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解惑练 4 新冠病毒的检测
1.检测患者因新冠病毒而产生的特异蛋白质
新型冠状病毒IgM抗体快速检测试剂盒,该试剂盒采用间接法检测人新型冠状病毒 IgM抗
体,仅需采取一滴血就有望在15分钟内肉眼观察获得检测结果,且患者的血浆稀释500至1
000倍后,仍能检测出阳性条带。其实质为利用抗原—抗体杂交技术,但是无论如何,现在
抗体检测还不能完全替代核酸检测。
2.检测新冠病毒的核酸
新型冠状病毒是一种仅含有RNA的病毒,病毒中特异性RNA序列是区分该病毒与其他病
原体的标志物。
检测原理:
核酸检测盒包括:逆转录酶试剂、病毒核酸标准试剂、热稳定DNA聚合酶、引物序列、特
异性的荧光DNA探针(带荧光的一段特异性的新冠病毒的核酸序列,这个是最关键的,如果
特异性不强或者是病毒在这一段发生变异,则很可能会判定为阴性,影响结果)等。目前采
用RT-PCR技术(逆转录荧光PCR技术)。
(1)先从样本中提取RNA,RNA中可能有新冠病毒的RNA,同时也存在很多采样患者的组
织和存在于采样部位的微生物的RNA。
(2)先通过逆转录酶将样本的 RNA逆转录为cDNA。因为新冠病毒中的核酸为 RNA,而
RNA极易降解,为了防止我们检测的物质在检测过程中降解,我们把它转换为更稳定的
DNA。
(3)检测扩增出的PCR产物,即DNA片段。我们扩增的病毒DNA片段能够发出荧光而被仪
器检测到。这些扩增出的供我们检测的产物的多少,很大程度上取决于样本中目标 RNA量
的多少。而目标RNA量的多少又与样本中病毒的多少相关。
下图显示了相关原理:在PCR反应体系中,包含一对特异性引物以及一个Taqman探针,该
探针为一段特异性寡核苷酸序列,两端分别标记了报告荧光基团和淬灭荧光基团。探针完整
时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;若反应体系存在靶序列,PCR反应时探针
与模板结合,DNA聚合酶沿模板利用酶的外切酶活性将探针降解,报告基团与淬灭基团分
离,发出荧光。每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子产生。荧光定量PCR仪能够监测出
荧光到达预先设定阈值的循环数(Ct值)与病毒核酸浓度有关,病毒核酸浓度越高,Ct值越小。跟踪训练
1.(2022·潍坊期末考试)“防疫攻坚进行时,不再是说走就走的旅行”,为控制跨境传播,
我国驻多国大使馆先后发布通知,赴华人员需要提供新冠病毒核酸检测及血清抗体检测的双
阴性证明。目前,PCR技术(荧光PCR法)是病毒核酸检测的主流方法,是新冠病毒检测试
剂盒采用最多的技术。IgM/IgG联合检测(胶体金法)是新冠抗体检测试剂盒主要采用的技术。
请分析回答下列问题:
(1)新冠病毒是RNA病毒,所以需对样本进行__________处理后再PCR扩增,如果样本存在
目标病原体,则会因为__________的特异性,扩增出相应的目标基因片段,由此判断是否为
阳性。
(2)荧光PCR法,又称qPCR法,是指在反应体系中加入__________,通过专门仪器实现实
时荧光检测,以__________来测定PCR循环后产物中核酸水平。
(3)IgM和IgG均属于免疫球蛋白家族,是机体在抗原物质刺激下由浆细胞产生的抗体。
IgM/IgG检测试剂盒的原理是____________________,通过检测人体内相应抗体间接证明是
否感染。被病毒感染后,机体会产生一系列的变化来抵御这种入侵,其中 IgM和IgG的含
量会发生如图所示变化。
通过对COVID-19患者研究发现,病毒侵入人体后,大约需要5~7天产生IgM抗体,IgG
抗体在感染后10~15天时产生。通过检测外周血中IgM和IgG,不仅可以鉴别是否感染,
还可以辨别检测者是近期感染或者是既往感染。当核酸检测结果为阳性,IgM(+)IgG(-)时,
可判断检测者为_______________________________________________________________;
已治愈的患者检测结果应为______________________________。
