乐于分享
好东西不私藏

【罕见病专题|模板135】从“散点研究”到“知识图谱”:1型多发性内分泌肿瘤研究格局的文献计量分析

【罕见病专题|模板135】从“散点研究”到“知识图谱”:1型多发性内分泌肿瘤研究格局的文献计量分析
Healsan™技术驱动,让科研和SCI论文成为临床工作的副产品。

▼做您定制的类似分析,请与Jason老师联系。

医学圈正在悄悄流行的文献计量分析SCI论文

引言

1型多发性内分泌肿瘤(Multiple Endocrine Neoplasia type 1,MEN1)是一种罕见的内分泌系统疾病。MEN1的发病率极低,根据目前多数报道,其发病率约为1–3/10万,但由于部分患者临床表现较轻,可能存在漏诊。

该疾病可导致多种内分泌肿瘤,甚至具有恶性风险。MEN的诊断长期以来一直是临床难题,目前尚无统一的最佳诊断标准。由于症状较轻,疾病容易被漏诊,尤其在儿童和青少年中诊断更加困难。因此,MEN在临床诊疗方面仍存在巨大空白,并可能影响肿瘤相关预后。

近年来,该疾病逐渐受到关注,尤其在法国和荷兰等国家。然而,由于研究方向缺乏系统性,MEN相关研究仍存在诸多不足。例如,虽然基因检测可用于诊断,但存在伦理问题,因此仍需探索新的诊断方式。此外,儿童及青少年早期诊断仍是重要挑战。

因此,有必要系统评估MEN研究现状与发展趋势,以更高效解决临床问题。

目前已有多种软件及机器学习方法用于分析文献趋势。但PubMed无法直接反映主题随时间变化。因此,基于文本挖掘的主题模型成为替代方案,其中LDA模型是最常用方法。

本文检索2000–2021年PubMed收录的MEN1相关文献,并进行文献计量分析,旨在揭示研究趋势与结构变化。

  • 该文2022年发表于Frontiers in Medicine

  • IF(Impact Factor)≈ 3.6JCR分区:Q1

▼ 想发表自己的文献计量分析论文?点击👇获得更多高质量文献计量分析模板。

(👆经典文献计量分析模板,持续更新中)

以下分为三个方面进行解读。

一. 方法

数据来源与预处理

2021年12月,从PubMed下载所有标注“Multiple Endocrine Neoplasia Type 1”MeSH词的文献,XML格式导出后提取标题、摘要、关键词、MeSH词及发表年份等信息。

主题建模

基于摘要与MeSH词进行LDA主题建模,用于识别研究主题的宏观结构。

LDA是一种主题概率模型,可计算每篇文章属于某一主题的概率,并以最高概率主题作为文章主主题。

通常需要预设主题数,既往研究多设为50。本研究通过初步分析后确定提取20个主题。

文献聚类

采用Louvain算法构建主题相似网络,识别主题之间的社区结构。

每篇文章选取概率最高的两个主题,并统计主题共现关系。

网络可视化使用Excel与Gephi完成。本研究为文献计量分析,无需伦理审批。

二. 主要结果

共检索到1,407篇文献,其中:

  • 病例报告:406篇
  • 综述:362篇
  • 临床试验:19篇

整体来看,2000年至今发文量呈下降趋势(Figure 1),近5年平均约50篇/年。

MeSH分析(MeSH Analysis)

剔除“MEN1”和“Humans”等词后,对MeSH词进行分析。

Table 1显示前20个高频MeSH词。

Figure 2

不同年龄组文献比例变化(2000–2021),总体来看:

  • 成人与中年群体研究最多
  • 老年其次
  • 儿童最少

由于MEN1研究整体规模较小且发文下降,作者进一步分析治疗与基础研究相关MeSH词。

临床研究趋势(Clinical Research Trends)

临床研究热点主要包括:

  • 回顾性研究占主导
  • 治疗效果与预后评估
  • 遗传学诊断
  • 甲状旁腺切除术研究较多

基础研究热点(Basic Research)

