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Fiji软件的应用—免疫组化二 免疫组化定量分析-Color Deconvolution法

Fiji软件的应用—免疫组化二

免疫组化定量分析-Color Deconvolution

前期准备

在开始分析前,请备好以下材料,这是得到可靠实验数据的基础:

1. 待分析的免疫组化图片

2. 软件:免费开源的Fiji软件,可直接前往官网下载:https://imagej.net/software/fiji/downloads

详细操作步骤

1.导入图像:将图像文件直接拖入Fiji窗口或点击菜单栏File → Open → 选择图片

2.拆分通道:Image→ colorColour Deconvolution

选择H DAB,可拆分为3个图层,其中棕色图片为显色信号图,其他通道的图片不用关注;

保留并分析DAB棕色显色信号图层,将棕褐色信号转为光密度值(OD):Analyze→ Calibrate→ Uncalibrated OD

得到灰度值与OD值的转换函数曲线图后,直接叉掉图片即可。

3.设置阳性区域阈值

菜单栏点击:Image → Adjust → Threshold

拖动滑块调整阈值,使阳性区域红色覆盖准确,点击Apply

4.测量:点击AanalyzeMeasure

测量结果如下:

Area-面积:阈值区域覆盖的面积

Mean-均值:阈值区域平均OD

Min-最小值:阈值区域最小OD

Max-最大值:阈值区域最大OD

IntDen: 阈值区域总OD

RawIntDen:阈值区域总灰度值

5.菜单栏点保存数据

File → Save As,选择 Excel 格式保存结果表格用于后续统计分析与作图。

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