夜雨聆风▼ 做您定制的类似分析，请与刘老师联系。
不做实验，也能发IF10+SCI？正在悄悄流行的文献计量分析，不仅是“论文捷径”，更是“基金申请外挂”！
引言
代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MAFLD）已成为最常见的慢性肝病，并且是终末期肝病的重要危险因素。翻译后修饰（PTMs）通过调控脂质代谢、炎症和纤维化等过程，在MAFLD的发病机制中发挥关键作用。本研究旨在对MAFLD中PTMs相关研究的发展趋势及知识空白进行系统性、数据驱动的分析。
本研究从Web of Science核心合集（WoSCC）数据库中检索了2005年至2024年间与MAFLD中PTMs相关的文献。利用CiteSpace、VOSviewer、R语言中的Bibliometrix以及大语言模型对数据进行了定量和定性分析。最终共纳入2401篇符合条件的文献。这些文献主要来自71个国家和2732个机构，年增长率为20.76%。中国在发文量方面位居首位（n = 902，占37.6%），而美国的总被引次数最高（n = 31,536）。共有15,948位作者参与了该领域的研究。其中，Jung, Tae Woo发表文章数量最多（n = 21），且总被引次数最高（n = 583）。期刊《Hepatology》发表的相关论文数量最多（n = 39）。
新兴研究主题包括“分子对接”、“泛素化”、“N6-甲基腺苷”、“乙酰化”、“甲基化”和“代谢”等。大语言模型揭示了MAFLD发病过程中涉及的多层面机制。本研究为该领域的全球合作格局、研究热点及前沿方向提供了重要见解，有助于为深入理解PTMs相关的MAFLD奠定基础。
该文2026年发表于International Journal of Surgery，约 13+, JCR: Q1
▼ 想发表自己的文献计量分析论文？点击👇获得更多高质量文献计量分析模板。
（👆经典文献计量分析模板，持续更新中）
以下分为三个方面进行解读。
一. 检索策略
数据来源与检索策略于2025年1月21日检索Web of Science核心合集（WoSCC）数据库（2005–2024年）。为避免数据库更新偏倚，所有数据在同一天完成检索并下载完整记录（TXT格式）。仅纳入Article和Review类型文献。检索策略及流程见补充材料。
文献计量分析将数据导入VOSviewer（1.6.18）、CiteSpace（6.1.6）及R软件bibliometrix包进行分析。利用Python中spaCy（en_core_web_sm）对关键词进行清洗。采用参考文献出版年光谱分析（RPYS）及Multi-RPYS方法，识别研究领域的历史发展与关键文献。
大语言模型分析基于Microsoft GraphRAG框架，结合siliconFlow云API调用DeepSeek-R1-Distill-Qwen-32B模型（2025-01-20），于2025年3月20日完成分析。知识图谱构建包括图谱提取、摘要、声明提取及社区报告等步骤，并启用自动调优。
为降低模型幻觉风险，一方面依托GraphRAG自身优化机制，另一方面通过人工抽样验证（双人核查），总体准确率达90.4%，并剔除错误实体。
在迭代过程中，引入自反思机制，通过二元判断（logit bias = 100）评估信息提取完整性。
二.主要结果
1. 基本信息的定量分析
共纳入2005年至2024年间发表的2401篇关于MAFLD中PTMs的文献（其中研究性论文2058篇，综述343篇）。主要信息的定量分析结果见表1，图2A展示了该领域年度及累计发文量。
发文总量由2005年的7篇稳步增长至2024年的252篇，年增长率为20.76%。2018年之前累计发文不足1000篇，随后5年发文量保持相对稳定。每篇文献平均被引次数为39.39次，年均被引频次为4.745次。每篇文章平均有8.58位作者，其中24.78%的文献存在国际合作。总体而言，来自71个国家的15,948位作者在全球600种期刊上发表了与PTMs相关的MAFLD研究成果。
2. MAFLD中PTMs的全球格局与合作动态
该领域相关研究已在71个国家开展。其地理分布见图2B，发文量排名前10的国家列于表2。如表2所示，中国在发文数量上位居首位（n=902，占37.6%），其次为美国（n=492，占20.5%）和韩国（n=199，占8.3%）。值得注意的是，前三个国家的发文量占总量的五分之三，显示出其在该领域的主导地位。
