让 Openclaw (小龙虾)来分析单细胞数据,数据来源最新的Nature主刊文章

当前时间： 2026-08-17 16:56:00 分类：办公文件评论(0)

让 Openclaw (小龙虾)来分析单细胞数据,数据来源最新的Nature主刊文章

CNS | 参考文献

文章数据下载

打开 GSE310446

选择要下载的数据

文件夹展示如下

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1.先告诉龙虾数据，确认数据是否存在

指令如下

你好我在电脑的E盘 peixun的文件夹下面有个loongxia的文件夹，文件夹中有个sc文件夹，文件夹中有GSE310446_RAW的文件夹，这个文件夹中的数据是nature文章中下载的单细胞数据，你可以看到吗

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小龙虾正确的识别到了单细胞数据的路径（我不小心longxia文件夹多写了一个o ，竟然也可以识别）

2.让龙虾读取数据和分析数据

请你直接开始分析，首先帮我读取单细胞的数据，然后对单细胞的数据进行指控，指控的参数就按照常规的默认参数就可以，接下来对数据进行降维聚类，最后进行umap的展示，展示的图要保存为tif

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我们去查看一下 umap有没有做好

聚类后的umap图结果展示

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3.注释单细胞数据

需要进行注释

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查看文件夹结果

注释的结果展示

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4.marker基因的气泡图展示

帮我展示top3的marker基因，并且用气泡图进行展示，气泡图的颜色要求是红色

让龙虾给我pdf的图片结果

输出了好多文件，包括代码和rdata的数据

marker基因的气泡图展示结果

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气泡图的颜色太浅了，帮我改为深红色

改完颜色的marker基因展示如下

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