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(本周五开课)创新方向+即用模板:OnekeyAI多模态组学培训班,让你“填充数据”就能完成一篇SCI

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导语」

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一、参考文献
多模态数据集合

一、分子组学 (Multi-omics) 数据

这类数据在分子水平上描绘生命活动,是多模态组学的基石。

基因组学 (Genomics):研究生物体完整的DNA序列及基因结构、功能和进化。

转录组学 (Transcriptomics):研究特定状态下细胞内所有基因转录产物(mRNA)的种类和数量。

表观基因组学 (Epigenomics):研究不改变DNA序列的情况下,基因表达的可遗传变化(如DNA甲基化、组蛋白修饰)。

蛋白质组学 (Proteomics):研究细胞、组织或生物体中全部蛋白质的表达、结构、功能与相互作用。

代谢组学 (Metabolomics):研究生物体内所有小分子代谢物(如糖、脂类、氨基酸)的轮廓,是生理状态的直接反映。

微生物组学 (Microbiomics):研究人体内(如肠道、皮肤)共生的微生物群落的基因和代谢产物

二、医学影像数据

这类数据提供宏观的结构、功能或分子信息。在多模态组学中,最为核心的影像数据包括:

计算机断层扫描 (CT):提供高分辨率的人体断层解剖结构图像一般为dicom格式。

1CT平扫 (Non-contrast CT, NCCT)

2CT多期增强扫描 (Contrast-enhanced Multi-phase CT)

3动脉期 (Arterial Phase)

4门静脉期 / 静脉期 (Portal Venous Phase)

5延迟期 / 平衡期 (Delayed / Equilibrium Phase)

6CT血管成像 (CT Angiography, CTA)

7CT灌注成像 (CT Perfusion, CTP)

8CT尿路造影 (CT Urography, CTU)

正电子发射断层扫描 (PET):提供反映细胞代谢、受体分布等功能活动的图像一般为dicom格式。

超声 (Ultrasound):利用超声波进行实时动态的结构成像一般为JPGMP4格式。

1B型超声 / 二维超声 (B-mode / 2D Ultrasound)

2彩色多普勒超声 (Color Doppler)

3频谱多普勒超声 (Spectral Doppler)

4超声造影 (Contrast-Enhanced Ultrasound, CEUS)

5M型超声 (M-mode Ultrasound)

6三维 / 四维超声 (3D / 4D Ultrasound)

7弹性成像 (Elastography)

数字病理/组织学图像:对活检或手术切除的组织样本进行数字化扫描,可在细胞和组织水平提供信息一般为wsisvsndpimrxstif格式。

磁共振成像 (MRI):这是多模态组学中应用最广、序列最丰富的影像模态之一一般为Dicom格式

结构性MRI

1、T1加权成像 (T1WI, T1-weighted Imaging)

2T2加权成像 (T2WI, T2-weighted Imaging)

3质子密度加权成像 (PDWI, Proton Density Weighted Imaging)

4液体衰减反转恢复 (FLAIR, Fluid-Attenuated Inversion Recovery)

5磁敏感加权成像 (SWI, Susceptibility-Weighted Imaging)

功能性/代谢性MRI

1弥散加权成像 (DWI, Diffusion-Weighted Imaging) & ADC (Apparent Diffusion Coefficient)

2弥散张量成像 (DTI, Diffusion Tensor Imaging)

3灌注加权成像 (PWI, Perfusion-Weighted Imaging)

4血氧水平依赖功能成像 (BOLD-fMRI)

5磁共振波谱成像 (MRS, Magnetic Resonance Spectroscopy)

血管性MRI

1磁共振血管成像 (MRA, MR Angiography)

2磁共振静脉成像 (MRV, MR Venography)

3动脉自旋标记 (ASL, Arterial Spin Labeling)

三、临床与环境数据

此类数据是连接宏观临床表现与微观分子、影像特征的桥梁。

临床文本数据:包括结构化的检验数据(如血常规、尿常规)和非结构化的文本数据(如电子病历中的主诉、病史、病理报告)。

环境暴露数据:包括个体暴露于化学物质、空气污染等环境因素的数据

生理信号数据:如心电图、脑电图等反映机体生理状态的动态信号

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工具化科研--影像组学为例,三步跑i通
第一步:启动影像组学工具--点我运行
第二步:输入自己的数据存储位置
第三步:点击运行
然后:等着出图
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