生态学数据处理软件Primer V8新版本正式发布!点击上方“蓝字”关注我们
“从聚类分析到排序、假设检验及其他分析,PRIMER 8为您提供了比其他任何软件更多的工具,用于进行高级非参数和半参数多元统计分析。”
可点击上图或《Primer-生态学数据处理软件》了解Primer详细功能。
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What's new in PRIMER 8?
扩展摘要统计
轻松总结您的变量(或样本),使用一系列标准统计数据(如平均值、中位数、极差、最小值、最大值、指定分位数、偏度、峰度等)和/或使用其他几种定制诊断指标,如出现频率、单值或双值数量,或给定阈值以上的最小值等。您还可以计算按某个因素(或指标)划分的数据的摘要。经验分布/K-S检验
创建原始或累积经验分布,并以图形方式查看。运行稳健的Kolmogorov-Smirnov检验,比较两组的经验分布,同时比较另一因素不同水平下的经验分布。点图/小提琴图
点图和小提琴图为可视化任何单个变量在多个组别中样本值分布的经验形状提供了绝佳方法。单变量非参数方法
运行全新的一套非参数单变量统计测试中的任意一项。PRIMER对这些测试的实现方式颇具新意,因为所有测试都依赖于稳健的置换算法,并且还能自动输出相关图表。可用的测试包括:- Wilcoxon Signed-Rank test威尔科克森符号秩检验(配对双样本);
- Mann-Whitney U test曼-惠特尼U检验(非配对双样本);
- Kruskal-Wallis检验(用于比较多个组);
- Kolmogorov-Smirnov test柯尔莫哥洛夫-斯米尔诺夫检验(用于比较经验分布);和
允许异质分散
PRIMER 8中的PERMANOVA为基于多元相异度的分析提供了解决多元Behrens-Fisher问题的方案(Anderson等人,2017)。现在,您可以在考虑多元离散度异质性的同时,测试多元质心的差异。有限因素
固定因素与随机因素的概念不应被视为严格的二分法,而应视为一个连续的过程(Anderson等人,2025)。PRIMER 8中的PERMANOVA新增了一种名为“有限”的因素类型,允许用户指定从中抽取样本水平的总体中的水平数量。这可以大大提高推断检验的效力,特别是在环境影响研究中。分割图/重复测量
PRIMER 8中的PERMANOVA有一个名为“受试者/全区组误差”的新因子类型,因此您可以在研究设计中指定多个层次的误差来源。这使得重复测量、分割图(以及分组-分线图等)研究设计能够轻松直接地进行分析。周期性检验/组间协变量
在PRIMER 8的PERMANOVA中,你可以将多个协变量组合在一起(使用一个指标)。这为分析周期性、循环性等多变量模式以及其他时空模型提供了大量新模型的选择。质心图
新的质心图功能使您能够直观地展示多因素PERMANOVA模型中主效应的相对重要性(主效应图),并探索复杂PERMANOVA研究设计中单元格质心之间的模式(交互图),所有这些都在您所选相似性度量的空间中构建。残差图
通过PERMANOVA(通过距离方差分析)或DISTLM(通过距离线性模型)去除一个或多个主导因素或回归量的影响,并输出采样单元之间的残差距离/相异矩阵。对残差距离矩阵进行排序,可以直观地展示非主导因素。多元控制图
基于选定的相似性度量,创建一个多元控制图。你可以通过时间(使用渐进式、基线或移动窗口标准)构建图表,并在给定先前观察值的情况下,检测单个观察值何时“失控”。这是监控应用的一个绝佳工具。新的标准化选项
在指标(或因素)的各个组别/层级内分别对样本(或变量)进行标准化处理,输出值以原始百分比、累积百分比或比例的形式呈现,排序方式由您指定。根据连续变量创建有序组
基于任意选定的连续变量,生成一个由有序组构成的新因子,并提供多种可选标准来定义合适的组边界。例如,你可以将分位数指定为“断点”,或创建给定数量的组,每组样本量相等,或最小化组内平方和等。02
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