(1)

1.突变类型:选择碱基插入

2.突变位置:输入12

3.输入碱基:ACG

4.点击【应用突变】

突变前后对比

● DNA模板链:突变后第12位增加ACG

● 对应mRNA密码子:突变后从第12位增加UGC且其后的碱基全部改变 

● 氨基酸:增加1个氨基酸,且从原4号位开始,后续氨基酸序列全部改变。

● 突变类型:移码突变

案例6:碱基插入→移码突变(2)

1.突变类型:选择碱基插入

2.突变位置:输入12

3.输入碱基:AC

4.点击【应用突变】

突变前后对比

● DNA模板链:突变后第12位增加AC

● 对应mRNA密码子:突变后从第12位增加UG且其后的碱基序列全部改变 

● 氨基酸:增加多个氨基酸(肽链延长),从原4号位开始后后续氨基酸序列全部改变。

● 突变类型:移码突变

案例7:碱基缺失→整码突变

1.突变类型:选择碱基缺失

2.突变位置:输入8

3.输入碱基:GAG

4.点击【应用突变】

突变前后对比

● DNA模板链:突变后第8~10位的碱基GAG缺失

● 对应mRNA密码子:突变后从第8位减少1个整密码子CUC 

● 氨基酸:原3号位亮氨酸缺失,原肽链减少1个氨基酸,其后的氨基酸向前移一位但没有发生改变。

● 突变类型:整码突变

案例8:碱基缺失→移码突变

1.突变类型:选择碱基缺失

2.突变位置:输入6

3.输入碱基:CTG

4.点击【应用突变】

突变前后对比

● DNA模板链:突变后第6~8位的碱基CTG缺失

● 对应mRNA密码子:突变后从第6位减少GAC 

● 氨基酸:原2号位之后的氨基酸序列全部发生改变。

● 突变类型:移码突变

案例9:碱基缺失→移码突变

1.突变类型:选择碱基缺失

2.突变位置:输入8

3.输入碱基:G

4.点击【应用突变】

突变前后对比

● DNA模板链:突变后第8位减少G

● 对应mRNA密码子:突变后从第8位减少C且其后的碱基序列全部改变 

● 氨基酸:原3号位开始后续氨基酸序列全部改变。

● 突变类型:移码突变

除此以外,碱基插入或缺失还会导致终止密码子提前或延后,翻译的氨基酸序列变短或变长。

附:操作视频 

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