美国的总被引次数（TCs）最高（31,536次），远超其他国家。尽管中国发文量较高（n=902），但其篇均被引率（TC/NP：25.67）低于其他国家。在前10个国家中，加拿大的TC/NP最高（89.90），其次为美国（64.10）和意大利（58.48），提示这些国家尽管发文量相对较少，但研究质量较高。
此外，美国和中国在总被引次数方面始终保持领先地位。2005–2024年间各国年度发文量见图2C，其中中国的年发文增长率最高，其次为美国和韩国。补充材料图3（链接：https://links.lww.com/JS9/F469）展示了发文量前10的国家。
在合作方面，美国的多国合作论文（MCP）数量最多，而中国的单一国家论文（SCP）数量最多。基于VOSviewer的国家合作分析显示，各国之间存在广泛的国际合作，尤其是中国与美国之间的合作最为密切（图2D）。这些合作关系可能受到不同国家文化背景及学术环境的影响。
共有2732家机构参与了MAFLD中PTMs相关研究的发表。发文量排名前10的机构见图2。其中，发文数量最多的前四家机构分别为武汉大学（n=125）、加州大学系统（n=121）、复旦大学（n=106）和中国科学院（n=104）。前10家机构共发表963篇文章，占总发文量的40.11%。其中50%的机构来自中国，另外50%来自美国。机构合作网络可视化图见图2F，分析显示既存在国内合作，也存在广泛的国际合作。
该领域共有15,948位作者参与研究。如表3所示，Jung Tae Woo为最高产作者，共发表21篇论文，总被引583次（h指数：13）；其次为Jeong Ji Hoon，发表15篇论文，总被引257次（h指数：9）。
这两位高产作者均来自韩国。在其他高产作者中，3位来自中国，2位来自美国。前10位高产作者的年度发文趋势见图3A，其中Jung Tae Woo、Jeong Ji Hoon和Abd EL-Aty, A.M.在2018–2024年间最为活跃，而Shulman Gerald I.在2006–2018年间最为活跃。作者合作网络见图3B，展示了该领域多个研究团队及其相互关系。该网络分析表明，科研进展依赖于合作驱动，互利共赢的合作模式对于推动未来发展至关重要。
科研生产力通常以发文数量衡量，是评估作者科研能力和效率的重要指标，常用Lotka定律进行描述[37]。拟合的Lotka定律曲线见图3C，其中横轴为发文数量（x）的对数，纵轴为对应发表x篇论文的作者数量（Y）的对数。随着发文数量的增加，高产作者数量显著减少（图3C）。
关于MAFLD中PTMs的研究共发表于600种期刊。表4列出了发文量排名前10的期刊，这些期刊共发表434篇文章，占总发文量的18.2%。其中，Hepatology为发文量最多（n=39）且被引次数最高（n=5015）的期刊，其次为International Journal of Molecular Sciences（n=77）和Journal of Hepatology（n=52）。自2015年以来，International Journal of Molecular Sciences、Nature Communications和Nutrients的年发文量呈增长趋势，而PLOS ONE和Scientific Reports的发文量近年来有所下降。
我们采用双图谱叠加图（dual-map overlay）来展示期刊的学科分布（图3D）。图中左侧表示施引期刊，右侧表示被引期刊。不同颜色的连线代表不同学科领域，三条主要的引用路径通过线条粗细加以突出显示。
具体而言，绿色路径表明，发表于医学/临床类期刊的论文常被分子/生物/遗传学期刊引用；黄色路径则显示，分子/生物/免疫学期刊中的大多数文章主要被分子/生物/遗传学以及健康/护理/医学类期刊所引用。
表5列出了MAFLD中PTMs研究领域被引次数排名前10的文献，其被引次数范围为505至1489次。分析结果显示，发表于Comprehensive Physiology的“Energy metabolism in the liver”为被引次数最高的文章（n=1489）。发表于Cell（2021年）的“Mechanisms and disease consequences of nonalcoholic fatty liver disease”为第二高被引文章（n=974）。
