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问题的提出:今天看了Z20模拟题,选择性必修3考查的是融合基因的构建(明天解析),这是高频考点。高考来临前,今天再来说一说重叠延伸PCR技术如何形成融合基因。下列典型试题这是重叠延伸PCR构建融合基因的典型场景,核心是通过 “带尾巴的引物” 让不同片段互补拼接。关于重叠延伸PCR技术我在编写选择性必修《疑难知识解惑》第356页有阐述:

重叠延伸/融合PCR技术是通过具有互补末端的引物将不同来源的DNA扩增片段连接起来的方法,其核心原理与操作步骤如下:
一、技术原理
重叠延伸/融合PCR的核心机制基于引物间的互补配对与重叠链延伸。具体而言,设计引物时需在相邻片段的连接区域引入互补序列(如引物2与引物3的部分碱基互补),使不同来源的PCR产物在退火阶段通过互补序列形成重叠链。随后,DNA聚合酶以重叠链为模板进行延伸,最终将两个独立片段拼接为一个完整DNA分子。这一过程无需依赖限制性内切酶或连接酶,仅通过温度循环即可实现高效连接。
二、关键操作步骤
1. 引物设计
需针对待融合片段的末端设计互补序列。例如,若需连接基因A与基因B,引物2的3'端需包含基因A的特异性序列,同时其5'端设计一段与引物3互补的序列;引物3则反向设计,确保其3'端靶向基因B,5'端与引物2互补。这种设计使两片段的PCR产物在退火时形成重叠结构。 如图:

2. 分阶段PCR反应
第一阶段:独立扩增将不同引物组(如靶向基因A的引物1和2、靶向基因B的引物3和4)分别置于独立反应体系中,避免互补引物(如引物2与3)在早期结合导致扩增失效。此阶段生成大量待融合的单一片段。
第二阶段:融合扩增将第一阶段的产物混合,加入外侧引物(如引物1与4)进行新一轮PCR。此时,互补序列引导片段间退火,形成重叠链,并通过延伸完成拼接。最终产物为包含基因A与基因B的融合DNA。
三、应用场景
重叠延伸/融合PCR广泛应用于基因工程领域,例如构建融合基因、删除或替换特定DNA序列、生成嵌合蛋白编码序列等。其优势在于灵活性高,可快速实现任意片段的定向连接,且不受限制性酶切位点限制,显著简化了分子克隆流程。
四、注意事项
互补序列长度通常为15-25 bp,过长可能导致非特异性结合,过短则影响拼接效率。
分阶段PCR需严格控制反应条件,尤其是退火温度,以确保互补序列高效配对。
最终产物需通过测序验证拼接准确性,避免因引物二聚体或错配导致错误。
下列试题串联了3个高频考点:重叠延伸PCR构建融合基因:带重叠尾巴的引物设计、片段拼接逻辑;双抗性基因的分步筛选:细菌水平(卡那霉素)+ 植物水平(潮霉素)的双重筛选;转基因植株的分子检测与功能验证:PCR电泳、阳性对照设置、对照实验设计。
试题:禾谷镰刀菌可侵染小麦等作物,使其产量和品质下降。研究者通过构建融合基因Ve−FG并转化拟南芥,以期实现转基因植物抗禾谷镰刀菌的目的。
(1)利用PCR技术,将野生番茄的抗黄萎病基因Ve与禾谷镰刀菌的识别基因FG进行重组,构建融合基因Ve−FG( 如图 1)。

①设计3对引物。其中引物2的一部分序列与C片段一部分序列互补,另一部分序列与片段一部分序列互补。
②通过PCR分别克隆A、C、P片段。克隆A片段应选用的引物是。
③以A、C、P片段为进行延伸,将A、P、C片段拼接,再以引物 1、4 进行PCR,扩增融合基因Ve−FG。
答案:①P;②1、3;③模板
解析:① 根据图1,融合基因Ve−FG由A(Ve基因片段)、P(FG基因识别片段)、C(Ve基因片段)拼接而成,引物2需连接C和P片段,因此其一部分序列与C互补,另一部分与P互补。 ② 克隆A片段时,上游引物为1(与A的5'端互补),下游引物为3(与A的3'端互补),故选用引物1、3。 ③ PCR拼接片段时,需以A、C、P为模板进行延伸,再用外侧引物1、4扩增融合基因。
(2)用将Ve−FG与质粒连接,构建重组质粒(如图2,图中潮霉素抗性基因只在植物细胞中表达)。将农杆菌与重组质粒混合,一段时间后涂布到含有的平板培养基上进行筛选。用含重组质粒的农杆菌转化拟南芥,几周后收获种子,种在含有潮霉素的培养基上,获得转基因拟南芥株系1和株系2。

答案:DNA连接酶;卡那霉素
解析:DNA连接酶可连接目的基因与质粒的磷酸二酯键。 质粒上的抗性基因:卡那霉素抗性基因在农杆菌(细菌)中表达,用于筛选成功导入重组质粒的农杆菌;潮霉素抗性基因只在植物细胞中表达,用于筛选成功转化的拟南芥植株。重组质粒含卡那霉素抗性基因(图2),因此农杆菌筛选需用含卡那霉素的平板;潮霉素抗性基因用于筛选转基因拟南芥。
(3)分别提取株系1和2、非转基因拟南芥植株叶片中的DNA作为模板,PCR扩增Ve−FG基因后进行电泳,结果如图3。 ①电泳时应以为阳性对照。 ②成功导入Ve−FG基因的是。 ③株系1可抗潮霉素,但电泳结果无阳性条带,原因可能是。

答案:①融合基因Ve-FG;②株系2;③重组质粒中Ve-FG基因未成功整合到拟南芥基因组中(或整合的Ve-FG基因片段不完整)
解析:① 阳性对照需用已知含目的基因的样本,即融合基因Ve−FG。 ② 图3中株系2的电泳条带与阳性对照一致,说明成功导入Ve−FG。 ③ 株系1能在潮霉素培养基上存活,说明潮霉素抗性基因已成功整合并表达,但Ve-FG基因未检出,可能原因:T-DNA整合时发生了部分片段丢失,只整合了潮霉素抗性基因,丢失了Ve-FG基因;Ve-FG基因整合后发生了突变或重排,导致引物无法结合扩增;或植株中Ve-FG基因的拷贝数极低,PCR未检出。
(4)为检验融合基因Ve−FG的功能,以导入Ve−FG基因的植株为实验组,导入空白质粒的植株为对照组,分别接种。一段时间后观察发现,与对照植株相比,实验组整体长势更旺盛,叶片萎蔫程度、叶片变黄程度也较轻,这表明。
答案:等量、相同浓度(或相同致病性)的禾谷镰刀菌;融合基因Ve-FG在拟南芥中成功表达并具有抗禾谷镰刀菌的功能
解析:实验组(导入Ve-FG基因)和对照组(导入空白质粒)的植株,需要接种等量、相同浓度(或相同致病性)的禾谷镰刀菌,遵循单一变量原则;实验组长势好、萎黄程度更轻,说明Ve−FG表达后增强了拟南芥对禾谷镰刀菌的抗性。
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