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【科研工具】高精度全基因组选择AI平台

【科研工具】高精度全基因组选择AI平台

AI加速作物科学研究进入新范式

传统育种依赖于表型筛选和经验判断,周期长、成本高、可解释性弱。随着高通量基因分型技术和人工智能算法的发展,育种工作正逐步从“经验驱动”转向“数据驱动”。然而,现有分析工具往往分散孤立,预测与解析难以在同一平台上贯通,深度学习模型的黑箱特性也限制了其在关键决策中的可信度。

GSBrain P系列产品正是在这一技术拐点上应运而生。平台围绕育种工作中“要结果”与“要原因”的双重诉求,构建了全基因组选择(GS)、机制解析(Mechanism Analysis)、自由构建深度学习网络(FreeDL)、可解释剖析(XAI)、私属大模型(LLM)五大功能体系,用户通过简单拖拽连接即可完成从作物性状预测到分子机制解析的全流程工作

全基因组选择:跨世代的精准预测

在全基因组选择(GS)方面,平台支持用户零门槛使用GBLUP、Bayes及各类深度学习方法建立训练模型,并可基于亲本基因型模拟预测第N代性状表现,从而实现高遗传潜力子代甄别、杂种优势预测以及遗传配组优化。这一模块的核心价值在于将育种决策从经验判断转向数据驱动,在材料下地之前即可对后代表现进行系统评估,大幅缩短育种周期,降低试错成本,让优良材料快速锁定。

零代码可视化分析,快速建立参考模型

1

模拟预测第N代性状表现

●  不用等到后代长成,算法直接告诉你结果

2

高遗传潜力子代甄别

●  从海量材料中精准锁定“种子选手”

3

杂种优势预测与遗传配组优化

●  找到最优组合,避免试错成本

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机制解析:从序列到通路的多组学贯通

机制解析模块(Mechanism Analysis)整合了GWAS、WGCNA、CRE、SA、HA、CNV、PAV等多组学分析功能,覆盖从SNP基因定位、转录调控网络解析、顺式作用元件挖掘,到结构变异与拷贝数变异注释,以及基因组存在缺失变异深度挖掘的全链条。该模块的系统性设计,旨在帮助用户从DNA序列到转录调控,层层拆解性状形成分子机制,让育种不仅有结果,更懂原理。

SNP位点定位

基因转录调控网络解析

启动子顺式作用元件挖掘

结构变异与拷贝数变异注释

基因组存在/缺失变异深度挖掘

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FreeDL:面向育种目标的多任务建模

自由构建深度学习网络功能(FreeDL)支持用户根据作物属性和育种目标自主设计神经网络架构,并实现多任务学习,用一个模型同时预测产量、品质和抗耐逆性等多个目标,高效完成新品种综合评价。相比传统单模型单目标的评价方式,这一设计有效避免了多模型分别评定带来的结果不一致问题。同时支持用户将自主设计的网络架构沉淀为自身知识产权。

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同时支持构建多任务架构,使得一个模型可同时预测多个目标值,比如基于基因组数据同时预测多个表型值

可解释剖析:让黑箱模型变得透明可验证

可解释剖析模块(XAI)内置SHAP、LIME、PDP、ALE等多种算法,结合注意力机制,能够有效捕捉海量微效基因与环境之间的复杂互作。该模块为复杂性状形成机制的深度剖析和分子设计育种的边际把控提供了透明、可验证的依据,使深度学习模型的预测结果不再是一个无法解读的黑箱。

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助力用户深度剖析复杂性状形成机制

私属大模型:安全可控的领域知识服务

私属大模型模块(LLM)涵盖千问、DeepSeek、智谱等数十个基础大模型,用户仅需准备自身领域的知识素材,即可快速构建垂类大模型和智能体,并支持一键发布Web服务供内网或外网访问。该模块既保障数据隐私安全,又实现海量育种知识高效复用,破解数据孤岛难题。

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数据隐私安全+私属ChatGPT能力=企事业单位智能化升级的最短路径

这套平台的设计逻辑非常清晰:

GS+机制解析——解决“要结果”和“要原因”的基础诉求

FreeDL+XAI——强化模型的个性化与可解释性

LLM——扩展为可私有化部署的智能育种助手

围绕育种家的真实工作流,以AI持续迭代强优化,GSBrain P系列产品正在探索智能育种的极限。

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