夜雨聆风学习资料网

ARTICLE · 1219305

GenoCloud单细胞数据分析云平台源码出售

GenoCloud单细胞数据分析云平台源码出售

由于个人发展方向调整,现出售自主开发的单细胞在线数据分析平台源码。欢迎有相关业务需求的生信公司和开发者交流。接手方可在现有平台上继续接入分析工具,扩展功能并对外提供服务。

1.平台功能(目前主要实现了单细胞转录组):

  • 数据上传与管理:支持表达矩阵和SeuratRDS数据上传,以及项目、数据集管理。

  • 质量控制:Seurat基础质控、DoubletFinder双细胞检测、DecontX污染评估。

  • 数据预处理:Seurat预处理流程,包含PCA降维、聚类和批次整合。

  • 在线细胞注释:基因表达着色、Marker查看、多基因绘图、SingleR预测和手动注释。

  • 常用绘图:降维散点图、小提琴图、基因表达点图等,提供多种模板和可调整参数。

  • 下游分析:差异分析、基因集合打分、CellChat2细胞通讯、CytoTrace2分化潜能、Monocle2与Slingshot拟时序、CopyKAT拷贝数分析。

  • 富集分析:GO/KEGG富集分析、GSEA富集分析。

  • 账户与运营:用户注册、文件管理、调色板、积分管理,微信和支付宝充值。

2.平台特性

  • 计算资源按需申请,支持计算会话复用和空闲自动释放,减少资源闲置;可根据任务需求配置不同的计算规格。

  • 已有工具注册、参数表单和绘图模板配置机制。按平台接口规范封装分析程序后,可通过配置接入工具和模板。

  • 绘图支持缓存复用,减少调参重画时的重复加载,方便反复调整图形效果。

3.技术栈

  • 前端:Vue3、ElementPlus、TailwindCSS

  • 后端:Django、DjangoRESTFramework、Celery

  • 分析代码:R

  • 部署:阿里云(推荐)或本地

4.适合哪些团队

适合希望搭建自己的生信云平台,或在现有功能上继续接入分析工具的生信公司和开发团队。接手方需具备Python、Vue、R和容器部署维护能力,以便后续开发与运营。

5.交付内容:

  • 本次以平台源码出售为主。前后端源码、分析封装脚本等具体交付范围,将在交易前逐项确认。

  • 现有客户数据、云服务账号和支付账号不包含在交付范围内。

  • 第三方组件及数据库的使用遵循各自授权条款。

  • 可以部署协助,后续技术支持的范围另行约定。

6.以下为部分页面截图或结果图:

数据集管理页面:

常见降维图、基因表达点图、细胞比例图、小提琴图等:
monocle2拟时序图:
cellchat2细胞通讯图:
GSEA图:
GO/KEGG富集分析图:

如有意向,可以后台联系我。

相关学习资料