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分子模拟||Pymol开源版安装步骤及教程

分子模拟||Pymol开源版安装步骤及教程

一篇优秀的文章,清晰、直观的结果图是不可或缺的,文献中经常可以看到该图由Pymol生成。

Pymol是一个开放源码的可视化软件,通常被用来创作高质量的分子3D结构图。“Py”表示该软件基于Python环境,那么本教程就从Python环境配置开始。

01

Python环境配置

1.首先进入Python官网的下载页面:

(https://www.python.org/downloads/windows/)

根据操作系统选择合适的版本进行下载

2.双击安装包进行安装

安装路径设置为默认路径C:\Python27\(如要进行更改,要保证路径下均为英文)。安装过程中始终Next即可,出现Finish时安装完毕,接下来就是配置环境变量。

3.右击我的电脑,选择属性-高级系统设置

在环境变量中加入Python的路径,即全部安装完成。使用“WIN+R”组合键打开“运行”窗口,输入“cmd”打开命令端口,输入python -V,验证是否安装成功。

02

安装Pymol

1.通过网址下载Pymol的wheel文件以及必须的wheel文件

(https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pymol-open-source)

2.将下载好的三个文件放在一个英文路径下的文件夹中,在目录下进入cmd界面,依次输入:

C:\Python27\python.exe -m pip install C:/pymol/numpy-1.16.6+mkl-cp27-cp27m-win_amd64.whlC:\Python27\python.exe -m pip install C:/pymol/pymol-2.1.0-cp27-cp27m-win_amd64.whlC:\Python27\python.exe -m pip install C:/pymol/pymol_launcher-2.1-cp27-cp27m-win_amd64.whl

出现successfully installed字样说明安装成功

3.在Python文件夹下出现pymol的应用程序,双击即可进入软件中进行制图。

END

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