自由职业的第300周记录–宏基因组说明–2026-04-13~2026-04-19

宏基因组的流程咨询的挺多，都是推荐给一个朋友处理，是10几个人的公司，有服务器，价格公道，性价比也高，也能根据提供的文章实现流程复现~

一直都没想弄宏基因组流程课程（周期太长，有一些软件兼容性，处理起来麻烦）之前就接过一次流程搭建（国外大学的，下载比较稳定），差不多收了5000，其他都没接，国内下载数据库很麻烦，容易中断损坏；

需要摸索可以参考：

宏相关的就录制了这么多

https://www.bilibili.com/video/BV1hP411V7Ey/?spm_id_from=333.999.0.0

学完多样性了，准备开始学宏基因组了？那我分享一丢丢类比经验~kegg简单介绍(9分45秒开始就介绍kegg)~

宏基因组就是多了不同数据库注释的功能表格或者binning，或者联合分析

通过组装去冗余得到非冗余基因集，再对非冗余基因集进行物种、功能注释，从而得到物种和功能的对应关系，再画图

https://www.bilibili.com/video/BV1tU4y1Y73b/?spm_id_from=333.999.0.0

生物信息工程师的工作内容之一就是测试一些软件与流程-宏基因组数据分析里humann3的测试，和humann2差不多用法

https://www.bilibili.com/video/BV15t4y1W78o/?spm_id_from=333.999.0.0

宏基因组binning里16s rRNA的提取 5s 23s-barrnap的下载与应用

https://www.bilibili.com/video/BV1Wt4y1N7da/?spm_id_from=333.999.0.0

宏基因组-流程测试1-squeezeMeta-介绍篇

https://www.bilibili.com/video/BV1A14y1n7WP/?spm_id_from=333.999.0.0

宏基因组–流程测试2-squeezeMeta-2个样品混拼记录分享