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安徽中医药“分子对接”模板思路简单易复现
安徽中医药“分子对接”模板思路简单易复现
这篇发表于《Phytomedicine》的研究系统探究了断血流总提取物(TEC) 通过调控 TLR4/SLC7A11 信号通路抑制子宫内膜上皮细胞(MEECs)铁死亡,从而改善脂多糖(LPS)诱导的子宫内膜炎的作用机制。
主要研究方法
1️⃣UHPLC‑HRMS化学成分鉴定
高分辨质谱正负离子模式,鉴定断血流总提取物9个主要活性成分,重点锁定橙皮苷、地奥明、异樱花素、槲皮素。
2️⃣转录组分析
小鼠子宫组织sham/模型/TEC 给药三组,DESeq筛选差异基因;GO/KEGG富集,重点关注铁死亡、谷胱甘肽代谢、Toll样受体信号通路。
3️⃣DIA‑label‑free定量蛋白质组
同样三组子宫组织,筛选差异蛋白;GO、KEGG富集,和转录组交叉印证铁死亡、TLR4相关通路变化。
4️⃣分子对接AutoDock Vina
获取TLR4、SLC7A11蛋白晶体;4种主要活性小分子做盲对接;结合自由能评估结合潜力,PLIP解析相互作用。
可复现部分
✅ 转录组学
✅ 蛋白质组学
✅ 分子对接
✅ 未来思路
进一步验证TEC中单组分(橙皮苷、地达明、槲皮素)的贡献与协同机制;
基因敲除/过表达验证 TLR4/SLC7A11 通路。
👆 以上可作为“天然产物多组学+铁死亡机制研究”类文章的主体模板。
🔎研究使用了UHPLC‑HRMS 成分鉴定、子宫组织转录组+DIA 定量蛋白组联合分析、分子对接模拟,结合LPS子宫内膜炎动物模型、原代上皮细胞、工具抑制剂回补;把铁死亡机制引入中药治疗子宫内膜炎研究;从物质基础‑多组学假说‑体内动物‑体外细胞工具药回补形成完整证据链,适合妇科中药铁死亡方向SCI复现。
(以上内容为个人思路分享,仅用于生信学习交流和科研思路梳理,不属于专业权威科普。)















































































