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神经影像| FreeSurfer安装教程

神经影像| FreeSurfer安装教程
FreeSurfer 是一款广泛应用于神经影像学和脑科学研究的开源软件包,专门用于人类大脑MRI数据的处理、分析与可视化。
建议先安装好WSL
去b站搜了教程,又问朋友要了安装笔记,下载了朋友的.deb安装包,还是不对,于是干脆让deepseek逐步指导
前提:务必明确自己下载的Ubuntu是什么版本!
方法为——打开终端(Ctrl+Alt+T),输入命令:lsb_release -a
与deepseek沟通:
1.Q:我已经安装好了WSL,Ubuntu版本为……,要安装freesurfer,下载好了安装包,文件地址:D:\…… .deb,帮我看一下这个文件有没有问题,并指导逐步安装
A:先检查文件完整性,
(建议自己与deepseek沟通,这样它可以直接根据你的文件位置写代码
每复制一次代码,输出的结果复制给deepseek,没错再继续
2.Q:文件完整性没问题,但安装.deb时报错
A:我所安装的.deb包与我的Ubuntu版本不兼容,需重新去官网下载安装包
freesurfer官网:
https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/DownloadAndInstall
3.Q:进入官网后眼花缭乱,注意寻找tar.gz的后缀,并将文件名反复复制给deepseek确认
4.Q:下载安装包方式有两种,用哪种?
在 WSL 终端中,使用 wget 下载;
Windows 下用浏览器下载,再复制到 WSL 目录
A:建议选②,大概要数小时,建议睡前下载,一觉醒来可能就下载好了
如果WSL中下载过程停滞,建议停止下载(ctrl+c)再选其他办法
5.Q:下载好了,并放到了文件夹,文件位置:……,帮忙指导下一步安装
(每复制一次代码,输出的结果复制给deepseek,没错再继续)
A:
5Q:直到安装步骤的第4步都没有报错,下载许可证时出现了问题
官网网址:

https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/DownloadAndInstall

注意:这个表单必须全部填写,否则报错。可以乱填,邮箱要正确,因为下载后的license文件会发到邮箱里。下载后保存到freesurfer安装包的文件夹
6Q:license下载好了,WSL提示还是没有license文件。我已经把  license.txt放到了D:\……
A:
7Q:检查是否安装好,输入代码:freesurfer -version
好啦!已经安装好咯!
至于使用过程的bug,就继续跟这freesurfer斗智斗勇吧!
祝好运!