医学科研必备!5个顶级靶点数据库,从靶点筛选到分子对接全覆盖

由加拿大阿尔伯塔大学团队维护的综合性生物信息数据库，整合了药物化学信息、药理作用、靶点关联、代谢途径及疾病信息，堪称药物研发的“一站式工具”。

关键功能与使用场景

1.药物靶点精准查询：输入药物名或靶点名称，就能获取对应的蛋白靶点、作用机制及相互作用网络；

2.药物再利用研究：快速筛选已上市药物的新靶点，为老药新用提供线索；

3.分子对接前筛选：获取药物结构信息，为虚拟筛选和分子对接实验打基础；

4.药理学网络分析：梳理药物-靶点-疾病的关联网络，助力机制研究。

检索与使用技巧

• 网址：https://go.drugbank.com/

• 检索方式：直接在搜索框输入药物名、蛋白靶点或疾病名称，即可获取结构化信息，支持下载药物结构文件。

美国国家生物技术信息中心（NCBI）维护的公开化学数据库，收录了数百万小分子化合物的结构、理化性质、生物活性及实验数据，是化学信息学和药物筛选的核心工具。

关键功能与使用场景

1.化合物基础信息查询：快速获取分子式、化学结构、CAS 号等核心数据；

2.生物活性验证：查询化合物对特定蛋白/酶的抑制/激活作用，以及IC50、Ki等关键活性指标；

3.药物靶点关联：挖掘化合物与潜在靶点的相互作用，为靶点验证提供依据；

4.虚拟筛选支撑：下载分子结构文件，用于后续分子对接和虚拟筛选实验。

检索与使用技巧

• 网址：https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

• 检索方式：支持名称、CAS号、分子式、分子结构（手绘输入）检索，结果页可直接下载相关数据和结构文件。

欧洲生物信息研究所（EMBL-EBI）维护的公开数据库，聚焦小分子化合物与生物靶点的相互作用数据，整合了药物、候选化合物的化学结构、药理活性及文献来源，适合药物研发的中上游阶段。

关键功能与使用场景

1.药物活性数据对比：查询不同化合物对同一靶点的活性差异，筛选最优先导化合物；

2.靶点-化合物关联分析：根据已知靶点，寻找潜在作用化合物，或反向推导化合物的未知靶点；

3.QSAR建模与AI预测：下载大量化合物-靶点活性数据，用于构建定量构效关系（QSAR）模型或训练AI药物预测模型；

4.网络药理学分析：与DrugBank、PubChem联用，构建药物-靶点-疾病网络，深化机制研究。

检索与使用技巧

• 网址：https://www.ebi.ac.uk/chembl/

• 检索方式：支持化合物名称、靶点名称、ID或分子结构检索，提供高级筛选功能（如按活性值、物种筛选）。

专注于蛋白与小分子相互作用的公开数据库，收录了大量实验测定的结合亲和力数据，是分子对接、药物设计和结构-活性关系（SAR）分析的关键资源。

关键功能与使用场景

1.结合亲和力查询：获取蛋白-配体的结合常数（KD）、IC50等数据，验证对接结果可靠性；

2.先导化合物筛选：输入蛋白靶点名称或ID，找到已证实有结合活性的化合物，缩小筛选范围；

3.计算药物设计：为虚拟筛选、分子对接提供实验数据支撑，优化药物分子结构；

4.AI模型训练：利用海量结合数据，训练机器学习模型，预测新化合物的结合活性。

检索与使用技巧

• 网址：https://www.bindingdb.org/

• 检索方式：支持化合物名称、蛋白靶点、分子结构或文献关键词检索，结果可按结合亲和力排序，方便筛选高活性化合物。

Therapeutic Target Database（TTD）是综合性治疗靶点数据库，收录了已知和潜在的治疗靶点（蛋白/核酸）、关联疾病、作用通路及对应药物/配体信息，侧重靶点-疾病-药物的关联分析。

关键功能与使用场景

1.疾病相关靶点筛选：输入疾病名称，快速锁定该疾病的潜在治疗靶点；

2.药物-靶点对应查询：明确某药物的作用靶点，或某靶点对应的所有药物；

3.药物研发线索挖掘：寻找未被充分开发的靶点，为新药研发提供方向；

4.多数据库联用：与DrugBank、ChEMBL配合，构建完整的药物研发数据链。

检索与使用技巧

• 网址：https://ttd.idrblab.cn/

• 检索方式：支持按靶点、药物、疾病、生物标志物分类检索，还可按ICD-11疾病分类筛选，精准匹配研究方向。

数据库使用速配指南