98种R绘图模板|第03期

98种R绘图模板｜第03期

7个R语言SCI绘图模板：代码、数据/模拟结果与PDF预览整理

本期整理了 7 个 R 绘图模板，来源混合自生信常用分析图形和高分SCI图表复现两个系列。每个模板目录均保留代码与图片/PDF结果，适合公众号推文展示、课程资料整理和论文配图复现。

本期模板速览

模板逐一介绍

01｜散点饼图

图形定位：散点降维类。适合展示样本分离、变量关系、趋势拟合和二维密度。

区别解读：PCA强调样本群体分离，拟合散点强调变量关系，等高线突出局部密度。

• 代码文件：codes.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据文件：Data file S7.xlsx、DatafileS2_Marker genes for cell types.xlsx、DatafileS3_Demuxlet results in Fig2(WithoutP4).xlsx、DatafileS4_GSEA gene sets.xlsx 等，适合按原目录结构复现示例结果。

• 展示文件：plot.pdf。

02｜三元相图

图形定位：专用图形类。适合特定科研场景，如集合交集、组成比例、层级结构或全基因组关联。

区别解读：这类图形通常用途明确，关键是根据论文问题选择正确的数据结构。

• 代码文件：codes.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据文件：1E5D2A6D.Rdata、7E883893.Rdata、1E5D2A6D.Rdata、7E883893.Rdata 等，适合按原目录结构复现示例结果。

• 展示文件：plot_AI.pdf。

03｜基因融合热图+堆积柱状图

图形定位：热图/矩阵类。适合展示基因、样本、通路或多组学特征之间的整体模式。

区别解读：重点在颜色编码、聚类结构和注释层；复杂热图通常比普通热图多出分组、连线或局部放大。

• 代码文件：codes.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据文件：41467_2022_31780_MOESM9_ESM.xlsx，适合按原目录结构复现示例结果。

• 展示文件：Barplot_Heatmap.pdf、Heatmap.pdf、Stack_Barplot.pdf。

04｜分块热图+注释(1)

图形定位：热图/矩阵类。适合展示基因、样本、通路或多组学特征之间的整体模式。

区别解读：重点在颜色编码、聚类结构和注释层；复杂热图通常比普通热图多出分组、连线或局部放大。

• 代码文件：codes.R、生成PDF.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据说明：该目录当前未附真实数据，已保留可复现模拟绘图 PDF，方便先看效果再替换自己的数据。

• 展示文件：plot1.pdf、plot2.pdf、模拟数据绘图.pdf。

05｜密度直方图

图形定位：趋势构成类。适合展示构成比例、时间变化、项目进度或总体分布。

区别解读：柱状图强调离散比较，面积图强调连续构成，密度直方图突出整体分布形态。

• 代码文件：codes.R、生成PDF.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据说明：该目录当前未附真实数据，已保留可复现模拟绘图 PDF，方便先看效果再替换自己的数据。

• 展示文件：plot.pdf、模拟数据绘图.pdf。

06｜云雨图

图形定位：分布比较类。适合比较组间差异，同时展示离散样本点和总体分布。

区别解读：箱线图突出四分位，提琴图突出分布形状，蜂群/抖动散点更强调单个样本。

• 代码文件：云雨图.R、生成PDF.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据说明：该目录当前未附真实数据，已保留可复现模拟绘图 PDF，方便先看效果再替换自己的数据。

• 展示文件：cloudRainPlot1.pdf、cloudRainPlot2.pdf、cloudRainPlot3.pdf、模拟数据绘图.pdf。

07｜层状结构的各种可视化

图形定位：综合展示类。适合将多维结果整理为适合论文、汇报或公众号展示的图形。

区别解读：该模板可作为通用 SCI 绘图风格参考，根据数据特点替换坐标、分组和配色。

• 代码文件：codes.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据文件：旭日图.csv，适合按原目录结构复现示例结果。

使用建议

• 优先查看 PDF 或图片效果，再打开 R 脚本替换自己的矩阵、分组或统计结果。

• 若目录中包含真实数据，可按原脚本路径直接复现；若仅有模拟 PDF，可将其作为排版和风格参考。

• 热图、气泡图、分布图和网络图适合组合成论文多面板图；专用图形则适合在结果章节中突出单个关键结论。

文末配图