随着测序技术的白菜价，现在几乎每个医学课题都会搞点转录组或蛋白组测序。拿到公司发来的数据包后，想要把成千上万个基因的表达差异直观地展示出来，发高分文章， 火山图（Volcano Plot） 是绝对不可或缺的门面图表。很多同学一看到别人文章里红蓝交织的绝美火山图，第一反应就是：“这是用 R 语言画的吧？我不会写代码怎么办？”别慌！虽然 R 语言是生信作图的主力，但如果你的需求只是找差异基因并进行可视化， 我们完全可以用最熟悉的 GraphPad Prism 来“曲线救国”！ 今天，不敲一行代码，只需掌握一个 Excel 小技巧，带你轻松画出顶刊级别的火山图。01核心扫盲：看懂火山图的“横纵坐标”在动手作图前，我们必须搞懂火山图到底在展示什么数据：
X 轴：代表“变化的幅度”。 通常是 log2(FoldChange)，即差异倍数的对数。
数值越大，代表基因上调越猛（偏右侧）；数值越小，代表下调越猛（偏左侧）。
Y 轴：代表“统计学显著性”。 通常是 −log10(Pvalue)。
为什么要把 P 值取负对数？因为 P 值越小（越显著），取完负对数后数值反而 越大 。这样最显著的基因就会像火山喷发一样，高高地飘在图表的上方！💡 黄金阈值线： 我们通常将 P < 0.05 和 Fold Change > 2（或 < 0.5） 作为筛选标准。换算成坐标系里的数字，就是 Y 轴 > 1.3 ，以及 X 轴 > 1 或 < -1 。02避坑实操：Excel 里的“物理分身术”这是 Prism 画火山图最核心的秘密！由于早期的 Prism 没有直接根据条件改变散点颜色的功能，我们需要在 Excel 里提前把数据“分好类”。准备数据（公司通常会给你算好）确保你的 Excel 表格里有这两列关键数据： log2(FC) 和 -log10(P)。建立三个新的空白列在旁边新建三列，分别命名为： Up（上调） 、 Down（下调） 、 NS（无显著差异） 。利用 Excel 的 IF 函数（或筛选功能）对号入座我们要把 Y 轴原本一整列的数据，根据阈值拆分到这三个新列里，X 轴保持不动。
Up 列： 提取满足 X > 1 且 Y > 1.3 的数据，其余留空。
Down 列： 提取满足 X < -1 且 Y > 1.3 的数据，其余留空。
NS 列： 提取剩下的所有不满足条件的数据。
如果你不会写 IF 函数，直接用 Excel 的“数据筛选”功能，筛出上调基因，把 Y 轴数据复制到 Up 列；再筛出下调基因，把 Y 轴数据复制到 Down 列……没被筛中的就放进 NS 列！03Prism 一键出图与美化数据处理好后，剩下的就是 Prism 的拿手好戏了！录入数据打开 Prism，新建 📉XY 数据表。X 轴选Numbers，Y 轴选Enter and plot a single Y value for each point。将 Excel 里的数据原封不动地粘贴进来：A 列贴 X 轴数据，B、C、D 列分别贴刚才弄好的 Up、Down、NS 数据。生成散点图点击左侧Graphs，选择带有独立散点的XY scatter plot（不要选带连线的）。此时你会看到，图上自动生成了三种不同颜色的散点群体！注入灵魂（画出阈值参考线）火山图没有那三根虚线，就像吃饺子没蘸醋。双击任意坐标轴，打开Format Axes窗口。在右侧找到Additional ticks and grid lines（额外的刻度与网格线）。
夜雨聆风
