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TBtools-II安装教程来了,基因分析从此不再难(附安装包)
前言
做生物信息学分析,手里有一款趁手的工具很重要。TBtools-II 是目前国内研究者用得比较多的一款综合性软件,功能覆盖序列处理、基因家族鉴定、可视化以及富集分析等多个方向,关键是上手门槛低。这篇 TBtools安装教程 以最新的 v2.390 版本为例,把下载和安装流程梳理清楚,跟着走一遍就能用起来。
安装前的注意事项
在正式开始 TBtools-II下载 与安装之前,有两件事需要提前了解:
• 部分杀毒软件可能会把安装包中的文件误判为风险项并将其删除,导致解压后文件夹里缺少文件。遇到这种情况,把杀毒软件临时关闭,重新解压一次即可。安装包已在实机上验证过,属于误报。 • 务必将压缩包解压到文件夹后再操作,直接在压缩包内运行容易引发各种安装异常。
本教程以 TBtools-II v2.390 版本为例进行说明,其他版本的安装方式基本一致。
TBtools-II 下载
TBtools安装教程 的第一步自然是从可靠的渠道获取安装包。目前最新的 TBtools-II v2.390 已上传至以下网盘,如果还没完成 TBtools-II下载 的话,可以直接保存使用:
https://pan.quark.cn/s/cd89e0ecbe3e
TBtools-II 安装步骤
以下是 TBtools-II 的完整安装流程,一共四步,按顺序操作即可。
1. 先在非系统盘(比如 D 盘或 G 盘)下面新建一个文件夹,命名为 TBtools,注意路径中不要出现中文字符。后续所有相关文件都放在这个目录里,方便统一管理,也便于日后查找。 
TBtools-II安装教程来了,基因分析从此不再难(附安装包) 2. 根据自己的操作系统选择对应的安装包格式:mac 用户选 dmg 后缀,Windows 用户选 exe 或 zip 均可。这里以 zip 格式为例,右键解压到当前文件夹。 
TBtools-II安装教程来了,基因分析从此不再难(附安装包) 3. 解压完成后,进入刚刚生成的文件夹,可以看到里面包含了程序运行所需的全部文件。 
TBtools-II安装教程来了,基因分析从此不再难(附安装包)

4. 找到文件夹中的 StartTBtools.bat 文件,双击运行,程序就会启动。首次启动稍等片刻,后续即可正常使用 TBtools-II 进行各类生物信息学分析,包括序列处理等常用操作。 
TBtools-II安装教程来了,基因分析从此不再难(附安装包)

TBtools-II v2.390基因富集分析功能详解与应用实战
很多研究人员在完成序列处理后,紧接着面临的问题是:这些差异基因到底参与了哪些生物学过程?TBtools-II v2.390 内置的基因富集分析模块恰好能解决这一需求。
在 TBtools-II v2.390 中,基因富集分析功能的入口位于主界面的 "GO & KEGG" 菜单下。使用前需要准备两个输入文件:一个是目标基因列表(通常是差异表达基因的 ID),另一个是背景基因集。TBtools-II v2.390 支持常见的基因 ID 格式,并且内置了多个模式物种的注释信息,省去了手动去公共数据库下载和整理的过程。
操作流程不复杂:导入基因列表后,选择对应物种和富集类型(GO 三大分类或 KEGG 通路),设定显著性阈值(一般取 p-value < 0.05),点击运行即可。TBtools-II v2.390 会自动输出富集分析的结果表格,同时生成气泡图和柱状图,可直接用于论文发表或学术汇报。对于需要批量处理多组基因集的场景,TBtools-II v2.390 也提供了批量分析模式,一次性提交多组数据,效率提升明显。