基础研究主要集中在:

  • 基因突变分析
  • 原癌基因蛋白
  • 胚系突变
  • 系谱分析与DNA突变检测

LDA主题分析(Latent Dirichlet Allocation)

本研究识别出20个主题

过去11年主要主题趋势:

  • 病例报告为最主要主题
  • 胰腺神经内分泌肿瘤(pNETs)关注度上升
  • MENIN表达、基因突变、遗传癌症综合征持续关注
  • 早期以基因突变研究为主,近年来下降

主题网络分析(Network Analysis)

通过Louvain算法划分出3大研究方向:

1. 诊断(Diagnosis)

  • 遗传癌症综合征
  • 基因诊断与家系筛查
  • 垂体腺瘤
  • MEN1发育研究

2. 基础研究(Basic Research)

  • MENIN表达
  • 基因突变
  • LOH与常染色体显性遗传

3. 治疗(Treatment)

  • 胰腺切除术
  • 甲状旁腺切除术
  • 定位影像学
  • 随访研究

三. 讨论

MEN1自1903年首次报道以来,在1988年定位至11q13区域,1997年发现MEN1基因及MENIN蛋白后,研究进入分子机制阶段。

2000年以来研究主要集中于:

  • 基因机制
  • 遗传诊断
  • 家系筛查

但仍存在不足,例如:

  • 生存分析与基因监测关联不清
  • 患者生活质量研究不足

研究发现:

  • 胰十二指肠神经内分泌肿瘤(pNETs)越来越受关注
  • 它是约20%患者的首发表现
  • 可能被低估,但却是重要死亡原因之一

罕见病研究现状:

  • 全球罕见病逐渐成为公共卫生问题
  • 但MEN1研究增长不明显
  • 可能原因包括:漏诊、病例少、临床试验困难

研究类型结构显示:

  • 病例报告和综述占约50%
  • 反映罕见病研究依赖单病例积累

未来挑战:

  • 建立标准化治疗流程
  • 多中心病例整合
  • 推动基因到治疗转化

编者按

MEN1(1型多发性内分泌肿瘤)作为一种罕见遗传性内分泌肿瘤综合征,其研究长期集中于基因突变与临床表型的关联,但整体发展呈现缓慢且分散的特征。该文基于2000–2021年PubMed文献,结合文献计量与LDA主题模型,从发文趋势、MeSH热点与主题网络多维度揭示MEN1研究结构。结果显示,研究核心集中于胰腺神经内分泌肿瘤、甲状旁腺病变及MEN1基因突变,但病例报告与回顾性研究占比过高,转化研究相对不足。值得关注的是,诊断、治疗与基础研究呈现清晰分层,但跨领域整合仍有限。该研究为理解MEN1知识演化提供了系统图谱,也提示未来需加强多中心协作与从基因机制到精准治疗的转化路径建设,以推动罕见病研究从“描述性积累”走向“机制驱动与临床转化”。

原文链接:

    • DOI: 10.3389/fmed.2022.832662
    关键词:#文献计量学#Hanson临床科研#罕见病

    广而告之:

    如果您也需要对自己公司的产品或者对自己研究的领域做系统梳理,可以找美国Healsan恒祥医学科技做文献计量分析。 

     


    编译:Shutong Liu,微信号:Healsanz。
    美国Healsan (恒祥医学科技),专长于Healsan医学大数据分析(Healsan™)、及基于大数据的Hanson临床科研服务(HansonCR™)和医学编辑服务(MedEditing™)。主要为医生科学家、生物制药公司和医院科研处等提供文献计量分析和SCI论文润色、编辑、选刊等服务,成为诸多机构的“临床科研外挂”。
    网址:https://healsan.com/

    (点击👆,获得持续的医学大数据分析报告)

    ▼ Healsan医路成长更多免费资源:

    (点击👆图片,进入自己感兴趣的专辑。或点击“资源”,浏览本公众号所有资源

    #文献计量分析#文献计量Pro#Hanson临床科研