最新教程与工具列表-2026.03(PSMD上线)

1. 脑类淋巴分析  （你能找到的类目最全的）

1.1  DSI Studio分析DTI- ALPS教程和Excel模版：

查看介绍：DTI-ALPS分析视频教程。

更新了对齐 ACPC、以及标准空间分析的步骤，提供了参考 ROI。

1.2  FSL分析DTI-ALPS视频教程和代码:

和上面一样，不同的是使用FSL来分析，且提供全部代码，包含预处理哦。更新了标准空间分析的步骤，便于批量计算 ALPS指数，且提供了标准空间的参考 ROI。

1.2-1 DKI-ALPS分析教程和代码、计算模板

注意：作为1.2的后续分支教程，需配合1.1或者1.2一起购买，不单独出售，需要之前购买过1.1或1.2。

ALPS在DKI数据上的新指标，速度抢占先机！十月的更新说明（TrueNet，DKI-ALPS等）

1.3  Free-Water自由水分析工具（Windows下一键分析）：

单壳、多壳都能做！  点击查看介绍：自由水分析工具

批处理教程也写了：自由水校正工具的最简单的小白批量处理方法（高手忽略）

自由水校正程序更新v4

1.4  PVS脑血管周围间隙分析教程与工具（自动整理出PVS体积表格）：

这个现在分两个版本，一个（1.4-1）主要基于FSL的分割和配准，在标准空间完成分析，适合电脑配置普通的用户；另一个（1.4-2）是主要基于新版Freesurfer的分割，在个体空间完成所有分析，但是要求电脑内存至少32GB才能运行。

点击看介绍：视频教程：PVS计算的一种实现，     脑血管周围空间PVS分析浅谈。

更新了第3版分割程序，效果更准确，建议直接使用第3版。已经购买的建议全部更新（还是原先获得的那个链接，重新打开就能看到更新）。

1.5  脉络丛分割与体积计算工具

可批量自动分割脉络丛并汇总成表格，支持3D T1w，3D T2w， 2D FLAIR：脉络丛（Choroid Plexus）分割，新版本的介绍和使用方法参见这里的链接脉络丛分割更新说明。

更新了个体空间和标准空间下的脉络体积、区分左右侧的体积。

1.6  gBOLD-CSF耦合分析   

终于把这个教程弄好了，精心挑选最容易上手的工具，在FunSpace个体空间进⾏分析。仅需要有dpabi的基础经验就可上手。本教程包含3个配套matlab程序，1个预处理模板，小白也能轻轻松松完成分析，得到耦合指数和那些文献里都有的耦合曲线图等分析结果。这个教程重点是教会⼤家如何按步骤实操，如果想看原理知识介绍，可以看半年前的那个⽂章：【你们要的gBOLD-CSF耦合讲解来了】

4月份更新的功能支持自定义灰质Mask啦！

1.7  PVS-FW-WMH的白质Mask制作与配准教程

做完了自由水的分析，得到了自由水有关的各种参数图，例如FW，FW_FA等等。

• 接下来想要提取这些参数在白质内的平均信号，进行下一步的分析，发现没有白质Mask；

• 对于有些疾病，还需要排除白质内的PVS区域，于是又做了PVS分析，但是发现PVS Mask没法直接用到FW上；

• 对于有些疾病，还需要排除白质高信号区域WMH，于是又做了WMH分析，但是WMH Mask同样不在FW空间。

• 想要根据某个Atlas，分析特定脑区的均值信号，但是Atlas都在标准空间；

所以这个教程和配套程序就是用来创建白质Mask并配准到自由水空间。

注意，这个教程中提供的工具程序，自动化的批量操作目前支持的PVS数据是经过1.4-1版本的程序分析的结果。但是教程中教给大家的配准方法学会后，可以手动操作去适配到1.4-2版本的结果。

2. 脑网络分析

2.1  Intrinsic Connectivity Density （ICD）计算工具

你的同学还没用过，快占领先机：

ICD Toolbox使用教程，    指标介绍：Intrinsic Connectivity Density

2.2  DSI Studio预处理及基于AAL创建白质纤维连接矩阵教程

有详细的预处理步骤操作和讲解，纯图形界面操作，适合入门。

点击看介绍：教程：DSI Studio创建基于AAL的白质连接矩阵

2.3 DSI Studio白质纤维网络分析全流程批处理代码和教程手册

从导入到完成分析得到数据，整个流程都实现了批处理，适合了解了2.2基本操作步骤和常用参数知识的朋友，可以解放双手，安心上班。  十月的更新说明（TrueNet，DKI-ALPS等）

