夜雨聆风学习资料网

ARTICLE · 1056843

IF6.6,又一标准网络毒理学模版

IF6.6,又一标准网络毒理学模版

IF6.6,又一标准网络毒理学模版

双酚A怎么一步步把肝病拖成肝癌,这篇网毒文章扒得挺透。

先用差异基因和共表达网络筛出18个候选基因。接着上6种机器学习算法交叉比对,最后锁定VIPR1、AURKA和CYP2C9这三个核心基因。

单细胞分析发现,这三个基因主要在肝细胞里活跃。有意思的是,虚拟敲除VIPR1后,免疫识别相关的通路明显被扰动。

往下深挖,双酚A并不影响YY1基因的转录,而是直接压低了它进细胞核的量。过表达YY1能部分挽回VIPR1的下调,说明这条调控轴确实在起作用。

反向药物筛选揪出了候选药Tasisulam。分子对接显示它能稳稳结合三个核心蛋白,体外实验也证实它能上调VIPR1并抑制癌细胞活力。

这套生信加湿实验的闭环,换个疾病组合就能复现一篇新文章。

原文IF6.6,又一标准网络毒理学模版!bulk→机器学习→单细胞虚拟扰动→DrugReflector药物筛选,3个月轻松拿下!
陕西,6小时前,

相关学习资料