2026AI酶生物元件挖掘与实践改造培训班

8月29日-30日 

上午9:00-12:00，下午13:30-16:30

个人本地电脑基础配置（全程基础实操可用）

适用场景：分子对接预处理、结构可视化、轨迹预处理、AlphaFold3在线预测、NRIMD网页端分析、数据结果统计与绘图、理论案例学习

配置要求：

1. 系统：Windows 10/11 或 Linux、macOS 系统

2. 处理器：Intel i5/R5 及以上

3. 内存：16G 及以上

4. 硬盘：空闲存储空间 ≥50G

5. 网络：稳定高速网络会场独立网络（满足在线服务器、网页工具访问需求）

6. 预装软件：PyMOL、常规办公及数据处理软件

第一天：分子模拟酶作用机制解析

一、酶-底物分子对接实操

1. 酶蛋白、底物分子预处理操作

2. 对接网格与参数设置、运算执行

3. 酶底物结合构象结果分析

二、Amber酶体系分子动力学模拟

1. Amber酶复合物模拟体系文件制备

2. 常规分子动力学完整模拟流程实操

3. 高斯加速分子动力学模拟搭建运行

4. 模拟轨迹处理、MMPBSA结合自由能计算与解读

第二天：AI挖掘、分析与智能改造

一、AI酶改造基础理论与文献案例讲授

1. 酶元件挖掘相关AI基础核心知识

2. 已发表AI酶定向改造成果案例解析

二、AlphaFold3酶蛋白结构预测实操

1. 酶蛋白序列录入、运行参数配置

2. 酶单体/酶-底物复合物结构预测

3. 结构置信度判读、预测文件导出

三、NRIMD网页服务器酶别构长程互作分析

1. 酶蛋白别构调控理论、NRIMD工具架构与GNN底层原理讲解

2. Amber动力学轨迹预处理、Cα骨架标准轨迹格式转换

3. NRIMD任务配置：三种轨迹采样策略

4. 酶残基/结构域互作热图、别构传导通路可视化解读

5. 突变酶别构效应案例分析，定位酶改造关键调控残基

四、AI酶分子智能设计

1. ProteinMPNN、RFdiffusion酶设计核心原理与前沿成果讲解

2. ProteinMPNN：酶活性中心序列优化、功能位点改造设计

3. RFdiffusion：酶全新骨架重构、新型底物结合构象生成

五、AI抗体生成技术

1. AI抗体智能生成技术

2. ProteinMPNN：抗体CDR关键功能区域序列优化设计

3. RFdiffusion：全新抗体完整结构自动化生成

韩教授，吉林大学生命科学学院教授、博士生导师, 吉林省高层次人才。长期从事通过人工智能和分子动力学模拟指导酶分子的理性设计、药物分子的筛选和设计。近年来发表包括 Nat Commun在内的高水平 SCI 论文 100余篇，授权（申报）3 项发明专利。先后主持包括国家自然科学基金面上以及吉林省科技攻关项目在内的省部级项目以及横向课题等科技类项目项 10 余项。现任吉林省生物物理协会常务理事，CCF数字医学分会执行委员，中国化学学会会员，农业农村部人力资源开发中心和中国农学会“科创中国”作物材料再利用产业服务团成员。同时为Interdiscip Sci、 Int. J. Mol. Sci青年编委。获得吉林省自然成果奖二等奖两次，吉林省科技进步奖三等奖一次。

研究方向：人工智能指导药物筛选和酶的理性设计

承担项目:

1. 国家自然基金面上项目基于大语言模型的RNA聚合酶的设计（32471313）2025.1-2028.12.

2. 横向项目工具酶理性设计技术开发（3R2220980465），2022.1-2024.12.

3. 吉林省科技发展计划项目酮糖3-差向异构酶的理性设计（3D5204381465），2020. 1-2022.12.

4. 吉林省自然基金面上项目嗜热内脂酶:基于大分子反应通道的分子设计（3D517G951465），2017.1-2019.122.