医学AI前沿交叉论坛·清华 x 博士:AI 蛋白设计与 AIDD 全景深度解析

小罗碎碎念

当AI彻底破解蛋白质折叠的百年谜题，生命科学已经从“解读序列”的观测时代，迈入了“按需设计蛋白”的造物时代。

从创新药研发到合成生物学，AI驱动的蛋白质设计与AIDD（人工智能辅助药物研发），正在重构生物医药产业的底层逻辑。

本期前沿交叉论坛，将由我们团队的x博士（清华大学），带来《蛋白设计与AIDD：从序列到结构的全景解析与应用》主题分享。

x博士将深耕该领域的多年研究积淀与顶刊成果经验，系统拆解领域发展脉络、核心技术体系与产业落地全景，为所有关注该领域的同仁，带来一场兼具理论深度与产业前瞻性的专业分享。

一、本次讲座适配人群

高校及科研院所科研人员与在读学生

涵盖分子生物学、结构生物学、生物信息学、合成生物学、计算生物学、药物化学、AI for Science等相关专业的师生。

无论你是正在搭建课题研究框架，还是寻求领域前沿研究思路，都能通过本次讲座系统掌握领域发展脉络、核心工具使用逻辑与顶刊级研究范式。

生物医药与生物技术产业从业者

聚焦创新药研发、AI制药、抗体工程、酶制剂、合成生物学相关企业的研发、项目管理、BD与战略规划人员。

通过本次讲座可全面掌握AI蛋白设计在靶点验证、药物分子设计、亲和力成熟、成药性优化等核心环节的落地方法，同步了解行业前沿技术路线与标杆应用案例。

生物科技领域投资与产业规划从业者

包括聚焦生物医药、硬科技赛道的投资机构合伙人、分析师，以及产业园区、政府相关部门的产业规划与招商人员。

讲座将清晰拆解AI蛋白设计赛道的技术壁垒、产业价值链条与未来发展趋势，助力精准判断赛道核心机会与产业布局方向。

AI for Science交叉领域爱好者

涵盖人工智能、深度学习领域的算法工程师与从业者，以及关注生命科学前沿交叉领域的爱好者。

讲座将打破学科壁垒，用通俗的逻辑拆解AI在生命科学领域的核心应用原理，帮你快速建立交叉领域的完整认知体系。

二、讲座核心内容

本次讲座以“从序列到结构”为主线，从基础科学本源出发，完整覆盖蛋白设计与AIDD领域的发展历程、核心技术、前沿应用三大核心板块，具体内容如下：

板块一：蛋白质研究百年征程，与AI驱动的范式转折

本板块将帮你搭建领域完整的认知框架，厘清技术发展的核心脉络，核心内容包括：

蛋白质研究的科学本源

从安芬森实验、莱文塔尔悖论出发，拆解“氨基酸序列决定三维结构，三维结构决定生物学功能”的核心底层逻辑；

领域发展的实验与数据奠基

梳理X射线晶体学、冷冻电镜等核心实验技术的价值，以及PDB数据库成立对计算生物学发展的里程碑意义；

传统方法的瓶颈与突破

解析CASP竞赛的行业价值，对比同源建模、物理模拟、从头预测等传统方法的优势与局限，讲清协同进化规律的发现如何为深度学习入局打开窗口；

行业范式的颠覆性跨越

从AlphaFold2解决蛋白质折叠问题，到AlphaFold3实现多分子体系的统一预测，完整拆解行业从“结构预测”到“蛋白质逆向设计”的核心转折，厘清从“读懂生命”到“创造生命”的底层逻辑变革。

板块二：AI蛋白质设计的核心技术路线，与全流程设计闭环

本板块将深度拆解当前行业通用的“骨架生成-序列设计-全分子验证”全流程技术体系，讲透三大核心工具的能力边界与应用逻辑，核心内容包括：

骨架生成：RFdiffusion的技术演进与应用场景

拆解RFdiffusion从基础骨架模型，到全原子通用模型，再到酶设计专属模型的三代迭代路径，对比不同版本的核心优势、解决的行业痛点与自身局限性，同时结合流感病毒HA结合蛋白设计等标杆案例，解析其在从头蛋白设计中的核心价值。

序列设计：ProteinMPNN的逆向折叠核心能力

解析ProteinMPNN作为行业标杆级序列设计工具的核心架构，讲清其极速、高鲁棒性的序列设计逻辑，对比其与传统方法的性能优势，同时分享其在单体蛋白设计、蛋白复合物界面优化等场景的落地应用方法。

全分子验证与设计：AlphaFold3的能力升级与适用边界

对比AlphaFold3与前代模型的架构差异，拆解其在蛋白-小分子、蛋白-核酸、抗原-抗体复合物等场景的预测精度突破，同时明确不同分子体系的预测置信度判断方法，厘清“大胆尝试、谨慎尝试、不要尝试”的三大应用边界，为实际研发工作提供可落地的参考标准。

全流程设计闭环：完整呈现“骨架生成-序列设计-结构验证-功能优化”的AI蛋白设计全链条逻辑，帮你建立可落地的技术应用体系。

板块三：AI蛋白设计的科研前沿突破，与产业落地全景应用

本板块将结合顶刊前沿成果与产业标杆案例，拆解技术的实际落地价值，同时展望行业未来发展趋势，核心内容包括：

创新药发现领域的颠覆性应用

分享AI从头设计迷你蛋白抑制剂在抗病毒、抗毒素领域的突破性成果，包括新冠病毒抑制剂、蛇毒中和蛋白等标杆案例的设计逻辑与实验数据；同时解析AlphaFold3在抗体设计、亲和力成熟、药物虚拟筛选等环节的落地方法，拆解AI如何突破传统抗体药物的研发边界，大幅缩短药物研发周期。

功能蛋白创造的前沿突破

针对传统方法难以攻克的“不可成药”靶标，解析RFdiffusion部分扩散、双侧扩散等技术在平坦蛋白表位、固有无序蛋白、多肽激素等场景的设计突破；同时分享从头酶设计的最新进展，以及功能蛋白在合成生物学、工业生物催化等领域的广阔应用前景。

行业研发新范式与未来展望

拆解“AI计算设计+高通量湿实验”的闭环研发体系，分享从序列设计到酵母展示筛选、结合力验证、结构解析的全流程落地方法；同时梳理行业技术发展趋势，解析AI蛋白设计赛道的核心机遇与挑战。

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讲座时间

2026年4月26日（周日） 19:00

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这是一场兼顾理论深度、技术实操与产业视野的专业分享，邀你一同见证AI驱动的生物造物革命，把握生物医药领域的前沿机遇。