下载说明
[软件名称]:DNAMAN
[界面语言]:英文
[下载链接]:见文末
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软件介绍
DNAMAN 是一款功能十分全面的生物信息软件。
DNAMAN 9.0 是一款由美国Lynnon Biosoft公司开发的综合性分子生物学与生物信息学软件,自1994年发布以来,经历了多次重大升级,已成为全球生命科学实验室中序列分析与分子克隆设计的标准工具。其核心优势在于将序列编辑、多重比对、引物设计、限制性酶切分析、序列组装以及系统发育分析等功能集成于同一图形界面下,用户无需在多个独立软件间频繁切换。该软件尤其适合从事基因克隆、载体构建、SNP检测、进化分析及序列数据库管理的科研人员,其强大的可视化能力与精确的算法可显著提升实验设计效率与数据解读的可靠性。版本特点:DNAMAN 9.0 在上一版本基础上引入了多项关键改进。它全面升级了序列比对引擎,支持同时比对超过5000条序列,并新增了基于隐马尔可夫模型的保守区域识别功能。该版本优化了引物设计模块,可自动评估引物二聚体、发卡结构及跨物种兼容性,并支持多重PCR引物批量设计。在序列组装方面,9.0版本增强了de novo组装算法,能处理Sanger测序与NGS长读长数据的混合组装。此外,软件新增了图形化质粒图谱编辑器,允许用户直接拖拽基因元件并实时更新酶切位点与开放阅读框注释。其多文档界面(MDI)与Undo/Redo历史记录功能也得到升级,大幅提升了长周期项目操作的容错性。支持格式:DNAMAN 9.0 支持广泛的分子生物学及通用文件格式。可导入的标准序列格式包括:FASTA (.fas, .fasta)、GenBank (.gb, .gbk)、EMBL (.emb)、GCG (.gcg)、SwissProt、PIR/NBRF以及纯文本序列。在导出方面,软件可将比对结果输出为CLUSTALW格式、PHYLIP格式、NEXUS格式、MSF格式、Rich Text Format (.rtf) 以及位图或矢量图(如TIFF, BMP, EMF)。同时,它能够直接读取ABI荧光测序仪产生的.ab1/.abi色谱文件,并支持从PDF中提取序列文本。对于质粒图谱,可导出为Adobe Illustrator兼容的.ai格式或Windows图元文件。使用流程:第一步:启动DNAMAN 9.0,点击“文件”菜单下的“新建序列”或直接拖拽FASTA文件至工作区,软件自动识别序列类型(DNA/RNA/蛋白质)。第二步:在序列编辑窗口中,使用工具栏的“查找”功能定位特定基序,或点击“分析”菜单下的“限制性酶切分析”生成酶切位点图谱,并保存为质粒图谱。第三步:若要执行多序列比对,选择“比对”菜单中的“多序列比对”,导入目标序列集,设置比对参数(如空位罚分与矩阵),运行后通过“保守性着色”功能直观评估同源区域。第四步:在比对结果基础上,点击“引物”菜单下的“引物设计”,输入扩增目标区域,软件自动输出候选引物列表并附带退火温度、GC含量及二级结构预测报告,确认后可直接导出引物序列用于合成。软件安装
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