2.4  个体脑代谢网络分析工具IBCNT（100 元）

适用于核医学科的PET数据。点击右侧链接，查看介绍： 个体脑(代谢)网络计算app的安装和使用

2.5  结构-功能脑网络耦合分析工具和教程

从此结构-功能网络耦合分析不再难！一个教程加配套程序学会从全脑到网络到脑区三个层次的耦合指数分析。

本号的教程嘴大特点就是：一如既往的简单易用，且具备扩展性。新手小白也能做出来！

教程大纲如下：

当前是v1版，包含一个教程，5个配套程序，还贴心的准备好了常用的一些atlas，以及atlas对应的网络划分表。

不知道什么是结构-功能网络耦合的朋友可以移步这个链接了解一下👉脑网络的结构-功能耦合

比如像这样整理好的Network Gradient Scores表：

再比如组水平且对齐的Gradient Map：

包括Gradient Span表格：

还附送这种效果图的R示例代码：

3. 脑结构分割分析

3.1 白质高信号WMH分割视频教程与配套工具（基于LST）

不仅可以批量分割全脑的WMH，还可一键式批量自动分割室旁PVWMH并汇总成表格，推荐小白选择：白质高信号WMH分割方法

3.2 基于FSL的TrUE-Net模型进行WMH分割的视频教程和配套工具。

关于TrueNet的介绍可以先看看这个推送，适合了解FSL使用的朋友：MR图像白质高信号WMH分割三平面集成U-Net模型，以及这个： 十月的更新说明（TrueNet，DKI-ALPS等）

4.  脑形态学分析

4.1  CAT12一键统计分析视频教程与代码：

点击查看介绍：CAT12一键统计分析视频教程

4.1-1  CAT12做完SBM统计后提取表面差异区均值（300元）

点击查看详细介绍和购买方式：CAT12做完SBM统计后提取表面差异区均值

4.2  FreeSurfer提取指定atlas下的Sulc等表面指标并整理为表格（300元）

FreeSurfer对数据recon之后，有方便的命令提取thickness这样的指标，但是还有一些指标却没办法这样自动提取和整理，这个教程告诉你怎么办。包含了批处理代码，和使用的详细教程，可以指定分割（例如aparc.a2009s）、指定指标（例如sulc）、指定单个或一组被试，自动整理为每个被试每个脑区的均值表格，相当方便。

支持Ubuntu系统和MacOS的M架构芯片系列。

5. MRI分析小白10小时入门系列

这个系列主要包括三个主题的入门基础知识课程：

• 1到3课是基础概念：MRI基础之物理与技术，MRI常见的几种模态，实验范式与任务设计；

• 4到6课是fMRI的分析：dicom转nifti和dpabi-part1，dpabi-part2，dpabi-part3和restplus；

• 7到9课是dMRI的分析：VBM+FSL的DTI预处理与dtifit，TBSS完整流程，FSL中常见统计中的GLM设计。

对于影像专业以外的研究者，需要了解影像的基础概念，适合看1到3课。

对于不清楚功能磁共振数据的预处理和基础分析的研究者，适合看4到6课。

对于需要做弥散数据分析的研究者，适合选择7到9课。

这个小白入门系列视频教程也是作为本号出品的各类专题教程的基础课，讲解的知识相当于外面的磁共振基础培训班，内容只多不少。

例如，gBOLD～CSF教程需要的dpabi基础知识，可以在4到6课快速学会。

又如，自由水分析的教程，需要提前预处理好DWI数据，这就可以在7到9课快速学会。

详细的介绍点击下面的链接：

10小时脑影像分析小白入门，👈请点击左边的链接跳转过去查看详细介绍。

6.  DWI相关的白质与灰质微结构

6.1  NODDI指标计算及批处理工具教程

新开扩散数据DWI的大类别，首先放出来的就是这个NODDI（神经突方向分散和密度成像）是一种用于扩散 MRI 数据的微观结构建模方法。基于官方NODDI代码编写而成，集成批处理，基于matlab，跨平台支持，使用便捷，适合多核心的机器运行。

包含了NODDI官方包、依赖包、测试代码、批处理程序，更包括了测试数据，示例数据，以及完整的使用教程。用户无需敲命令，纯界面操作。

批量分析经过预处理的扩散数据，获得包括NDI，ODI和FWF在内的微结构指标图。

NODDI在临床研究中的应用

6.2  GBSS分析教程

算完了NODDI的各种指标之后，除了常规分析之外，你还可以进行灰质骨架分析，也就是GBSS分析。

GBSS的概念提出来是仿照了TBSS的思路：其基本思路是通过DTI-FA经过处理、变换后，⽣成标准空间的FA模板，并由此获得被称为⽩质⻣架的模板，从⽽可以进⼀步分析被试在⽩质⻣架上的改变。

所以，当NODDI指标图出现之后，研究者们很快想到，DWI数据不仅仅可以研究⽩质微结构，实际上，NODDI的系列指标针对的轴突、⾃由⽔等参数图和灰质的联系更加紧密。我们是不是可以利⽤这些NODDI指标来研究灰质上的变化呢？尤其是，在灰质⻣架上的变化。

