AIVEV文献合集 | 第十一期

用于直接分析人血浆细胞外囊泡的高通量单囊泡成像平台

    这篇文章提出了一种高通量单囊泡成像平台，能够直接从人血浆等未处理样本中分析细胞外囊泡（EVs）的蛋白表达。通过优化聚乙二醇表面功能化策略，结合自动化液体处理与荧光显微镜，实现了对单个EV的高通量、高灵敏检测，动态范围达4个数量级，检测限低至2.8×10⁴颗粒/mL。研究验证了平台在191例血浆样本中的应用，发现乳腺癌患者，尤其是晚期，血浆中CD9⁺ EV水平显著升高，而CD81⁺ EV变化不显著，且该升高与HER2或TROP-2共定位无关，提示可能反映肿瘤进展相关的系统性EV变化。该平台为大规模、精准的EV临床分析提供了有力工具。

原文链接：

https://www.nature.com/articles/s41467-026-72179-0

小细胞内囊泡在摄取、药物递送和视网膜神经保护方面优于小细胞外囊泡

    文章系统比较了从小细胞内分离的“小细胞内囊泡”（sIVs）与传统“小细胞外囊泡”（sEVs）在生物特性与治疗应用中的差异。研究发现，sIVs粒径更小、产量更高，较sEVs高20–40倍，在生理温度下更稳定，且不表达典型的外泌体标志物，而是富集内质网、高尔基体等相关蛋白及独特的miRNA和磷脂，如磷脂酰胆碱。在蓝光诱导视网膜损伤和rd10小鼠视网膜变性模型中，间充质干细胞来源的sIVs通过抑制内质网应激、递送神经保护因子，展现出优于sEVs的神经保护效果。此外，sIVs具有更高的药物装载效率和体内递送能力，可有效递送雷帕霉素并抑制mTOR通路。总体而言，sIVs作为一种天然存在的细胞内纳米囊泡，在产量、稳定性和治疗效能方面均优于sEVs，为药物递送和再生医学提供了新平台。

原文链接：

https://www.nature.com/articles/s41551-025-01596-1

细胞外囊泡介导的线粒体转移网络，对睾酮合成至关重要

文章揭示了睾丸间质细胞（Leydig cells, LCs）与两种睾丸巨噬细胞（tMacs）亚群之间通过细胞外囊泡（EVs）介导的双向线粒体转移网络，该网络对睾酮合成至关重要。研究发现，LCs在睾酮合成过程中会将含有缺陷线粒体的EVs排出，这些EVs通过磷脂酰丝氨酸（PS）被CD206⁺ tMacs表面的TREM2受体识别并清除，从而防止功能异常的线粒体累积对LCs造成损伤。另一方面，LCs通过ITGβ1-VCAM1相互作用，从MHCII⁺ tMacs摄取含有功能性线粒体的EVs，以补充自身能量需求并支持睾酮合成。破坏TREM2或VCAM1信号会阻断这一转移网络，导致睾酮水平下降、精子发生障碍、生育力降低及肌肉功能衰退。此外，该网络随年龄增长而功能衰退，与老年性睾酮下降相关。该研究揭示了睾丸内LCs与巨噬细胞之间基于EV的线粒体“丢弃-补充”合作机制，为理解组织稳态维持和年龄相关性腺功能减退提供了新视角。

原文链接：https://www.nature.com/articles/s41556-026-01896-x

利用生物信息双分支变换器对药物诱导的细胞扰动响应进行建模

    文章介绍了XPert，一种基于生物学信息的双分支Transformer模型，用于预测药物诱导的细胞转录组扰动响应。XPert通过双分支架构分别编码扰动前后的细胞状态，有效区分内在转录模式与扰动触发的调控变化，克服了现有变分自编码器方法过度去噪导致生物信息丢失的问题。模型整合了药物的化学特征，通过UniMol提取；生物学特征，基于药物-靶标相互作用、蛋白-蛋白相互作用和药物结构相似性构建的知识异构图；以及剂量-时间条件标记，实现基因特异性扰动效应和剂量-时间动态的非线性建模。在L1000数据集的单剂量-单时间场景中，XPert在冷细胞泛化任务上相比最优基线TranSiGen将皮尔逊相关系数提高36.7%、均方误差降低78.2%；在多剂量-多时间预测中，能精确解析药效学轨迹并揭示关键分子事件。通过从大规模临床前数据向临床场景的知识迁移，XPert在患者特异性响应预测中实现最高15.04%的性能提升，并基于注意力机制识别出经临床验证的耐药生物标志物，为精准医疗和药物发现提供了可解释的计算框架。

原文链接：

https://www.nature.com/articles/s42256-025-01165-w