答案 (1)逆转录 引物 (2)荧光物质 荧光强度 (3)抗原与抗体特异性结合 近期感染
核酸检测结果为阴性,IgM(-)IgG(+)解析 (1)基因工程中,目的基因的获取方法有两种,一种是直接从基因文库中获取,另外
一种是人工合成,人工合成的方法必须已知目的基因序列,方法有两种,DNA合成仪合成
和PCR技术合成。PCR是扩增DNA的一种方法,如果是RNA病毒,首先要转化成DNA,
也就是逆转录;利用PCR技术进行新冠病毒核酸检测时,如果样本存在目标病原体,就会
因为引物的特异性,扩增出相应的目标基因片段,由此判断是否为阳性。(2)荧光PCR是通
过荧光染料或荧光标记的特异性的探针,对PCR产物进行标记跟踪,通过专门仪器实现实
时荧光检测,以荧光强度的高低来判断PCR循环后产物中的核酸水平。(3)新型冠状病毒基
因编码多个结构蛋白,这些蛋白包括多个抗原位点,利用抗原与抗体特异性结合的原理,可
通过抗体检测抗原的存在,从而直接证明样本中含有新型冠状病毒,间接证明机体感染与否。
2.“实时荧光定量qPCR”是新冠疫情防控的一把利刃,通常在1~2 h内即可得到检测结
果。TaqMan探针是实时荧光定量RT—PCR技术中一种常用探针(如图1),其5′端连接荧
光基团(R),3′端连接淬灭剂(Q)。当探针完整时,R发出的荧光信号被Q吸收而不发荧光。
在PCR扩增过程中,当Taq DNA聚合酶遇到探针时会使探针水解而释放出游离的R和Q,
R发出的荧光信号被相应仪器检测到,荧光信号的累积与 PCR产物数量完全同步(如图2)。
请据图回答:
(1)结合图1和图2分析,“荧光RT—PCR技术”所用的试剂盒中通常都应该含有________
酶、________________________________________________________________________酶、
TaqMan探针、引物、dNTP、Mg2+、缓冲剂等。这种分子层面的荧光RT—PCR检测具有特
异性和灵敏性都很高的特点,主要与试剂盒中的_____________________________________、
________有关。
(2)根据TaqMan探针功能分析,探针中碱基序列的设计应主要依据____________。新冠病毒
(2019-nCoV)是冠状病毒大家庭中的新的一员,其碱基序列与引起SARS的冠状病毒碱基序
列有79.5%的相似性,与流感病毒碱基相似度也较高,因此在设计TaqMan探针时应筛选出
2019-nCoV特有序列,以避免________(填“假阴性”或“假阳性”)的出现。
(3) 根 据 图 1 和 图 2 , Taq DNA 聚 合 酶 除 了 能 催 化 DNA 子 链 的 延 伸 , 还 能
___________________。(4)若每分子探针水解释放的R基团荧光强度为定值a,则反应体系中某时刻荧光信号强度
(Rn)主要与____________、________________有关。在检测过程中,随着PCR的进行,反
应产物不断累积,“杂交双链”荧光信号的强度也等比例增加,增加了检测结果的准确性,
一般要达到或超过阈值时才确诊。可通过荧光强度的变化监测产生量的变化从而得到一条荧
光 扩 增 曲 线 图 ( 如 下 图 ) 。 “ 平 台 期 ” 出 现 的 最 可 能 的 原 因 是 试 剂 盒 中
________________________等有限,超出一定的循环数后,荧光标记的“杂交双链”不再增
加。
(5)虽然荧光RT—PCR是当前被广泛认可的检测手段之一,但是不断有“假阴性”现象报道,
通过上述过程分析,“假阴性”的可能原因有__________(填字母)。
a.通过咽拭子取样不规范或取样所获样本量不足
b.在样本运输、检测中出现了损坏和污染
c.病毒相应关键序列发生了基因突变
答案 (1)逆转录 Taq DNA聚合 引物 TaqMan探针 (2)新冠病毒RNA内部的一段序列
(或新冠病毒RNA逆转录形成的DNA的部分序列) 假阳性 (3)催化RNA(TaqMan探针)的
水解 (4)扩增次数 样品中病毒初始数量(或病毒样品模板RNA含量) 原料、引物和探针
数量(或Taq DNA聚合酶活性) (5)abc