Image J软件下的线粒体统计线粒体由内、外两层膜构成,内、外两层膜之间形成线粒体外室,内膜围成的腔隙形成线粒体内室,内膜向内室方向突起、折叠形成线粒体嵴,嵴两侧膜形成的空隙为与外室相通的嵴间隙。
(1)外膜:厚约6~7nm,由蛋白质和脂类约1:1构成,可随意透过10000Da分子量物质。(2)外室:宽约10nm,含多种酶和其他底物。(3)内膜:厚约7~8nm,由蛋白质和脂类约3.8:1构成,分子量大于150Da物质不易透过,具有高度选择透过性。(4)内室:充满基质,电子密度高于外室,基质中含有线粒体DNA、核糖体等。(5)嵴:内膜褶叠形成。
图片源自《细胞超微结构与超微结构病理基础》王春梅主编
透射电镜是线粒体观测的一种极佳手段,可有效观测到线粒体形态学改变。透射电镜切片厚度为70nm,相当于将“花生状”的立体线粒体随机抽取了一张厚70nm的平面薄片,由于截面截取的随机性,导致单个线粒体形态的观测出现部分偏倚。因此,全面统计线粒体数量、长/宽比、面积、周长、灰度值等信息对于科学研究至关重要。Image J软件一款由NIH开发的一个基于java环境的免费图像处理软件,并于2021年被Nature评为十大影响科学代码之一。我们将以此软件为工具,探究线粒体多个统计量的实操方法。下载官网:https://imagej.net/ij/index.html图片源自Image J官网
(2) 软件内加载打开目标电镜图片(若图片格式不兼容软件,可使用格式工厂对图片格式转化为.jpg)按照标尺长度在Known distance填入0.5,Unit of Length填入μm→勾选Global→点击OK勾选Area(面积)/Mean gray value(平均灰度值)/Perimeter(长度)→点击OK
(二)目标测量Plugins→Analyze→Cell Counter点击Initialize→勾选Type1点→选择软件主界面点状工具依次点击图片内的线粒体,选中的线粒体可见红色圆圈内“1”的标记,与此同时上一个命令框内Type1数字计数为5,代表选中的线粒体计数为5Edit→Selection→Add to Manager,出现ROI Manager设置框→勾选Show All点击Add则出现篮框内信息,即说明描线区域内信息已经加载选中描线区域项目,点击Measure,计算结果,代表选中线粒体面积为2.023μm2,周长为5.152μm,平均灰度值为102.160(注意:灰度值范围为0至255,颜色越黑值越小,越白值越大)按照上述方法打开ROI Manager设置框,选择主界面直线工具对目标线粒体长轴画直线→点击Add,出现长轴项目编号(蓝色框)类似的,对目标线粒体短轴画直线→点击Add,出现短轴项目编号(绿色框)→点击Measure计算结果,说明选中线粒体长轴为1.335μm,短轴为1.036μm,长宽比计算后为1.289
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