98种R绘图模板|第05期

98种R绘图模板｜第05期

7个R语言SCI绘图模板：代码、数据/模拟结果与PDF预览整理

本期整理了 7 个 R 绘图模板，来源混合自生信常用分析图形和高分SCI图表复现两个系列。每个模板目录均保留代码与图片/PDF结果，适合公众号推文展示、课程资料整理和论文配图复现。

本期模板速览

模板逐一介绍

01｜泛癌箱线图+显著性检验

图形定位：分布比较类。适合比较组间差异，同时展示离散样本点和总体分布。

区别解读：箱线图突出四分位，提琴图突出分布形状，蜂群/抖动散点更强调单个样本。

• 代码文件：codes.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据文件：hsa-let-7a-5p.TCGA_PanCancer_Expression_Data.csv，适合按原目录结构复现示例结果。

• 展示文件：box_plot.pdf。

02｜箱线图+热图注释

图形定位：热图/矩阵类。适合展示基因、样本、通路或多组学特征之间的整体模式。

区别解读：重点在颜色编码、聚类结构和注释层；复杂热图通常比普通热图多出分组、连线或局部放大。

• 代码文件：codes.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据文件：9DAD4006.Rdata、26E8C710.Rdata、575D468F.Rdata、664DFA7C.Rdata 等，适合按原目录结构复现示例结果。

• 展示文件：plot1.pdf、plot2.pdf、plots.pdf。

03｜分面双向柱状图+热图注释

图形定位：热图/矩阵类。适合展示基因、样本、通路或多组学特征之间的整体模式。

区别解读：重点在颜色编码、聚类结构和注释层；复杂热图通常比普通热图多出分组、连线或局部放大。

• 代码文件：codes.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据文件：1E360ADF.Rdata、5C9A9032.Rdata、6DD17F0E.Rdata、1E360ADF.Rdata 等，适合按原目录结构复现示例结果。

• 展示文件：combined.pdf、p1.pdf、p1_p2.pdf、p2.pdf、p3.pdf。

04｜热图

图形定位：热图/矩阵类。适合展示基因、样本、通路或多组学特征之间的整体模式。

区别解读：重点在颜色编码、聚类结构和注释层；复杂热图通常比普通热图多出分组、连线或局部放大。

• 代码文件：Gheatmap.R、heatmap.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据文件：data.txt、Top100_DEG.csv，适合按原目录结构复现示例结果。

• 展示文件：CircleHeatmap.pdf、Heatmap.pdf。

05｜个性化桑基图

图形定位：关系网络类。适合呈现节点、模块、流向或类别之间的联系。

区别解读：网络图强调节点连接，弦图强调组间流量，桑基图强调层级流向，环形图更适合做紧凑展示。

• 代码文件：codes.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据文件：data.csv，适合按原目录结构复现示例结果。

• 展示文件：plot.pdf。

06｜环形分组折线图

图形定位：关系网络类。适合呈现节点、模块、流向或类别之间的联系。

区别解读：网络图强调节点连接，弦图强调组间流量，桑基图强调层级流向，环形图更适合做紧凑展示。

• 代码文件：codes.R、生成PDF.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据说明：该目录当前未附真实数据，已保留可复现模拟绘图 PDF，方便先看效果再替换自己的数据。

• 展示文件：plot.pdf、模拟数据绘图.pdf。

07｜mantel_test_相关性图

图形定位：富集/相关性类。适合表达通路富集、显著性、相关性和基因数量等多维信息。

区别解读：气泡图用大小和颜色承载两类变量，富集分组图更适合横向比较多个实验组。

• 代码文件：mantel_test相关性图.R、生成PDF.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据说明：该目录当前未附真实数据，已保留可复现模拟绘图 PDF，方便先看效果再替换自己的数据。

• 展示文件：mantel_corplot1.pdf、mantel_corplot2.pdf、mantel_corplot3.pdf、模拟数据绘图.pdf。

使用建议

• 优先查看 PDF 或图片效果，再打开 R 脚本替换自己的矩阵、分组或统计结果。

• 若目录中包含真实数据，可按原脚本路径直接复现；若仅有模拟 PDF，可将其作为排版和风格参考。

• 热图、气泡图、分布图和网络图适合组合成论文多面板图；专用图形则适合在结果章节中突出单个关键结论。