如果需要了解什么是NODDI-GBSS，可以看看这些文献介绍：

帕金森病伴轻度认知障碍引发的是微观结构而非宏观结构的皮质退行病变

灰质微结构活体成像与精神疾病

教程图文并茂，提供配套程序，可能是目前最详细的分析步骤，不容错过。

本教程的价值就在于：

– 修正了原始程序的各种运⾏问题和兼容性问题，添加了少量参数；

– 提供了最详细的步骤、规范、解释，通过这个教程就能迅速上⼿。

6.3 上新！！！PSMD教程

这是教程目录：

PSMD（peak width of skeletonized mean diffusivity，⻣架化平均弥散峰宽）⽅法出⾃于这篇⽂献：

除了有官方提供的psmd程序以及它所对应的使用教程之外，我还重新写了⼀个优化之后的程序，叫做alpha_psmd，不仅兼容官⽅程序单个被试的处理，并且使⽤起来⾮常舒⼼。

主要改进：

– 不⽤运⾏⼀个被试⼿抄⼀个结果了，会⾃动存下来；

– 不⽤担⼼临时⽬录被覆盖，所有中间⽂件默认保留，且妥善安放在被试⽬录下；

– ⽀持批处理模式，⽀持单被试模式，且两种模式全都⽀持预处理、已经预处理、已经做完DTI FIT的情况；

– ⼀次算完左右脑和全脑的psmd和msmd，避免反复运⾏空耗时间；

– ⽀持从已有的TBSS结果直接计算psmd和msmd，极速⽣成结果表；

– 除此之外，我还更正了官⽅程序中预处理部分没有正确旋转bvec的问题。

欢迎大家选购。

7. 定量分析

7.1  上新！！！QSM一站式分析教程之Sepia

你能找到的最详细的QSM分析入门教程，图文并茂的教程写了长达33页，基本上是把QSM从DICOM到核团分析完整梳理了一遍，跟着走一遍，就能完成QSM分析，而且还增加了Sepia没有的自动提取整理核团信号成表格的功能。主要内容见目录截图：

详细介绍参见这个链接：QSM一站式分析教程之Sepia

8. 预留类别

9. 其它工具

9.1  横断面数据影像数据的同质化问题及ComBat方法（100元）

点击查看介绍和用法：  影像数据的同质化问题及ComBat方法

9.2 AlphaNI虚拟机镜像（300元）

配合任意一个教程购买，立减100：重要决定+重大优惠

当年累计购买3个教程，立即免费赠送。

点击查看介绍：  AlphaNI平台- v2401 ；

v2408版，包含：系统update包更新，FSL更新到最新版6.0.7.13，添加了TrUE-Net白质高信号模型。

v2410版，特别添加配置好了分析DKI-ALPS的工具包，便于直接使用相应教程。

v2601版，修正了累积的问题，打好了PVS新版需要的补丁，提供了更多便捷工具。详细更新介绍请参见：AlphaNI的小幅更新v2601

后续再视情况更新

说  明：

• 所有标注了价格的，按标注价格支付购买；
• 所有没有标注价格的，2026年继续按800元默认价格购买（本来计划今年调价的，算了，身在医疗都不容易，继续推迟调价。小小地希望有经费的朋友支持一下）；
• 可后台发送“付款码”关键词自动获取本人的付款码直接支付。
• 可后台发送“发票流程”关键词，了解提供发票的具体要求和详细步骤。

购买方法：

购买单个教程或者小工具，可直接通过赞赏进行付款（点每个文章最下面红色按钮的“喜欢作者”按钮，就是进行赞赏啦）。付款后告知需要哪个教程。例如购买IBCNT小工具，赞赏100元，然后留言通知我发送工具即可。

一次购买多个教程，可以直接扫码付款总金额，留言通知我对应哪几个教程，我会一一发送。由于购买多个教程通常对应一些优惠，所以也可以先联系我询问总价和优惠再扫码付款。

购买后除了获得教程和工具，还将同时得到为期一年的售后支持，在售后微信群中及时沟通和反馈使用问题（注意售后群用于解决学习教程中产生的疑问、遇到的安装和运行异常、反馈工具可能存在的错误并得到及时修复等等，售后群没有进行基础知识教学的责任，需要掌握最基础的入门知识才行。初学者如果遇到基础问题，请考虑购买10小时脑影像分析小白入门（9+X）），确保能够顺利完成分析。

新教程和工具如未在此列出，可能是列表还未更新，请直接留言询问请将您需要定制的分析流程或者工具与我联系洽谈。还有很重要的，假如你不知道怎么跟我联系，怎么不错过后台的消息，一定要点开下面这个链接看一下：     *如何与我联系