98种R绘图模板|第04期

98种R绘图模板｜第04期

7个R语言SCI绘图模板：代码、数据/模拟结果与PDF预览整理

本期整理了 7 个 R 绘图模板，来源混合自生信常用分析图形和高分SCI图表复现两个系列。每个模板目录均保留代码与图片/PDF结果，适合公众号推文展示、课程资料整理和论文配图复现。

本期模板速览

模板逐一介绍

01｜聚类热图+注释

图形定位：热图/矩阵类。适合展示基因、样本、通路或多组学特征之间的整体模式。

区别解读：重点在颜色编码、聚类结构和注释层；复杂热图通常比普通热图多出分组、连线或局部放大。

• 代码文件：codes.R、生成PDF.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据说明：该目录当前未附真实数据，已保留可复现模拟绘图 PDF，方便先看效果再替换自己的数据。

• 展示文件：plots.pdf、模拟数据绘图.pdf。

02｜分块热图+注释

图形定位：热图/矩阵类。适合展示基因、样本、通路或多组学特征之间的整体模式。

区别解读：重点在颜色编码、聚类结构和注释层；复杂热图通常比普通热图多出分组、连线或局部放大。

• 代码文件：codes.R、生成PDF.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据说明：该目录当前未附真实数据，已保留可复现模拟绘图 PDF，方便先看效果再替换自己的数据。

• 展示文件：plot1.pdf、plot2.pdf、模拟数据绘图.pdf。

03｜分半小提琴图

图形定位：分布比较类。适合比较组间差异，同时展示离散样本点和总体分布。

区别解读：箱线图突出四分位，提琴图突出分布形状，蜂群/抖动散点更强调单个样本。

• 代码文件：split_violin_plot.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据文件：data.csv，适合按原目录结构复现示例结果。

• 展示文件：violin_plot2.pdf、violin_plot.pdf。

04｜复杂提琴图

图形定位：分布比较类。适合比较组间差异，同时展示离散样本点和总体分布。

区别解读：箱线图突出四分位，提琴图突出分布形状，蜂群/抖动散点更强调单个样本。

• 代码文件：violin_plot.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据文件：data1.csv、data2.csv，适合按原目录结构复现示例结果。

• 展示文件：violin_plot1.pdf、violin_plot2.pdf、violin_plot.pdf、参考文献.pdf、figs__903136bb10ffdda5b28c8b5f6b60ffb.png 等。

05｜富集分析气泡图进阶

图形定位：富集/相关性类。适合表达通路富集、显著性、相关性和基因数量等多维信息。

区别解读：气泡图用大小和颜色承载两类变量，富集分组图更适合横向比较多个实验组。

• 代码文件：GOBubble.R、生成PDF.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据说明：该目录当前未附真实数据，已保留可复现模拟绘图 PDF，方便先看效果再替换自己的数据。

• 展示文件：GOBubble1.pdf、GOBubble2.pdf、GOBubble3.pdf、GOBubble_ggplot1.pdf、GOBubble_ggplot2.pdf 等。

06｜雨滴图

图形定位：分布比较类。适合比较组间差异，同时展示离散样本点和总体分布。

区别解读：箱线图突出四分位，提琴图突出分布形状，蜂群/抖动散点更强调单个样本。

• 代码文件：codes.R、生成PDF.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据说明：该目录当前未附真实数据，已保留可复现模拟绘图 PDF，方便先看效果再替换自己的数据。

• 展示文件：模拟数据绘图.pdf、ggimage.png。

07｜瀑布图

图形定位：专用图形类。适合特定科研场景，如集合交集、组成比例、层级结构或全基因组关联。

区别解读：这类图形通常用途明确，关键是根据论文问题选择正确的数据结构。

• 代码文件：oncoplot.R、生成PDF.R，可直接作为 R 绘图模板修改参数和数据入口。

• 数据说明：该目录当前未附真实数据，已保留可复现模拟绘图 PDF，方便先看效果再替换自己的数据。

• 展示文件：onco_plot1.pdf、onco_plot2.pdf、onco_plot3.pdf、onco_plot.pdf、模拟数据绘图.pdf。

使用建议

• 优先查看 PDF 或图片效果，再打开 R 脚本替换自己的矩阵、分组或统计结果。

• 若目录中包含真实数据，可按原脚本路径直接复现；若仅有模拟 PDF，可将其作为排版和风格参考。

• 热图、气泡图、分布图和网络图适合组合成论文多面板图；专用图形则适合在结果章节中突出单个关键结论。