下载说明
[软件名称]:Chromas
[界面语言]:英文
[下载链接]:见文末
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软件介绍
Chromas 是一款功能十分全面的生物信息软件。
Chromas 1.2.6 是一款专为生物信息学与分子生物学领域设计的色谱图查看与编辑工具,广泛应用于Sanger测序数据的可视化与质量控制。该软件由Technelysium公司开发,以其轻量化、高效稳定的特性,成为实验室处理ABI格式测序数据的经典选择。Chromas 1.2.6版本能够直接读取测序仪生成的原始电泳色谱文件,清晰展示每个碱基的荧光信号峰图,支持手动校正碱基识别错误、评估序列质量、截取有效片段,并可将结果导出为多种通用格式。对于从事基因克隆、突变检测、序列比对及遗传分析的科研人员而言,Chromas是保障测序数据准确性的基础工具。版本特点:
1. 2.6版本的核心功能与特性包括:
支持直接打开ABI 1.0至3.0格式的测序色谱文件(.ab1, .fsa),无需额外转换。
提供高分辨率的色谱峰图显示,每个碱基以不同颜色标识(A绿色、T红色、G黑色、C蓝色),便于人工判读。
内置自动碱基识别引擎,可对原始信号进行质量评分,并在低置信度区域以“N”标注。
允许用户手动编辑碱基序列:点击峰图即可插入、删除或替换碱基,并实时更新序列文本。
支持序列截取功能,可去除两端低质量信号区域,保留核心分析片段。
具备序列反向互补、翻译为氨基酸序列、查找开放阅读框等基础分析功能。
可导出色谱图与序列文本,支持打印及图像复制,便于报告制作。
界面简洁,响应速度快,对系统资源占用极低,兼容Windows各主流版本。
支持格式:
Chromas 1.2.6能打开和导入的文件格式包括:
.ab1(Applied Biosystems AB1格式)
.fsa(Applied Biosystems FSA格式)
.scf(Staden色谱图格式)
.txt(纯文本序列文件)
可导出的文件格式包括:
.seq(Chromas自有序列格式)
.txt(纯文本序列)
.fas(FASTA格式)
.scf(Staden色谱图格式)
.abi(ABI格式副本)
同时支持将色谱图以位图图像形式复制到剪贴板或保存。
使用流程:
第一步:启动Chromas 1.2.6,点击“File”菜单选择“Open”,在文件浏览器中定位并选择待分析的.ab1或.fsa格式测序色谱文件,点击“打开”载入数据。
第二步:软件自动显示色谱峰图及对应的碱基序列,检查序列两端的质量信号,若出现连续低质量峰(如波形杂乱或信号弱),使用鼠标拖拽选择目标区域,点击“Edit”菜单下的“Trim”功能进行截取。
第三步:若发现碱基识别错误(如峰图重叠或错位),将鼠标指针移至对应峰图位置,直接点击键盘上的正确碱基字母进行替换,或使用右键菜单进行插入与删除操作。
第四步:完成编辑后,点击“File”菜单选择“Export”,根据需要选择导出为FASTA格式用于后续序列比对,或导出为文本格式用于报告撰写。建议同时保存一份.seq源文件,以便后续再次调整。
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