软件MS-DIAL5对代谢组学数据(气相色谱质谱联用仪)比对

气相色谱质谱联用仪（GCEIMS）得到的代谢组数据，利用软件MS-DIAL5进行比对，利用NIST背景数据库，进行数据比对。

第一步：建立一个文件夹，里面放入四个文件夹。

第二步：打开软件MS-DIAL。

点击“是（Y）”

第三步：启动新项目“New project”。

第四步：设立“Project title”和“Project file path”，然后点击“Next”。

第五步：原始数据文件采集信息，格式是mzML格式。点击“Raw measurement files”(原始测量文件)标签页，点击“Browse”导入文件夹里所有mzML格式质谱数据。GCMS一般就是DDA模式。

第六步：数据采集参数设置。参数必须严格对应仪器方法。

第七步：数据收集。Mass scan range（质荷比范围）50-1000Da；Retention time（保留时间）：3-74min；Number of threads（线程数）：4 这个根据自己电脑定。

第八步：色谱峰检测。从连续的色谱信号中识别出“真正的峰”。参数设置太低，噪声会被判断为峰；设置太高，真是的小峰会被漏掉。点击“Peak detection”（峰检测）标签页。

第九步：谱图解卷积。GCMS数据处理的灵魂---把“重叠在一起的多个化合物的混合质谱”拆开，还原成各自纯净的质谱。MS-DIAL用的是MS2Dec算法，专门为此设计。点击“Spectrum deconvolution”(光谱解卷积)标签页。

第十步：化合物注释，导入NIST库。

第十一步：峰对齐。单个样本里化合物鉴定完了，但不同样本之间同一化合物的保留时间会有微小飘移（几秒到几十秒）。

点击“Run”

第十二步：需要时间。8个样本，这是13分钟。

第十三步：导出csv文件荷谱图文件。

结果

整个过程结束！！！