共有68篇参考文献被纳入共被引分析，每篇文献至少被引用43次。从共被引网络图（图4A）可见，形成了4个具有较高可信度的主要聚类。表6列出了被共被引次数排名前10的文献，其中Kleiner DE等人发表的“Design and validation of a histological scoring system for nonalcoholic fatty liver disease”一文的共被引次数最高（n=291）。
突发检测（burst detection）可用于识别在特定时期内受到学术界高度关注的文献。引用突发强度排名前25的参考文献见图4B。
RPYS方法用于分析参考文献的时间特征，并追溯研究领域的历史根源。如图5A所示，黑色曲线表示被引文献的原始引用频率分布，红色波动曲线表示原始引用频率相对于5年中位数的偏差。2002年、2005年和2011年为峰值年份，其相对引用频率高于相邻年份，构成关键影响高峰。
图5B展示了MAFLD中PTMs研究的多重RPYS热图。图中纵轴表示施引文献的发表年份，横轴表示被引文献的发表年份。每个单元格的颜色由引用频率相对于5年中位数差值的排序转换值决定。1957年和1959年对应的单元格形成明显的深灰色“列或带”，表明这些年份在多个年份中具有较高的引用率。同样，1990年在连续4年内具有较高的引用率，而另一个时间段（文中重复，应为另一年份）在连续7年内也表现出较高引用率。这表明这些年份的历史文献属于该领域的经典文献。
4. 研究热点与趋势揭示主题演化
本研究从4201篇文献中提取了3876个作者关键词。通过对具有最强突发引用的关键词进行聚类分析，明确了MAFLD中PTMs研究的重要概念，并构建了相应的概念框架。如图6A所示，关键词被划分为10个不同颜色标识的聚类。诸如“MAFLD”（2021–2024）、“网络药理学”（2021–2024）、“肠道微生物群”（2020–2024）、“线粒体功能障碍”（2022–2024）、“肝脏炎症”（2022–2024）和“分子对接”（2022–2024）等关键词的突发持续至2024年，表明这些研究方向近年来受到广泛关注（图6B）。
各机构与国家在核心主题中的占比见图7A，展示了机构、国家与关键词之间的关联与分布。在机构层面，复旦大学和上海交通大学对“MAFLD”关注度较高；在国家层面，中国和美国在各研究热点中均占据重要地位。
通过多重对应分析（MCA）对领域概念结构进行分析，生成基于术语分布相似性的稳定二维图（图7B）。其中红色聚类代表研究最为集中的领域，而绿色和蓝色聚类则代表相对较少探索的方向。此外，我们还可视化了关键词随时间的变化趋势（图7C）。在过去5年中，“分子对接”“泛素化”“N6-甲基腺苷”“乙酰化”“甲基化”和“代谢”等成为新兴研究热点，这些方向有助于阐明疾病的病因、发病机制及临床意义。
我们进一步对2005年至2024年的主题演化进行了分析（图8）。将数据划分为四个阶段（2005–2009、2010–2014、2015–2019和2020–2024），并以2009、2014和2019为分界点。每个节点代表各时间段的主要主题，节点大小对应关键词数量，节点旁标注显示核心关键词及对应时间段。若两个时间段存在相同关键词，则以流线连接，其宽度反映主题之间的关联强度。
在早期阶段（2005–2009），研究主要集中于基础概念和初步探索，如“脂肪因子”“细胞凋亡”和“肝纤维化”。第二阶段（2010–2014）中，“MAFLD”成为核心主题，研究重点转向其发病机制，同时出现“脂解”“巨噬细胞”“糖组学”“生物标志物”和“癌症”等新主题。第三阶段（2015–2019）中，“线粒体功能障碍”和“MAFLD”为研究核心，主题进一步细化，出现“脂质生成”“脂肪酸氧化”和“PNPLA3”等新方向。第四阶段（2020–2024）中，研究更加深入至分子生物学和生物化学层面，重点关注“甲基化”“乙酰化”“磷酸化”等修饰机制。
5. 基于大语言模型的知识图谱揭示MAFLD发病机制的多维特征
基于大语言模型（LLMs）构建的知识图谱为MAFLD复杂相互作用提供了全面视角。如图9所示，每个圆圈代表一个实体，其大小表示该实体的连接程度（度），颜色表示其所属的社区。MAFLD位于中心节点，作为枢纽连接多个分支，包括多种风险因素、分子机制、环境因素及干预措施。
