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XP 软件常用测量指令

XP 软件常用测量指令

测量不相连原子间的距离

>>envi_ n
(该命令可以求出距离该原子n倍正常键长范围内所有原子与该原子的距离,并且给出所有以该原子为中心的各连线之间的夹角)

测量二面角

>>read _(读取文件名)
>>fmol _ _ _ _ …(输入两个面上的原子)
>>mpln _ _ _ …(输入a面的原子)
>>mpln _ _ _ …(输入b面的原子)

测量两个平行平面间距

>>cent/x _ _ _ …(输入a面的原子)
>>mpln _ _ _ …(输入b面的原子)
(该命令可以求出a中心一点x1a到b面的垂直距离)

测量π-π堆积作用力

(先计算a面和b面间的二面角夹角为0,才可进一步计算π-π作用)
>> cent/x _ _ _ …(输入a面的原子)
>> cent/x _ _ _ …(输入b面的原子)
>>envi x1a x1b
(一般小于3.8Å可以判定存在π-π堆积作用)

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