软件介绍
AutoDock是一个用于分子对接的开源软件,它可以预测生物大分子(如蛋白质和核酸)和小分子(如底物、抑制剂、药物等)之间的相互作用。AutoDock通过模拟分子间的相互作用,可以预测出小分子在生物大分子中的结合位置、结合能量以及结合构象等。
AutoDock软件在药物设计、生物信息学、结构生物学等领域具有广泛的应用。它可以帮助研究人员理解生物分子之间的相互作用机制,为药物设计提供理论指导,加速药物研发的进程。
软件下载
【软件名称】:Autodock
【软件大小】:177M。
【安装环境】:Win10及以上系统,win7系统请勿下载。
【下载地址】:见文章末尾。
安装教程
1.右击下载后的压缩包,选择【解压到当前文件夹】。
请使用360压缩、bandzip、7zip等专业解压软件,不要使用系统自带的解压软件。

2.进入解压后的【Autodock】文件夹,双击【python-2.7.11.amd64.msi】,鼠标右键,选择【以管理员身份运行】。

3.弹出界面,勾选【Install for all Users】,点击【Next】。

4.点击【Next】。

5.点击【Next】。

6.点击【Finish】。

7.右键【此电脑】,选择【属性】。

8.点击【高级系统设置】,选择【高级】,点击【环境变量】,系统环境变量选择【Path】,点击【编辑】。

9.点击【新建】,添加2个环境变量【C:\Python27】、【C:\Python27\Scripts】,点击【确定】。

10.环境变量点击【确定】,系统设置点击【确定】,设置点击【x】关闭。

11.按住【alt】+【R】键,弹出界面输入cmd,点击【确定】。

12.命令行输入 python --version,显示python版本即可。

13.进入解压后的【Autodock】文件夹,选择【autodocksuite-4.2.6.i86Windows.exe】,右键,选择【以管理员身份运行】。

14.修改安装路径,教程是将盘符改为了D盘,记住路径(后面要用到)。

15.安装完成,点击【Close】。

16.进入解压后的【Autodock】文件夹,选择【mgltools_win32_1.5.7_Setup.exe】,右键,选择【以管理员身份运行】。

17.点击【Next】。

18.勾选【I accept...】,点击【Yes】。

19.不要修改安装路径,不要修改安装路径,不要修改安装路径,直接点击【Next】。

20.安装中...。

21.点击【ok】。

22.取消勾选【LaunchPMV】,点击【Finish】。

23.这时候桌面出现四个快捷图标。
PMV主要进行分子可视化和分析,是一个通用的分子查看器。
AutoDockTools (ADT)是用于分子对接准备和分析的。
Vision能用于创建和管理复杂的计算工作流,具有整合多个工具的功能。
Raccoon用于高通量虚拟筛选,特别适合大规模对接任务。

24.在D盘新建一个【Autodock-setting】文件夹。

25.把第14步安装的Autodock下的【autodock4.exe】和【autogrid4.exe】两个文件拷贝到【Autodock-setting】文件夹下来。

26.把第19步安装的MGLTools-1.5.7下的【adt.bat】文件拷贝到【Autodock-setting】文件夹下来。

27.双击桌面【AutoDockTools-1.5.7】图标。

28.点击【File】,选择【Preferences】,选择【Set】。

29.将D盘新建的【Autodock-setting】文件夹的路径复制到startup directory,点击【make default】。

30.再次打开,界面如下,安装完成。

以上就是Autodock的安装全过程,要是对你有帮助的话,请为小编点个赞。
下载链接获取:公众号后台回复:Autodock。
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