首先，知识图谱突出显示了与MAFLD相关的多种危险因素和环境暴露，如高脂饮食、吸烟、肥胖和糖尿病。其次，图中还展示了多种关键分子，包括但不限于PPARα、AMPK、SIRT6、FASN、TRIM56、FGF1、JNK和NLRP3。此外，还识别出多种潜在治疗药物和干预措施，如利拉鲁肽（liraglutide）、甜菜碱（betaine）、二甲双胍（metformin）、维生素E、抗氧化剂及抗炎药物。
同时，该图谱揭示了这些节点之间的因果关系。例如，在绿色聚类中，展示了利拉鲁肽、AMPK与脂质代谢之间的相互作用。这些研究为深入理解MAFLD的发病机制提供了新的视角，并为开发新的治疗策略提供了潜在靶点。
三. 讨论（简化）
PTMs在细胞信号传导及蛋白功能调控中发挥关键作用。本研究通过多种文献计量工具系统分析了MAFLD中PTMs的研究进展，共纳入2005–2024年间来自71个国家、600种期刊的2401篇文献。
结果显示，中国和美国在该领域占据主导地位。中国发文量最多，但美国在总被引次数和篇均影响力方面更具优势。尽管部分国家发文量较少，但其研究质量较高。合作模式方面，美国以国际合作为主，而中国以国内合作为主，提示未来需加强跨国合作并提升研究质量。
高被引文献主要集中于MAFLD发病机制，尤其是PTMs在脂质代谢、线粒体功能及胰岛素敏感性中的调控作用。AMPK介导的磷酸化及sirtuin相关的乙酰化被认为是关键机制，其失调可推动MAFLD进展。因此，PTMs被认为是潜在的重要治疗靶点。
学科发展呈现从临床研究向分子机制研究转变，并逐步扩展至健康管理和综合干预。近年来，MAFLD概念的更新及其流行病学研究推动了该领域的发展。
时间演化分析显示，2002年、2005年和2011年为关键发展节点，对疾病定义、病理评估及发病机制研究具有里程碑意义。
此外，“分子对接”“泛素化”和“m6A修饰”成为新兴研究热点。这些方向有助于揭示MAFLD的分子机制，并推动精准治疗策略的发展。
最后，本研究引入基于LLMs的GraphRAG方法构建知识图谱，整合关键分子、通路及干预策略，揭示了MAFLD的多维调控网络，为未来机制研究和靶向治疗提供了新思路。
编者按｜从一项文献计量研究，看MAFLD中PTMs研究的进阶路径
这篇聚焦“MAFLD中蛋白质翻译后修饰（PTMs）”的研究，并非传统意义上的综述，而是一种典型的“数据驱动型整合研究”：以文献计量学为起点，系统描绘领域结构与演化路径，再结合多组学热点与分子机制解析，最终通过知识图谱回归疾病本质与潜在干预靶点。这种“结构识别—机制下探—系统整合”的研究范式，正逐渐成为高水平综述的重要方向。
从研究设计来看，该工作至少带来三点方法论启示：
其一，问题要“系统化”，而非“碎片化”。单一PTM类型或单一通路的研究已较为成熟，而围绕“PTMs×代谢重编程”“PTMs×炎症网络”“PTMs×表观遗传”等系统性问题，更有助于揭示疾病的整体调控网络，形成更具解释力的研究框架。
其二，研究要“可计算”，而非“纯经验”。通过文献计量学、突发分析、主题演化及知识图谱等方法，研究不再停留于经验性总结，而是具备了定量分析与结构挖掘能力。这种“准研究化综述”正在成为高影响力论文的重要特征。
其三，构建“多层级机制网络”。从流行病学与研究热点出发，延伸至分子机制（如泛素化、m6A修饰、磷酸化等），再连接潜在干预策略（如AMPK通路、代谢调控药物），形成“现象—机制—靶点”的闭环逻辑，是当前高分研究的核心能力。
进一步来看，该研究还提示未来的重要发展方向：一是深化PTMs之间的“交叉调控”（如泛素化与m6A的互作）；二是结合多组学与AI技术，构建系统性调控模型；三是推动从机制发现向临床转化（靶向PTMs的治疗策略与生物标志物）过渡。
从更宏观的角度看，该领域的竞争正从“谁发现更多分子”，转向“谁能构建更完整的机制网络”。对于研究者而言，真正的突破不在于增加变量，而在于重构问题，并用数据与方法将其解释清楚。
原文链接：
广而告之：
如果您也需要对自己公司的产品或者对自己研究的领域做系统梳理，可以找美国Healsan恒祥医学科技做文献计量分析。并可同时获赠五个仅Healsan™大数据才有的福利：
文献检索老师参与学员选题的文献检索； 完成分析后，免费使用SCI论文神器10天，以完成论文撰写； 作者撰写好之后，获得免费查重； 作者投稿前，获得免费的选刊服务。
（点击👆，获得持续的医学大数据分析报告）
 | |
 |  |
 |  |
 |  |
（点击👆图片，进入自己感兴趣的专辑。或点击“资源”，浏览本公众号所有资源）
