我用AI助手Biomni Lab完成了RNA-seq分析

生信小白，使用AI助手完成了一次转录组差异分析。

文末附报告文件，供大家对比体会。

最近拿到了RNA-seq的raw数据，目的是看实验组和对照组的转录组差异，算是个简单的需求。

本来还在B站看了一段视频学习RNA-seq的视频，学习技能，终究还是AI更省时、便捷。

Biomni Lab上线，已经3月初的事儿了，开了个号，创始人Kexin还邮件联系了反馈。

Biomni Lab是Phylo Bio的一款AI产品，创始人和站台大佬，都认识哈。

真正做task，转眼就快3个月之后了。

交互界面中英可选。

该助手已经嵌入了57个数据库（我目前常用主要是genomics和structure类别），79个工具（我目前主要用Structure Prediction和genomics分析的几种），107个软件包（我感觉这个是根据自己给助手设置的workflow设置自动调取执行的），对于分析过程用了什么，基本可以从trace记录回溯到。

给指令时，可以上传需要分析的seq数据包、选定skills。

其中调用的skills：

Run differential expression analysis between treatment and control groups in my bulk RNA-seq dataset. Identify significantly upregulated and downregulated genes. 

可以从交互页面看到整体workflow的执行进程、调用等。

本次试用，上传了2个样品的RNA-seq数据包，因为是双端测序，共有4个fastq.gz文件。

任务报告包含分析、火山图、GO图等，同时也有csv文件，可满足后续自由作图需求。基本和绝大部分测序公司提供的生信服务相当。

叠加中间部分指令选项，总耗时近2小时，不太好比长或是短，因为以前的确没跑过。

从Biomni的分析看，硬件和软件都会影响。

耗时分析：

感觉可能是自己电脑的硬件空间中间影响了部分代码和任务的执行，AI只能自动找备选方案。

对硬件的需求：

HPC

目前free版，简单任务应该是满足的，但每天有使用限制，这目前也是AI助手普遍的设置，培养你尽快充钱升级plus会员。

100美刀一个月，对生物学研究人高了，因为工资低啊！！！

AI人不懂生物人的money痛！

20260515-Biomni Lab-RNA seq.pdf