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AutoDock下载安装教程【超详细】保姆级图文教程(附安装包)
前言
在分子对接研究中，autodock下载安装一直是初学者面临的第一道门槛。如果你正在为如何获取并安装这款强大的分子对接软件而发愁，那么恭喜你找到了正确的地方！这篇教程将带你一步步完成autodock安装全过程，即使你是小白也能轻松上手。我花了几天时间整理了最新的autodock下载方法，确保你能顺利完成安装，赶快收藏起来吧！
autodock安装前准备
先说重点！安装前请一定要退出所有第三方杀毒软件或安全卫士，不然可能会出现各种奇怪问题，我之前就栽在这上面了，折腾了好久。
autodock下载地址
https://pan.quark.cn/s/a978f1badf21
autodock安装步骤详解
整个安装分为三大步骤：Python环境配置、AutoDock主程序安装和MGLtools工具安装。一个都不能少，缺了哪个都无法正常使用。
安装Python环境
首先要安装Python，AutoDock需要Python环境才能正常运行：
1、右击打开安装包中的"python-2.7.11.amd64"，没错，是2.7版本，别安装最新版！
2、选"Install for all users"，点"Next"，这样所有用户都能用：
3、安装位置千万别改！直接点"Next"继续：
4、一定要勾选"Add python.exe to Path"，不然后面环境变量还得手动配，点"Next"：
5、耐心等待安装完成：
6、看到这个界面就表示Python安装完成了，点"Finish"：
7、现在我们需要检查下环境变量，右击此电脑-属性：
8、找到并点击"高级系统设置"：
9、点击"高级-环境变量"：
10、在系统变量区域找到"Path"，点击"编辑"：
11、点"新建"，添加这两个路径："C:\Python27"和"C:\Python27\Scripts"：
12、按Win+R组合键，输入"cmd"，回车打开命令提示符：
13、输入"python --version"命令，如果显示版本号就说明Python安装成功了！
安装AutoDock主程序
Python装好后，我们来安装AutoDock主程序：
1、找到"autodocksuite-4.2.6.i86Windows"文件，右击选择"以管理员身份运行"：
2、修改安装路径（记住这个路径，后面要用！路径中不能有中文！），然后点"Install"：
3、等待安装完成，点击"Close"关闭安装程序：
安装MGLtools工具包
最后安装MGLtools，这是AutoDock的图形界面工具：
1、找到"mgltools_win32_1.5.7_Setup"，右击选"以管理员身份运行"：
2、点"Next"继续：
3、勾选同意协议，点"Yes"：
4、安装路径绝对不能改！直接点"Next"：
5、安装中，稍等片刻：
6、弹出窗口，点"OK"：
7、取消勾选第一项，勾选第二三项，点"Finish"：
8、安装完成后，桌面会出现四个快捷方式，它们各自的用途是：
·PMV：分子可视化和分析工具，相当于3D分子模型查看器
·AutoDockTools (ADT)：用于准备分子对接实验，这是我们最常用的
·Raccoon：用于批量分子对接，适合筛选大量化合物
·Vision：用于创建复杂的工作流程，高级用户才会用到
AutoDock配置设置
最后一步，我们需要把所有东西连接起来：
1、在D盘新建一个文件夹，命名为"Autodock-setting"：
2、找到刚才安装的Autodock程序路径，复制这两个程序到D盘的Autodock-setting文件夹：
3、找到MGLTools的安装路径，复制"adt"文件夹到D盘的Autodock-setting文件夹：
4、打开桌面上的AutoDockTools，点击"File-preferences-set"，将D盘Autodock-setting文件夹的路径填入startup directory，点"make default"设为默认：
大功告成！至此，autodock下载安装教程全部完成，你已经成功安装了这款强大的分子对接软件。第一次用可能会觉得步骤有点多，但按照教程一步步来绝对没问题。如果对你有帮助，别忘了收藏哦！
AutoDock入门使用技巧
对于初次接触分子对接的研究者，以下是一些实用技巧：
1.准备配体文件：首先需要将你的小分子转换为PDBQT格式。在AutoDockTools中，选择"Ligand"菜单下的"Input"，然后选择"Open"，选择你的小分子文件（如PDB格式）。然后点击"Ligand"菜单中的"Output"，选择"Save as PDBQT"保存。
2.准备受体文件：类似地，打开你的蛋白质结构文件，选择"Grid"菜单下的"Macromolecule"，选择"Open"，再点击"Select"，最后点击"Edit"菜单中的"Charges"，选择"Add Kollman Charges"，然后保存为PDBQT格式。
3.设置对接区域：使用"Grid"菜单中的"Grid Box"设置对接盒子，确保覆盖了活性位点区域。记下盒子的坐标和大小，这些参数在后续对接中会用到。
4.运行对接：使用"Docking"菜单中的"Docking Parameters"设置对接参数，如遗传算法参数、评分函数等，然后点击"Run"开始对接。
5.结果分析：对接完成后，可以在AutoDockTools中加载对接结果文件（.dlg），分析不同构象的得分和结合模式。
准备配体文件：首先需要将你的小分子转换为PDBQT格式。在AutoDockTools中，选择"Ligand"菜单下的"Input"，然后选择"Open"，选择你的小分子文件（如PDB格式）。然后点击"Ligand"菜单中的"Output"，选择"Save as PDBQT"保存。
准备受体文件：类似地，打开你的蛋白质结构文件，选择"Grid"菜单下的"Macromolecule"，选择"Open"，再点击"Select"，最后点击"Edit"菜单中的"Charges"，选择"Add Kollman Charges"，然后保存为PDBQT格式。
设置对接区域：使用"Grid"菜单中的"Grid Box"设置对接盒子，确保覆盖了活性位点区域。记下盒子的坐标和大小，这些参数在后续对接中会用到。
运行对接：使用"Docking"菜单中的"Docking Parameters"设置对接参数，如遗传算法参数、评分函数等，然后点击"Run"开始对接。
结果分析：对接完成后，可以在AutoDockTools中加载对接结果文件（.dlg），分析不同构象的得分和结合模式。
通过以上教程和技巧，相信你已经能够熟练使用AutoDock进行分子对接研究了。祝你科研顺利！