DIA-NN 引擎源码考古：定量端上桌

跑完 DIA-NN 打分这一步，手里拿到的其实还不是最终报表。

每个样本各出一份名单和定量值。最后得合成一张总表，中间要清掉蹭信号的、再把各样本的量拉平。

先除渣。 两条肽段共洗脱又共隔离，碎出来的信号撞了车。高分那条占主场，低分那条要是共享通道能解释掉自己大半峰形，就直接作废。默认只挤一轮，想多挤几轮命令行里都有旋钮。

再算账。 一条肽段最多取排头 6 个碎片离子，峰面积直接加和。跨样本还要做三步归一化：先拉平总量，再挑低变异肽段校准，最后按出峰时间微调。原始量和归一量并排留着，嫌引擎拉不好，回头自己拿原始量重算也行。

往上汇总。 蛋白量直接取名下最强几条肽段相加，基因层再用 MaxLFQ 补缺失值。最后前体、蛋白组、基因分组各写一张报告，宽表默认不出，得单独开参数。

这套动作从找峰一路走到落盘，账就是这么一笔笔结清的。

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