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AI 工具轻松拿下 GEO 分析
AI 工具轻松拿下 GEO 分析
用 AI 跑 GEO 分析，成败基本取决于 Prompt 有没有交代清楚三件事：数据从哪来、按什么流程做、要产出什么。下面这三段可以直接抄。
一、先解决"有没有数据"
如果当前目录没有可用的 GEO 数据，请自动下载一个公开、轻量、分组清晰的 GSE 表达数据集，并保存原始数据与表达矩阵到本地。
二、规定分析流程
请按经典 GEO 分析流程执行：GEO 数据获取 → 表达矩阵整理与样本分组 → 质控/标准化 → 差异表达分析（DESeq2/edgeR/limma 任选合适方法）→ 差异基因筛选与结果整理。
三、规定产出物
请生成并保存主要结果文件和图表，包括差异表达结果表、火山图、热图，以及可选的 GO/KEGG 富集分析结果，并用简洁中文总结数据集来源、分组设计、分析方法和核心发现。
实测过程与结果
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